[发明专利]一种生物样本完备性的评价方法有效

专利信息
申请号: 201110247951.5 申请日: 2011-08-24
公开(公告)号: CN102289601A 公开(公告)日: 2011-12-21
发明(设计)人: 葛维挺;黄彦钦;郑树;周小宇 申请(专利权)人: 浙江大学
主分类号: G06F19/00 分类号: G06F19/00;G06F17/30
代理公司: 杭州求是专利事务所有限公司 33200 代理人: 张法高;赵杭丽
地址: 310027 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 生物 样本 完备 评价 方法
【权利要求书】:

1.一种生物样本完备性的评价方法,是在一个生物样本库系统中依次按照以下步骤实现的:

(1)在储存子系统中保存样本实物和样本资料,在存储子系统中列出样本库中所有待评价病例为集合P,统计病例总数为N,列出与样本实物相关的字段Wi为集合S,列出与样本资料相关的字段Wi为集合D,统计病例集合中所有包含字段Wi的病例总数,表示为df(Wi);

(2)在评分子系统中,针对集合S,计算字段Wi和病例p的相关性评分ScoreI(p,Wi),评分公式为:

ScoreI(p,Wi)=C(Wi,p)×log(N/df(Wi)+k)ΣWiS[C(Wi,p)×log(N/df(Wi)+k)]2,]]>

其中C(Wi,p)是字段Wi在病例p中出现的次数,

k是一个0.01到1之间的常数,

Wi∈S是与样本实物相关的集合S中的每个字段,

然后将集合S中的所有Wi的评分相加,得到病例p的实物评分ScoreS(p,S),评分公式为:

ScoreS(p,S)=ΣWiSScoreI(p,Wi);]]>

(3)在评分子系统中,针对集合D,计算字段Wi和病例p的相关性评分ScoreI(p,Wi),评分公式为:

ScoreI(p,Wi)=C(Wi,p)×log(N/df(Wi)+k)ΣWiD[C(Wi,p)×log(N/df(Wi)+k)]2,]]>

其中C(Wi,p)是字段Wi在病例p中出现的次数,

k是一个0.01到1之间的常数,

Wi∈D是与样本资料相关的集合D中的每个字段,

然后将集合D中的所有Wi的评分相加,得到病例p的实物评分ScoreD(p,D),评分公式为:

ScoreD(p,D)=ΣWiDScoreI(p,Wi);]]>

(4)在评分子系统中将病例p的实物评分和资料评分基于二次函数合并作为最终的完备性评分Value(p),计算公式为:

Value(p)=ScoreS(p,S)×ScoreD(p,D);

(5)在储存子系统中按完备性评分高低从小到大对病例排序,同一病例所属样本的完备性评分相同,用户输入关键词搜索样本,检索子系统对符合要求的样本按此顺序列出以供判断和选择。

2.根据权利要求1所述的一种生物样本完备性的评价方法,其特征在于,在进行步骤(1)前先列出停用病例集合nP和停用字段集合nW,这些集合中的病例和字段不用于后续计算。

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