[发明专利]一种检测人结直肠癌BRAF基因突变的方法和试剂盒无效
申请号: | 201110001145.X | 申请日: | 2011-01-05 |
公开(公告)号: | CN102586401A | 公开(公告)日: | 2012-07-18 |
发明(设计)人: | 姬云;张泓;侯青 | 申请(专利权)人: | 苏州科贝生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
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地址: | 215123 江苏省苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 直肠癌 braf 基因突变 方法 试剂盒 | ||
1.一种检测人结直肠癌BRAF基因突变的试剂盒,其特征在于:所述的试剂盒包括用于对BRAF基因第15号外显子的密码子600进行基因分型的特异性探针,所述的特异性探针包含密码子600的核苷酸序列,所述BRAF基因第15号外显子具有SEQ ID No:1的连续核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的一种检测人结直肠癌BRAF基因突变的试剂盒,其特征在于:特异性探针为SEQ ID No.2。
3.根据权利要求1所述的一种检测人结直肠癌BRAF基因突变的试剂盒,其特征在于:特异性探针3’端经封闭处理、无法延伸。
4.根据权利要求1所述的检测人结直肠癌BRAF基因突变的试剂盒,其特征在于:试剂盒还包括PCR缓冲液、dNTP、DNA聚合酶、特异性引物对、SYTO 9荧光染料、水和野生型对照,其中特异性引物选自:
5.根据权利要求1所述的检测人结直肠癌BRAF基因突变的试剂盒,其特征在于:每20μl PCR反应体系终浓度组成为:2μl 10×PCR缓冲液、0.6-1.0μl氯化镁溶液、1.6μl dNTP、0.1-0.3μl Taq DNA聚合酶、100-200nM正向引物和20-40nM反向引物、100-200nM特异性探针,2-5μl SYTO 9荧光染料,其余为水。
6.一种检测人结直肠癌BRAF基因突变的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)按照常规方法采集待分析的基因组DNA;
2)对上述基因组DNA进行BRAF基因15号外显子的PCR扩增,再通过Cold-PCR富集扩增产物;反应完成后,将扩增产物再进行变性熔解;
3)根据高分辨率熔解曲线法对扩增后的BRAF基因进行突变位点检测。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:所述步骤2中PCR扩增的过程为95℃15分钟,95℃15秒,60℃15秒,72℃15秒,进行20个循环。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:所述步骤2中Cold-PCR富集过程为82℃15秒,60℃15秒,72℃15秒,进行15个循环;72℃2分钟;反应完成后,将扩增产物再进行变复性,90℃30秒,50℃1分钟。
9.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:步骤2中加入的DNA提取液的体积根据提取液中DNA浓度而调整,使加入的DNA量达到10ng。
10.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:步骤3中,P CR扩增产物样本在LightCycler 480仪中进行熔解曲线分析,仪器以0.2℃/s的速度从72℃升温到95℃,获得样品的熔解曲线。
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