[发明专利]水体环境中铜绿微囊藻噬藻体的SYBR-Green荧光定量RT-PCR检测方法无效
申请号: | 201110206427.3 | 申请日: | 2011-07-22 |
公开(公告)号: | CN102382901A | 公开(公告)日: | 2012-03-21 |
发明(设计)人: | 刘丽;刘腾腾;夏雪山;向安;冯悦;魏大巧 | 申请(专利权)人: | 昆明理工大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 650093 云*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 水体 环境 铜绿 微囊藻噬藻体 sybr green 荧光 定量 rt pcr 检测 方法 | ||
1.水体环境中铜绿微囊藻噬藻体的SYBR-Green荧光定量RT-PCR检测方法,包括下列步骤:
(1) 基于铜绿微囊藻噬藻体Ma-LMM01的g91基因片段,利用引物设计软件设计定量外参标准品引物SH-WF/ SH-WR和定量PCR引物SH-RTF/SH-RTR:
SH-WF:5’-CTACCAGTGGCCGATATTTCCTT-3’
SH-WR:5’-GGTAAAGCCTCTATTAGCAGTGTTG-3’
SH-RTF:5’-ACATCAGCGTTCGTTTCGG-3’
SH-RTR:5’-GTGACAATCTGGTTAGGTAGGTCG-3’;
(2) 提取待检水样浓缩液中噬藻体DNA基因片段;
(3) 用定量外参标准品引物SH-WF:5’-CTACCAGTGGCCGATATTTCCTT-3’和SH-WR5’-GGTAAAGCCTCTATTAGCAGTGTTG-3’扩增并构建铜绿微囊藻噬藻体g91基因定量检测的外参标准品,根据标准品Ct值,得到g91基因定量标准曲线;
(4) 用定量PCR引物SH-RTF:5’-ACATCAGCGTTCGTTTCGG-3’和
SH-RTR:5’-GTGACAATCTGGTTAGGTAGGTCG-3’扩增待测样品中铜绿微囊藻噬藻体g91基因序列,将所测样品的Ct值与g91基因定量标准曲线对比得到检测水样中噬藻体g91基因拷贝数量。
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