[发明专利]牛分支杆菌免疫原性分泌型蛋白的筛选鉴定方法无效
申请号: | 200810038201.5 | 申请日: | 2008-05-29 |
公开(公告)号: | CN101280335A | 公开(公告)日: | 2008-10-08 |
发明(设计)人: | 朱建国;严懿嘉;华修国;姜毅;刘芳 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12Q1/02 | 分类号: | C12Q1/02;C12Q1/68;G01N33/68;G01N33/558 |
代理公司: | 上海交达专利事务所 | 代理人: | 毛翠莹 |
地址: | 200240*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分支 杆菌 免疫原性 分泌 蛋白 筛选 鉴定 方法 | ||
1、一种牛分支杆菌免疫原性分泌型蛋白的筛选鉴定方法,其特征在于包括如下步骤:
1)对基因库中牛分支杆菌基因组的蛋白编码基因进行序列分析,根据信号肽序列特征、信号肽位置及切割位点,将mean S-score大于0.5的蛋白从蛋白质组中区分出来,预测为存在信号肽的蛋白,其中包含分泌蛋白及可能被错误预测为分泌蛋白的膜蛋白;
2)从已筛选出的蛋白中寻找疏水跨膜螺旋,有跨膜疏水区的蛋白是膜蛋白,予以排除,得到分泌蛋白;
3)对得到的分泌蛋白进行同源性分析,将与禽分支杆菌同源性小于36%的牛分支杆菌蛋白筛选出来,作为候选蛋白;
4)对候选蛋白编码基因进行引物设计,以牛分支杆菌基因组DNA为模板,对候选蛋白基因进行PCR扩增,将扩增产物进行1%琼脂糖凝胶电泳分析,并进行纯化、回收,得到目的片断;用限制性内切酶对目的片断和原核表达载体进行双酶切,酶切完毕后,将酶切产物进行1%琼脂糖凝胶电泳,然后回收酶切片断;
5)将酶切片断和原核表达载体进行连接,构建重组质粒;将重组质粒转化至E.coli BL21感受态细胞中,过夜培养,挑取单菌落,接种于含抗生素的培养液,37℃过夜;用PCR对菌落进行扩增,对扩增所得产物进行DNA测序鉴定,确认重组质粒构建正确;
6)将构建正确的重组质粒进行诱导表达,每隔两小时取一次表达后的菌液,经离心,煮沸,进行12%SDS-PAGE分析,按分子克隆方法,电转至硝酸纤维膜上进行免疫染色,经小牛血清白蛋白封闭后,依次加入兔抗牛分支杆菌阳性血清的稀释液、辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔的抗体的稀释液,最后在3,3-二氨基联苯胺溶液中显色,出现与预计蛋白分子量一致的蛋白条带,即为牛分支杆菌具有免疫原性的分泌蛋白。
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