[发明专利]检测尿液中病毒特异性核酸的组合物和方法

权利要求书

1.选自SEQ ID NOs:1和2、SEQ ID NOs:3和4、SEQ ID NOs:5 和6、SEQ ID NOs:5和7、SEQ ID NOs:5和8、SEQ ID NOs:9和10， 或SEQ ID NOs:11和10的引物对在制备用于诊断个体中的病毒感染的 药物中的用途，其中所述诊断包括：

a)从个体获得尿样；

b)从所述尿样分离可溶性部分；和

c)检测所述尿样的所述可溶性部分中跨肾病毒核酸的存在，其中所 述核酸长度小于300bp，其中所述检测包括选自PCR、巢式PCR、半 巢式PCR、LCR和SDA的方法，所述方法采用选自SEQ ID NOs:1和 2、SEQ ID NOs:3和4、SEQ ID NOs:5和6、SEQ ID NOs:5和7、SEQ  ID NOs:5和8、SEQ ID NOs:9和10，或SEQ ID NOs:11和10的引物 对，其中所述核酸的存在表明病毒感染。

2.根据权利要求1的用途，其中所述跨肾病毒核酸是DNA。

3.根据权利要求1的用途，其中所述诊断进一步包括定量所述跨 肾病毒核酸的步骤。

4.根据权利要求1的用途，其中所述分离步骤是通过选自所述尿 样的过滤和离心的方法进行的。

5.根据权利要求1的用途，其中所述跨肾病毒核酸包括DNA片 段，且所述片段的长度为100至200bp。

6.根据权利要求1的用途，其中所述诊断进一步包括分离或纯化 所述跨肾病毒核酸的步骤。

7.根据权利要求6的用途，其中通过化学或物理方法来进行所述 纯化。

8.根据权利要求6的用途，其中所述分离或纯化使用选自以下的 方法进行：有机溶剂提取、过滤、沉淀、具有核酸亲和性的固体基质 吸附和色谱。

9.根据权利要求8的用途，其中所述固体基质由基于二氧化硅的 树脂、离子交换树脂或羟磷灰石构成。

10.根据权利要求9的用途，其中所述固体基质是基于二氧化硅的 树脂，且所述分离或纯化在离液剂的存在下进行。

11.根据权利要求1的用途，其中所述诊断进一步包括添加DNase 或RNase抑制剂来预处理尿样。

12.根据权利要求11的用途，其中所述抑制剂选自离子螯合剂、 变性剂和离子去污剂。

13.根据权利要求12的用途，其中所述离子螯合剂是EDTA；所 述变性剂是盐酸胍或异硫氰酸胍；并且所述离子去污剂是N-月桂酰肌 氨酸或十二烷基硫酸钠。

14.根据权利要求1的用途，其中所述病毒是HIV-1。

15.选自SEQ ID NOs:1和2、SEQ ID NOs:3和4、SEQ ID NOs:5 和6、SEQ ID NOs:5和7、SEQ ID NOs:5和8、SEQ ID NOs:9和10， 或SEQ ID NOs:11和10的引物对在制备用于监控个体中病毒感染的药 物中的用途，其中所述监控包括：

a)在不同的时间从个体获得第一次尿样和第二次尿样；

b)分离所述尿样的可溶性部分；

c)检测所述尿样的所述可溶性部分中跨肾病毒核酸的存在，其中所 述核酸长度小于300bp，其中所述检测包括选自PCR、巢式PCR、半 巢式PCR、LCR和SDA的方法，所述方法采用选自SEQ ID NOs:1和 2、SEQ ID NOs:3和4、SEQ ID NOs:5和6、SEQ ID NOs:5和7、SEQ  ID NOs:5和8、SEQ ID NOs:9和10，或SEQ ID NOs:11和10的引物 对，其中所述核酸的存在表明病毒感染；和

d)定量所述第一次和第二次尿样中的所述核酸，并且监控所述核酸 的量的改变。

16.根据权利要求15的用途，其中所述诊断进一步包括将降低或 抑制所述病毒感染的化合物给药于所述个体的步骤。