[发明专利]检测铜绿假单胞菌重要耐药基因的基因芯片及其试剂盒

权利要求书

1.一种用于检测铜绿假单胞菌重要耐药基因的基因芯片，包括固相载体和固定在该固相载体上的寡聚核苷酸探针，其特征在于该寡聚核苷酸探针包含下述DNA片段中的至少一种：

1)从carb、tem、imp、oxa groupI、oxa groupII、aac(3’)-I、aac(3’)-II、aac(6’)-Ib、aac(6’)-II、aadB基因和细菌16S rRNA基因中所选取的至少一种DNA片段；

2)从上述1)中选取的至少一种DNA片段的互补DNA片段。

2.根据权利要求1所述的基因芯片，其特征在于所述寡核苷酸探针具有SEQ ID NO：1-SEQ ID NO：29所示的核苷酸序列，或不同于SEQ IDNO：1-SEQ ID NO：29所示的核苷酸序列但编码的氨基酸序列与SEQ IDNO：1-SEQ ID NO：29所示核苷酸序列所编码的氨基酸序列相同的序列。

3.权利要求1或2所述的基因芯片用于铜绿假单胞菌耐药基因carb、tem、，imp、oxa groupI、oxa groupII、aadB、aac(3’)-I、aac(3’)-II、aac(6’)-Ib、aac(6’)-II中至少一种的检测。

4.使用权利要求1所述的基因芯片检测耐药基因的方法，其特征在于包含步骤：

1)根据铜绿假单胞菌的耐药基因设计并制备出用于PCR扩增的引物；

2)制备待测样品的基因组DNA，使用步骤1)中的引物，按一定浓度混合，对待测样品基因组DNA进行PCR扩增并纯化PCR产物，制得靶序列；

3)标记步骤2)中得到的靶序列；

4)将步骤3)标记后的靶序列与权利要求1所述的基因芯片杂交；

5)用生物芯片扫描仪获取杂交信号并分析杂交结果。

5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于所述步骤1)中使用的PCR引物为SEQ ID NO：30-SEQ ID NO：51所示核苷酸序列中的至少一种。

6.一种检测铜绿假单胞菌耐药基因的试剂盒，其特征在于包含权利要求1所述的基因芯片。

7.根据权利要求6所述的试剂盒，其特征在于还包含SEQ IDNO：1-SEQ ID NO：29所示核苷酸序列或其互补核苷酸序列的探针序列中的至少一种。

8.根据权利要求6或7所述的试剂盒，其特征在于还包含SEQ IDNO：30-SEQ ID NO：51所示核苷酸序列的PCR引物。

9.根据权利要求6所述的试剂盒，其特征在于还包含杂交盒、杂交液。

10.权利要求6所述的试剂盒用于铜绿假单胞菌耐药基因carb，tem，imp，oxa groupI，oxa groupII，aac(6’)-Ib，aac(6’)-II，aac(3’)-I，aac(3’)-II，aadB中至少一种的检测。