[发明专利]一种基于转座子的新型遗传标记

权利要求书

1.一种检测目的核酸序列的多态性的方法，该方法包括下述步骤：

a)用一对引物扩增该目的核酸序列，其中第一引物与微型反向重复可转座元件(MITE)，其片段或其衍生物同源，该第一引物可与所述目的核酸序列中的MITE退火，第二引物可与第一引物相同或不同，并可与MITE序列同源或不同源；

b)分离步骤a)中扩增的目的核酸序列的片段；

c)分析步骤b)中所获片段与对照片段的关系，所述对照片段是用至少一个用于测定步骤b)中所获片段与对照片段之间核酸序列差异的引物扩增核酸序列得到的，所述差异即表示所述目的核酸的多态性。

2.一种真核生物基因分型方法，该方法包括下述步骤：

a)用一对引物扩增该真核生物中的目的核酸序列，其中第一引物与MITE，或其片段或其衍生物同源，该引物可与目的核酸序列中所述MITE退火，第二引物可与第一引物相同或不同，并与MITE同源或不同源；

b)分离步骤a)中扩增的核酸序列的片段；

c)比较步骤b)中所获片段与所述真核生物中对照核酸序列的片段，其中步骤b)中的片段与对照核酸序列的片段的同一性在携有所述核酸序列的所述真核生物中存在或不存在。

3.一种用于对真核生物进行指纹分析的方法，该方法包括下述步骤：

a)用一对引物扩增真核生物中的核酸序列，其中第一引物与MITE，或其片段或其衍生物同源，该引物特异于MITE序列，第二引物可与第一引物相同或不同，并与MITE同源或不同源；

b)分离步骤a)中扩增的核酸序列的片段，如此分离的片段即可代表该真核生物。

4.权利要求1、2或3中的方法，其中的扩增步骤通过PCR实现。

5.权利要求1、2、3或4中的方法，其中所述第一引物来自Tourist、Stowaway、Barfly或HSMarl Mariner和MADE1元件的共有核酸序列。

6.权利要求1、2、3、4或5中的方法，其中所述第一引物含有选自下组的核酸序列：SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11、SEQ ID NO：12、SEQ ID NO：13、SEQID NO：14、SEQ ID NO：15、SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：17、SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19、SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：21、SEQ ID NO：22、SEQID NO：23、SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：25、SEQ ID NO：26、SEQ ID NO：27、SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：29、SEQ ID NO：30、SEQ ID NO：31、SEQID NO：32、SEQ ID NO：33、SEQ ID NO：34和SEQ ID NO：35。

7.权利要求1、2、3、4、5或6中的方法，其中所述第二引物选自：MITE特异性引物、基于SSR序列的引物、逆转录元件、可检测RFLP的克隆核酸的序列、随机基因组序列、载体序列或基因序列。

8.可利用权利要求1、2、3、4、5、6或7的方法检测的多态性在追踪真核生物的子代方面的应用。

9.可利用权利要求1、2、3、4、5、6或7的方法检测的多态性在测定真核生物的杂种性方面的应用。

10.可利用权利要求1、2、3、4、5、6或7的方法检测的多态性在鉴定真核生物中连锁表型性状的变异方面的应用。

11.可利用权利要求1、2、3、4、5、6或7的方法检测的多态性作为用于构建遗传图谱的遗传标志方面的应用。

12.可利用权利要求1、2、3、4、5、6或7的方法检测的多态性在鉴定杂交子代方面的应用，其中所述子代含有来自亲本供体和/或亲本受体的所需遗传特征。

13.权利要求1、2、3、4、5、6或7方法在分离与基因编码序列或非编码序列相邻的基因组DNA序列方面的应用。