[发明专利]核酸模板的分类在审

专利信息
申请号: 200980156796.7 申请日: 2009-12-10
公开(公告)号: CN102317473A 公开(公告)日: 2012-01-11
发明(设计)人: B·弗卢斯贝格;S·特纳;J·李;贾磊;J·科拉奇;J·索伦森;D·韦伯斯特;J·莱尔;K·特拉弗斯;J·哈尼斯 申请(专利权)人: 加利福尼亚太平洋生物科学股份有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/10
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 31100 代理人: 余颖
地址: 美国加利*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 核酸 模板 分类
【说明书】:

相关专利申请的交叉引用

本申请请求2008年12月11日提交的美国专利申请号61/201,551,2009年5月21日提交的美国临时专利申请号61/180,350和2009年6月12日提交的美国临时专利申请号61/186,661的优先权,他们的全部内容通过引用纳入本文用于所有目的。

发明背景

开发各种所需应用的生物学过程分析试验。例如对关键生物学通路活性的监测可导致更好地了解这些系统的功能以及可能破坏这些系统正常功能的因素。事实上,由于特定生物学通路的运行或中断所引起的各种疾病是许多医学研究的焦点。通过对这些通路的了解,人们就可模拟出影响它们的方法来预防疾病发生或在其有所表现时减轻症状。

开发生物学过程监测方法的一个老套例子存在于药学研究和开发领域。具体说,为促进分析,常常在体外系统中重现或模拟这些通路中与治疗有关的生物学通路,或其中的各步骤或各步骤的某些亚组。通过观察存在和没有潜在治疗组合物,如药物组合物或其他物质时,这些步骤或整个通路的进程,人们可以鉴定这些组合物影响体外系统,和可能有益地影响正有通路在以有害方式发挥作用的生物体的能力。具体的例子有,甲基转移酶对胞嘧啶5’位点的可逆甲基化是最为广泛研究的外遗传修饰之一。在哺乳动物中,5-甲基胞嘧啶(5-MeC)常见于CpG二核苷酸,后者常簇集存在于转录起始位点处或其附近被称为CpG岛的区域内。CpG岛区内胞嘧啶的甲基化可干扰转录因子结合,并与转录抑制基因调节相关。此外,已知DNA甲基化是哺乳动物发育所必需,并且与癌症和其他疾病过程相关。近来,在大脑的某些类型细胞中鉴定到新的5-羟甲基胞嘧啶外遗传标志,提示其在神经元功能的外遗传控制中具有作用(S.Kriaucionis等,Science 2009,324(5929):929-30,其全文通过引用纳入本文用于所有目的)。本技术领域的以下文献提供了关于胞嘧啶甲基化及其对基因调控、发育及疾病过程影响的进一步信息:A.Bird,Genes Dev 2002,16,6;M.Gardiner-Garden等,J Mol Biol 1987,196,261;S.Saxonov等,Proc Natl Acad Sci U S A 2006,103,1412;R.Jaenisch等,Nat Genet 2003,33增刊,245;E.Li等,Cell 1992,69,915;A.Razin等,Hum Mol Genet 1995,4特刊,1751;P.A.Jones等,Nat Rev Genet 2002,3,415;P.A.Jones等,Nat Genet 1999,21,163和K.D.Robertson,Nat Rev Genet 2005,6,597,所有这些的全文通过引用纳入本文用于所有目的。

人类基因甲基化绘图是比确定人类基因组更复杂的任务,因为甲基化状态在组织类型之间不同,随年龄变化,使甲基化状态有所不同,并被环境因素该变(P.A.Jones等,Cancer Res 2005,65,11241,其全文通过引用纳入本文用于所有目的)。因为现有的DNA测序技术对样品制备的要求和短读取长度的特点,全面、高分辨率地分析给定样品的全基因组甲基化模式是很有难度的(K.R.Pomraning等,Methods 2009,47,142,其全文通过引用纳入本文用于所有目的)。

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