[发明专利]水稻稻米糊化温度调控基因分子标记及其应用有效
| 申请号: | 201010231187.8 | 申请日: | 2010-07-14 |
| 公开(公告)号: | CN101880722A | 公开(公告)日: | 2010-11-10 |
| 发明(设计)人: | 李家洋;顾铭洪;钱前;田志喜;刘巧泉;严长杰;刘贵富;王永红 | 申请(专利权)人: | 中国科学院遗传与发育生物学研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;任凤华 |
| 地址: | 100081 北京市朝阳*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 水稻 稻米 温度 调控 基因 分子 标记 及其 应用 | ||
1.辅助鉴别具有不同稻米糊化温度的水稻的方法,包括如下步骤(1):
(1)以待测水稻的基因组DNA为模板,用SSII-3M1引物对进行PCR扩增;如果得到90bp的DNA片段,待测水稻的基因型为I型;如果得到81bp的DNA片段,待测水稻的基因型为II型;基因型为II型的水稻的碱消值低于基因型为I型的水稻的碱消值;所述SSII-3M1引物对由序列表的序列1所示DNA和序列表的序列2所示DNA组成。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于:所述方法在进行完所述步骤(1)后,还进行如下步骤(2),在进行完所述步骤(2)后还进行如下步骤(3)或步骤(4):
(2)以基因型为I型水稻的基因组DNA为模板,用SSII-3M2引物对进行PCR扩增,然后用限制性内切酶Ban II酶切PCR扩增产物;如果得到283bp的DNA片段,待测水稻的基因型为I-a型;如果得到326bp的DNA片段,待测水稻的基因型为I-b型;所述SSII-3M2引物对由序列表的序列3所示DNA和序列表的序列4所示DNA组成;
(3)以基因型为I-a型水稻的基因组DNA为模板,用WxM1引物对进行PCR扩增;如果得到252bp的DNA片段,待测水稻的基因型为i型;如果得到275bp的DNA片段,待测水稻的基因型为ii型;基因型为ii型的水稻的碱消值低于基因型为i型的水稻的碱消值;所述WxM1引物对由序列表的序列5所示DNA和序列表的序列6所示DNA组成;
(4)以基因型为I-b型水稻的基因组DNA为模板,用WxM1引物对进行PCR扩增;如果得到252bp的DNA片段,待测水稻的基因型为i型;如果得到275bp的DNA片段,待测水稻的基因型为ii型;基因型为ii型的水稻的碱消值低于基因型为i型的水稻的碱消值;所述WxM1引物对由序列表的序列5所示DNA和序列表的序列6所示DNA组成。
3.专用引物,包括SSII-3M1引物对;所述SSII-3M1引物对由序列表的序列1所示DNA和序列表的序列2所示DNA组成。
4.如权利要求3所述的专用引物,其特征在于:所述专用引物还包括SSII-3M2引物对和WxM1引物对;所述SSII-3M2引物对由序列表的序列3所示DNA和序列表的序列4所示DNA组成;所述WxM1引物对由序列表的序列5所示DNA和序列表的序列6所示DNA组成。
5.如权利要求4所述的专用引物,其特征在于:所述专用引物由所述SSII-3M1引物对、所述SSII-3M2引物对和所述WxM1引物对组成。
6.权利要求3至5中任一所述专用引物在辅助鉴别具有不同稻米糊化温度的水稻中的应用。
7.权利要求3至5中任一所述专用引物在制备辅助鉴别具有不同稻米糊化温度的水稻的试剂盒中的应用。
8.权利要求3至5中任一所述专用引物在辅助鉴定水稻的稻米糊化温度中的应用。
9.权利要求1或2所述方法在水稻育种中的应用。
10.权利要求3至5中任一所述专用引物在水稻育种中的应用。
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