[发明专利]一种DNA的荧光检测方法及其试剂盒有效
申请号: | 200710048129.X | 申请日: | 2007-11-13 |
公开(公告)号: | CN101240329A | 公开(公告)日: | 2008-08-13 |
发明(设计)人: | 宋世平;刘兴奋;李江;王丽华;樊春海 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海应用物理研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 上海智信专利代理有限公司 | 代理人: | 薛琦 |
地址: | 201800上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 dna 荧光 检测 方法 及其 试剂盒 | ||
技术领域
本发明涉及生物技术领域,特别涉及一种DNA的荧光检测方法及其试剂盒。
背景技术
基因(DNA或RNA)是遗传信息的载体,在生物的个体生长、发育、繁殖、遗传和变异等生命过程中起着极为重要的作用。基因检测在临床诊断、单核苷酸多态性分析、基因测序、环境分析、反控等领域具有重要的意义。随着人们对自身健康的日益关注,对肿瘤、癌症等重大疾病早期诊断技术的要求也越来越高,因此迫切需要发展高灵敏度的基因检测技术。基因突变是单核苷酸多态性的形式之一,与多种疾病的发生有着密切的关系,最新研究表明,有四百多种疾病的发生与基因突变有关。为了在发病早期就能检测到极微量致病基因的存在,常常需要对待测基因进行PCR扩增或采用其它形式的信号放大方法,如纳米金放大、共轭高分子放大、酶联放大等(L.Pang,J.Li,J.Jiang,G.Shen,R.Yu,Anal. Biochem.2006,358,99;D.Q.Tang,D.J.Zhang,D.Y.Tang,H.Ai,J.Immunol.Methods 2006,316,144;X.Yao,X.Li,F.Toledo,C.Zurita-Lopez,M.Gutova,J.Momand,F.Zhou,Anal.Biochem.2006,354,220)。
本申请人公开号为CN1808101A的专利申请中公开了一种DNA的荧光检测方法及其试剂盒,该检测方法包括:利用连接于磁性颗粒上的捕获探针将待检DNA从生物样品中进行磁性富集和分离;然后加入荧光基团(FAM)标记的信号探针,使磁性分离和富集后的待检DNA与信号探针杂交配对,并用低盐缓冲液洗涤;再加入水溶性导电高分子材料,即共轭高分子(如聚芴衍生物PF)实现信号倍增,用该导电高分子材料的激发波长作荧光光谱,利用荧光共振能量转移(FRET)检测方法检测分析出待检DNA。该方法具有较高的特异度和敏感度。但是,一方面低盐洗涤的过程会增加操作的步骤,延长反应和检测时间;另一方面,低盐溶液也会使完全互补的双链DNA部分解链,从而使互补与突变的可区分性减小,即会降低对突变的选择性。
发明内容
本发明要解决的技术问题是提供一种选择性更佳的DNA的荧光检测方法,而且该方法灵敏度高,无需扩增,操作快速简便,综合性能高。
本发明要解决的另一个技术问题是提供一种采用上述DNA的检测方法的试剂盒。
本发明人在上述CN1808101A公开的技术方案基础上,经过进一步的研究,发现采用竞争机制,磁性颗粒对靶向DNA的富集、分离,以及水溶性共轭高分子与荧光基团之间的FRET技术相结合,可以大大提高DNA检测的特异度和灵敏度,缩短了反应时间,综合性能更佳,特别可用于基因及突变基因的检测,更有希望应用于一些与基因突变有关的病症,如肿瘤的诊断。其中,竞争机制是生物检测中经常采用的一种用于提高选择性的检测方法,如ELISA竞争法和竞争性PCR等。在基因(DNA)检测中,也常采用这种方法。与线性DNA分子相比,茎环结构DNA探针由于可以形成特定的茎环结构,与其互补的靶向DNA结合时具有更窄的融解温度范围和更高的选择性(G.Bonnet,S.Tyagi,A.Libchaber,F.Kramer,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.1999,96,6171),常用于单碱基错配的检测。因此,茎环结构竞争探针的引入将会进一步提高DNA生物传感器的综合性能。
因此,本发明解决上述第一个技术问题所采用的技术方案是:一种DNA的荧光检测方法,包括以下步骤:
1)将捕获探针连接在磁性颗粒表面;
2)加入待测的靶向DNA和荧光素修饰的信号探针,该捕获探针能与靶向DNA的一段核苷酸序列杂交,该信号探针能与靶向DNA的另一段核苷酸序列杂交,通过DNA之间的杂交,形成磁性颗粒-靶向DNA-荧光素修饰的信号探针的三明治夹心结构;
3)最后除去游离的荧光素修饰的信号探针后,加入具有信号倍增功能的水溶性的共轭高分子,对该信号探针上的荧光信号进行放大检测,从而检测出靶向DNA;
其中,步骤2)在杂交时还加入上述捕获探针或信号探针的竞争性探针,与靶向DNA竞争结合。
优选的,所述的捕获探针可以是茎环结构的DNA探针,同时所述的信号探针是线性DNA探针,所述的竞争性探针无任何修饰,其序列组成与捕获探针仅相差一个碱基。
优选的,所述的捕获探针可以是线性DNA探针,同时所述的信号探针是茎环结构的DNA探针,所述的竞争性探针无任何修饰,其序列组成与信号探针仅相差一个碱基。
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