[发明专利]一种STK11基因突变检测特异性引物和液相芯片

说明书

技术领域

本发明属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种STK11基因突变检测特异性引物和液相芯片。

背景技术

目前，对STK11基因突变进行检测和分析的方法很少，主要有直接测序法和PCR-RFLP分析法，其中最常用的方法有PCR-RFLP分析法。PCR-RFLP法是基于基因突变造成的限制性内切酶识别位点的改变，如位点丢失或产生新位点，通过PCR扩增某一特定片段，再用限制性内切酶酶切扩增产物，电泳观察片段的大小，这种方法用于检测酶切位点改变的基因突变，可直接判断基因型，但该法不能用于没有产生新酶切位点的基因突变检测。再次，以上这些方法都存在着检测通量的局限性，每次只能检测一种突变类型，不能满足实际应用的需要。

发明内容

本发明的目的之一是提供STK11基因突变检测液相芯片。该液相芯片可用于单独或并行检测STK11基因十种常见基因型C109T、169delG、180delC、G196A、C508T、G511A、C842T、837delC、C910T和G996A的野生型和突变型。

实现上述目的的技术方案如下：

一种STK11基因突变检测液相芯片，包括有：

(A).针对STK11基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物：每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为：针对C109T位点的SEQ ID NO.21及SEQ ID NO.22；针对169delG位点的SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24；针对180delC位点的SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26；针对G196A位点的SEQID NO.27及SEQ ID NO.28；针对C508T位点的SEQ ID NO.29及SEQ ID NO.30；针对G511A位点的SEQ ID NO.31及SEQ ID NO.32；针对C842T位点的SEQ ID NO.33及SEQ ID NO.34；针对837delC位点的SEQ ID NO.35及SEQ ID NO.36；针对C910T位点的SEQ ID NO.37及SEQ IDNO.38；和/或针对G996A位点的SEQ ID NO.39及SEQ ID NO.40；所述tag序列选自SEQ IDNO.1～SEQ ID NO.20；

(B).有anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球，所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.41～SEQ ID NO.60，且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；

(C).用于扩增出需要检测的、具有相应突变位点的目标序列的引物。

优选地，所述扩增引物为针对C109T、169delG、180delC或G196A位点的SEQ ID NO.61及SEQ ID NO.62；针对C508T或G511A位点的SEQ ID NO.63及SEQ ID NO.64；针对C842T或837delC位点的SEQ ID NO.65及SEQ ID NO.66；针对C910T位点的SEQ ID NO.67及SEQID NO.68；和/或针对G996A位点的SEQ ID NO.69及SEQ ID NO.70。