[发明专利]可用于评估干扰素疗效的多态标记无效
申请号: | 200710193977.X | 申请日: | 2002-09-20 |
公开(公告)号: | CN101182587A | 公开(公告)日: | 2008-05-21 |
发明(设计)人: | 松山德子;杉本正信;桥本美智惠;三代俊治 | 申请(专利权)人: | 株式会社东芝 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G06F19/00 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 | 代理人: | 陈轶兰 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 评估 干扰素 疗效 标记 | ||
1.在将用干扰素治疗的个体中估计干扰素疗效的方法,包括:
(1)确定来自所述个体的样本中干扰素受体基因的基因型;和
(2)根据所述干扰素受体基因的基因型估计干扰素的疗效。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述的干扰素受体是干扰素α受体或干扰素β受体。
3.根据权利要求1所述的方法,其中所述在(1)中的确定包括确定干扰素受体基因启动子中的GT重复数目。
4.根据权利要求1所述的方法,其中所述的个体感染了丙型肝炎病毒。
5.根据权利要求3所述的方法,其中所述的个体感染了丙型肝炎病毒。
6.根据权利要求3所述的方法,其中在所述个体中至少一个等位基因上存在至少5个GT重复表示干扰素治疗会有效。
7.根据权利要求6所述的方法,其中所述个体在两个等位基因上均具有至少5个GT重复。
8.根据权利要求6所述的方法,其中所述个体在一个等位基因上具有至少5个重复并在第二个等位基因上具有至少14个重复。
9.根据权利要求1所述的方法,其中所述在(1)中的确定包括将来自所述个体的基因组DNA样本与包含选自SEQ ID NO:1,SEQ ID NO:2,SEQ ID NO:3,SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:5,SEQ ID NO:6,SEQ ID NO:7,SEQ ID NO:8,SEQ ID NO:9,SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:11,SEQID NO:12及其互补多核苷酸的多核苷酸的8到500个连续核苷酸的探针杂交。
10.根据权利要求1所述的方法,其中所述的(1)中的确定包括将从所述个体得到的基因组DNA的样本与选自SEQ ID NO:19,SEQ ID NO:20,SEQ ID NO:21,SEQ ID NO:22,SEQ ID NO:23及其互补多核苷酸的多核苷酸杂交。
11.根据权利要求1所述的方法,其中所述的(1)中的确定包括扩增干扰素受体基因的一个区域,其中所述的区域含有足够数目的核苷酸以确定所述干扰素受体基因的基因型。
12.根据权利要求9所述的方法,其中所述的探针固定在核酸芯片上。
13.根据权利要求10所述的方法,其中所述的探针固定在核酸芯片上。
14.估计将用干扰素治疗的个体中干扰素疗效的方法,包括:
(1)用数据记录装置记录来自所述个体的样本中干扰素受体基因的基因型;
(2)比较(1)中的基因型与存储在计算机中的矩阵,其中所述矩阵将干扰素疗效与所述干扰素受体的基因型相关联;和
(3)根据所述干扰素受体基因的基因型估计干扰素的疗效。
15.根据权利要求14所述的方法,其中所述的(3)中的估计包括输出(2)中比较的结果。
16.根据权利要求14所述的方法,其中在(1)中的记录包括将基因型输入计算机,用于(2)中的比较。
17.根据权利要求15所述的方法,其中所述的输出包括在计算机屏幕上显示结果。
18.根据权利要求15所述的方法,其中所述的输出包括打印结果。
19.根据权利要求13所述的方法,其中所述的干扰素受体是干扰素α受体或干扰素β受体。
20.根据权利要求13所述的方法,其中所述的在(2)中的比较包括将干扰素受体基因启动子中的GT重复数目与所述矩阵作比较。
21.根据权利要求13所述的方法,其中所述的个体感染了丙型肝炎病毒。
22.根据权利要求20所述的方法,其中在所述个体中的至少一个等位基因上存在至少5个GT重复表示干扰素治疗会有效。
23.根据权利要求22所述的方法,其中所述个体在两个等位基因上均有至少5个GT重复。
24.根据权利要求22所述的方法,其中所述个体在一个等位基因上有至少5个重复,在第二个等位基因上有至少14个重复。
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