本发明提供了一种用于草莓果色性状辅助育种Indel标记及应用,属于果树育种及分子遗传学领域。其特征在于通过对白果黄毛草莓和红果森林草莓MYB10启动子区域进行比对,发现二者启动子区域存在差异,根据二者启动子区域的差异开发了Indel标记Fn‑pro,该Indel分子标记表现为SEQ ID NO该Indel标记能将白果黄毛草莓与其他红果草莓进行区分。本发明的Indel分子标记与白果黄毛草莓的果实颜色性状紧密相关,能够有效用于草莓的分子标记辅助育种,加速草莓果实色泽育种的进程。
本发明公开了用于鉴定大豆耐密植的InDel分子标记及其应用。本发明涉及分子标记技术领域,具体地涉及一种用于鉴定大豆耐密植的InDel分子标记及其应用。本发明首先提供了InDel分子标记或检测所述InDel分子标记的物质的应用,本发明InDel分子标记是一条链的核苷酸序列是SEQ ID No.4的第114‑160位的双链DNA分子;可在鉴定或辅助鉴定大豆耐密植能力中应用
本发明公开了一种与黄瓜株型紧密连锁的InDel分子标记,其核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示,InDel分子标记为如SEQ ID NO:1所示序列自5’端起第2010处碱基存在的一个102bp的缺失还公开了用于扩增InDel分子标记的引物、试剂盒和黄瓜株型的鉴定方法,以及InDel分子标记、引物、试剂盒或鉴定方法在黄瓜株型选育中的应用。采用本发明中的引物能产生黄瓜矮生型材料的特异性标记,且重复性好,特异性强;将本发明中InDel分子标记及引物用于鉴定黄瓜的株型,尤其是用于幼苗期快速鉴定黄瓜的株型,具有准确、快速、成本低、鉴定周期短,操作简便等优点
本发明“黄瓜抗番木瓜环斑病毒病基因prsv的Indel标记及其应用,”涉及生物技术辅助育种领域。黄瓜番木瓜环斑病毒病(PRSV)抗性基因prsv紧密连锁的Indel标记,其特征在于prsvInde2‑F/prsvInde2‑RCTTCCCCATCATCATACATC/AAGCAGGAGAATGAAACAAC;所述Indel标记扩增的与黄瓜PRSV感病基因PRSV连锁的特征条带为176bp,核苷酸序列见Seq ID No.1;所述Indel标记扩增的与黄瓜PRSV抗病基因prsv连锁的特征条带为170bp,核苷酸序列见Seq ID No.2所示;采用本发明获得的Indel标记,可以在黄瓜候选材料的任何阶段判断其是否对PRSV具有抗性,该标记具有高效、限制少的优点,对选育抗PRSV的黄瓜育种材料提高了效率,
本发明“黄瓜果实多刺基因ns的Indel标记及其应用”,涉及生物技术辅助育种领域。本发明公开了与黄瓜果实多刺基因ns连锁的Indel标记,其特征在于Indelns24‑F/Indelns24‑RTTTGAATGGCAGAAGAGAGT/TCCCTCTTTATTTGTGAACC。所述Indel标记扩增的与黄瓜果实多刺基因ns连锁的特征条带为216bp,核苷酸序列如Seq ID No.1;所述Indel标记扩增的与黄瓜果实少刺基因Ns连锁的特征条带为219bp,核苷酸序列如Seq ID No.2所示;采用本发明获得的Indel标记,可以在黄瓜候选材料的任何阶段对其进行果实多刺材料的筛选,具有高效、限制少的优点,为选育多刺黄瓜提高了选择效率,缩短了育种周期。
本发明公开了在不同豆类作物中通用的长豇豆InDel分子标记及其开发方法和应用。通用的长豇豆InDel分子标记,包括以豆类DNA为模板,利用如下SEQ ID NO.1~24任意所示的一组或几组引物对进行PCR扩增得到。本发明通过对苏紫41和苏豇1419进行转录组测序,将转录组组装序列进行BLAST比对,筛选有插入/缺失的转录本,开发InDel标记。分析所开发InDel标记的可行性后,再利用筛选得到的有效扩增标记分析其在不同豆类材料中的通用性。本发明的InDel分子标记在不同豆类材料上具有通用性,可用于今后豆类材料的遗传图谱构建、QTL定位、遗传多样性分析、分子标记辅助选择。