[发明专利]一种STK11基因突变检测特异性引物和液相芯片有效
申请号: | 201110269826.4 | 申请日: | 2011-09-13 |
公开(公告)号: | CN102994623A | 公开(公告)日: | 2013-03-27 |
发明(设计)人: | 许嘉森;甘丹翠;邹凤文 | 申请(专利权)人: | 广州益善生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 万志香;曾旻辉 |
地址: | 510663 广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 stk11 基因突变 检测 特异性 引物 芯片 | ||
1.一种STK11基因突变检测液相芯片,其特征是,包括有:
(A).针对STK11基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物:每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成,所述特异性引物序列为:针对C109T位点的SEQ ID NO.21及SEQ ID NO.22;针对169delG位点的SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24;针对180delC位点的SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26;针对G196A位点的SEQID NO.27及SEQ ID NO.28;针对C508T位点的SEQ ID NO.29及SEQ ID NO.30;针对G511A位点的SEQ ID NO.31及SEQ ID NO.32;针对C842T位点的SEQ ID NO.33及SEQ ID NO.34;针对837delC位点的SEQ ID NO.35及SEQ ID NO.36;针对C910T位点的SEQ ID NO.37及SEQ IDNO.38;和/或针对G996A位点的SEQ ID NO.39及SEQ ID NO.40;所述tag序列选自SEQ IDNO.1~SEQ ID NO.20;
(B).有anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.41~SEQ ID NO.60,且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对;
(C).用于扩增出需要检测的、具有相应突变位点的目标序列的引物。
2.根据权利要求1所述的STK11基因突变检测液相芯片,其特征是,所述扩增引物为:针对C109T、169delG、180delC、G196A位点的SEQ ID NO.61及SEQ ID NO.62;针对C508T或G511A位点的SEQ ID NO.63及SEQ ID NO.64;针对C842T、837delC位点的SEQ ID NO.65及SEQ IDNO.66;针对C910T位点的SEQ ID NO.67及SEQ ID NO.68;和/或针对G996A位点的SEQ IDNO.69及SEQ ID NO.70。
3.根据权利要求1所述的STK11基因突变检测液相芯片,其特征是,所述ASPE引物为:针对C109T位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.21组成的序列以及由SEQ ID NO.2和SEQ IDNO.22组成的序列;针对169delG位点的由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.23组成的序列以及由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.24组成的序列;针对180delC位点的由SEQ ID NO.5和SEQ IDNO.25组成的序列以及由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.26组成的序列;针对G196A位点的由SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.27组成的序列以及由SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.28组成的序列;针对C508T位点的由SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.29组成的序列以及由SEQ ID NO.10和SEQID NO.30组成的序列;针对G511A位点的由SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.31组成的序列以及由SEQ ID NO.12和SEQ ID NO.32组成的序列;针对C842T位点的由SEQ ID NO.13和SEQ IDNO.33组成的序列以及由SEQ ID NO.14和SEQ ID NO.34组成的序列;针对837delC位点的由SEQ ID NO.15和SEQ ID NO.35组成的序列以及由SEQ ID NO.16和SEQ ID NO.36组成的序列;针对C910T位点的由SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.37组成的序列以及由SEQ ID NO.18和SEQ ID NO.38组成的序列;和/或针对G996A位点的由SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.39组成的序列以及由SEQ ID NO.20和SEQ ID NO.40组成的序列。
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