[发明专利]可裂解连接单元及其合成方法与用途有效

专利信息
申请号: 201110331659.1 申请日: 2011-10-27
公开(公告)号: CN102516208A 公开(公告)日: 2012-06-27
发明(设计)人: 沈玉梅;龚兵;黎庆;邵志峰;伍新燕;盛司潼;郭勋祥 申请(专利权)人: 上海交通大学;华东理工大学;深圳华因康基因科技有限公司
主分类号: C07D307/20 分类号: C07D307/20;C07D309/10;C08G65/00;C12Q1/68
代理公司: 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 代理人: 郭国中
地址: 200240 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 裂解 连接 单元 及其 合成 方法 用途
【权利要求书】:

1.一种可裂解连接单元,其特征在于,其结构式为:

其中,n为1或2,m为0~20中的任意一个整数,k为1~20中的任意一个整数。

2.一种根据权利要求1所述的可裂解连接单元在DNA合成测序中的用途,其特征在于,所述可裂解连接单元连接核苷酸和荧光素,用于DNA合成测序。

3.一种根据权利要求1所述的可裂解连接单元的合成方法,其特征在于,

当n = 1时,包括以下合成步骤:

a、T-1的合成:以L-谷氨酸为原料,加入盐酸,在冰浴搅拌下滴加亚硝酸钠溶液,滴加完毕后,继续在冰浴下反应3~5h,然后移至室温下过夜;反应结束后,减压蒸去水,加入乙酸乙酯溶解,过滤,滤液用无水硫酸钠干燥,过滤,旋干溶剂得T-1;

b、T-2的合成:取T-1,以无水四氢呋喃做溶剂,氮气保护,在冰水浴下缓慢滴加硼烷/二甲硫醚溶液,滴加完毕后,继续在室温下反应4~5h;反应结束后,加入甲醇淬灭反应,旋去溶剂,再加入甲醇,旋干得T-2;

c、T-3的合成:取T-2,以二氯甲烷做溶剂,加入咪唑,氮气保护下和二甲基叔丁基氯硅烷在室温下反应17~20h;反应结束后,加入二氯甲烷稀释,分别用2mol/L盐酸、水和饱和碳酸氢钠洗涤反应液,无水硫酸钠干燥,旋干,柱层析得T-3纯品;

d、T-4的合成:以二氯甲烷做溶剂,T-3在氮气保护及冰盐浴下和二异丁基氢化铝反应,TLC跟踪至反应完全. 反应结束后,加入0.2mol/L HCl淬灭反应,二氯甲烷萃取,有机相用饱和碳酸氢钠水溶液洗涤,无水硫酸钠干燥,旋转蒸发除去溶剂得T-4;

e、T-5的合成:以二氯甲烷做溶剂,T-4在氮气保护和冰盐浴下,加入三乙胺,然后和甲磺酰氯反应30~50min,在40~50℃回流3~5h,反应结束后,二氯甲烷稀释,水洗,无水硫酸钠干燥,旋干,柱层析得T-5;

f、T-6的合成:以二氯甲烷做溶剂,T-5在对甲苯磺酸吡啶盐作用下和原料A在室温下反应,TLC跟踪至反应完全,反应结束后,旋干溶剂,加入水,用乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤有机相,无水硫酸钠干燥,过滤,旋干,柱层析得到T-6纯品;所述原料A的结构式为:

,其中,m为0~20中的任意一个整数,k为1~20中的任意一个整数;

    g、T-7的合成:以四氢呋喃做溶剂,在四丁基氟化胺作用下,T-6在室温下脱羟基保护,TLC跟踪至反应完全,反应结束后,旋干溶剂,柱层析得到T-7;

    h、T-8的合成:把T-7溶于过量的氨水,室温下反应,TLC跟踪至反应完全,反应结束后,加乙醇,减压旋去溶剂,得T-8,T-8即所述可裂解连接单元;

当n = 2时,包括以下合成步骤:

    a、X-1的合成:以N,N-二甲基甲酰胺做溶剂,2-羟基-3,4-二氢吡喃在NaH的作用下,和氯化苄在室温下反应,TLC跟踪至反应完全,反应结束后,滴加水除去未反应的NaH,用乙酸乙酯萃取,有机相分别用水、饱和食盐水洗,无水硫酸钠干燥,减压旋去溶剂,柱层析得X-1;

b、X-2的合成:以二氯甲烷做为溶剂,把原料A溶于二氯甲烷,在对甲苯磺酸吡啶盐作用下,和X-1在室温下反应,TLC跟踪至反应完全,反应结束后,减压旋去溶剂,之后加入水,用乙酸乙酯萃取,有机相分别用水、饱和食盐水洗,无水硫酸钠干燥,减压旋去溶剂,柱层析得X-2;所述原料A的结构式为:

,其中,m为0~20中的任意一个整数,k为1~20中的任意一个整数;

    c、X-3的合成:以乙酸乙酯做溶剂,把X-2溶于乙酸乙酯,加入Pd/C并通入氢气,室温下反应,TLC跟踪至反应完全,反应结束后,过滤,减压旋去溶剂,得X-3;

d、X-4的合成:把X-3溶于过量的氨水,室温下反应,TLC跟踪至反应完全,反应结束后,加乙醇,减压旋去溶剂,得X-4,X-4即所述可裂解连接单元。

4.根据权利要求3所述的可裂解连接单元的合成方法,其特征在于,当n = 1时,步骤a中所述盐酸为6 mol/L,加入的所述L-谷氨酸、盐酸和亚硝酸钠的摩尔比为1:2~2.5:1.5~2。

5.根据权利要求3所述的可裂解连接单元的合成方法,其特征在于,当n = 1时,步骤b中加入的所述T-1和硼烷的摩尔比为1:1.1~1.5。

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