[发明专利]高孵化率大口黑鲈亲本的分子标记筛选方法无效
| 申请号: | 201010243530.0 | 申请日: | 2010-08-03 |
| 公开(公告)号: | CN101921850A | 公开(公告)日: | 2010-12-22 |
| 发明(设计)人: | 白俊杰;韩林强;李胜杰;马冬梅;叶星;于凌云;全迎春;陈昆慈;谢骏 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院珠江水产研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/10 |
| 代理公司: | 广州市深研专利事务所 44229 | 代理人: | 陈雅平 |
| 地址: | 510380 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 孵化率 大口 亲本 分子 标记 筛选 方法 | ||
1.高孵化率大口黑鲈亲本的分子标记筛选方法,其特征是:
(一)引物的设计
根据大口黑鲈促生长激素释放激素(growth hormone releasing hormone, GHRH)基因启动子序列上一个66bp长度的隐性致死缺失突变位点侧冀序列,设计并合成引物如下:
P1:5’- CGGGCTGGTCTGTTAAATACAAGGT -3’,
P2:5’- AACACAAGAGCACATTGCTTCCTC -3’;
AA基因型个体预期扩增1条DNA带,大小308bp;AB基因型个体预期扩增2条DNA带,大小308bp和242 bp;
(二)模板DNA的提取
(1)取待检测亲鱼的鳍条组织3mg剪碎后,加入0.5mL的裂解液(10 mmol/L Tris-HCl;0.1 mol/L EDTA;0.5% SDS;30mg/L RNase;100mg/L 蛋白酶K,pH8.0),55℃消化1小时,其间不时轻轻摇动;
(2)加入等体积的酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),颠倒混匀,室温下静置5分钟后,12000转/分钟离心10分钟,取上清液,再用氯仿抽提一次,室温下静置5分钟后,12000转/分钟离心10分钟,取上清液;
(3)加入2倍体积的无水乙醇,室温静置10分钟沉淀DNA,12000转/分钟离心10分钟;
(4)用70%乙醇洗涤1次,12000转/分钟离心2分钟,吸去上清,室温静置干燥10分钟,加入50μl TE(10mmol/L Tris-HCl;1mmol/L EDTA,pH8.0)溶解DNA,4℃贮存备用;
(三)PCR反应体系
ddH2O 20μL
10×PCR Buffer 2.5μL
4×dNTP(10mmol/L) 0.5μL
Taq酶(5U/μL) 0.2μL
P1 (10μmol/L) 0.4μL
P2 (10μmol/L) 0.4μL
模板DNA 1.0μL
(四)PCR反应条件
94℃预变性3分钟;94℃变性30秒,60℃退火30秒,72℃延伸30秒,32个循环;72℃延伸7分钟;
(五)、琼脂糖凝胶电泳检测
PCR扩增产物在1%的琼脂糖凝胶(含荧光染料)中电泳,电压5V/cM,电泳结束后在紫外灯下观察并照相。
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