本发明公开了一种与黄瓜株型紧密连锁的InDel分子标记,其核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示,InDel分子标记为如SEQ ID NO:1所示序列自5’端起第2010处碱基存在的一个102bp的缺失。还公开了用于扩增InDel分子标记的引物、试剂盒和黄瓜株型的鉴定方法,以及InDel分子标记、引物、试剂盒或鉴定方法在黄瓜株型选育中的应用。采用本发明中的引物能产生黄瓜矮生型材料的特异性标记,且重复性好,特异性强;将本发明中InDel分子标记及引物用于鉴定黄瓜的株型,尤其是用于幼苗期快速鉴定黄瓜的株型,具有准确、快速、成本低、鉴定周期短,操作简便等优点,能够辅助黄瓜新品种选育。
本发明公开了一种用于墨宝冬瓜杂交种子纯度鉴定的SSR引物,包括引物SSR11c160的上游引物SSR11c160‑F和下游引物SSR11c160‑R,上游引物SSR11c160‑F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,下游引物SSR11c160‑R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。还公开了一种墨宝冬瓜杂交种子纯度的鉴定方法,该引物能产生193bp的母本特异性标记和225bp的父本特异性标记,该引物重复性好、特异性强。该方法利用上述SSR引物,能准确、快速、有效的鉴定墨宝冬瓜杂交种子纯度。还公开了上述引物在墨宝冬瓜杂交种子以及墨宝冬瓜杂交种子纯度鉴定方面的应用。
本发明公开了一种用于夏冠一号节瓜杂交种子纯度鉴定的SSR引物SSR81,所述引物SSR81包括上游引物SSR81‑F和下游引物SSR81‑R,所述上游引物SSR81‑F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述下游引物SSR81‑R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。还公开了一种夏冠一号节瓜杂交种子纯度的鉴定方法,该引物能产生母本特异性标记和父本特异性标记,重复性好、特异性强。该方法利用上述SSR引物,能准确、快速、便捷、有效的鉴定夏冠一号节瓜杂交种子纯度。
本发明公开了一种用于铁柱冬瓜杂交种子纯度鉴定的SSR引物SSR327,所述引物SSR327包括上游引物SSR327‑F和下游引物SSR327‑R,所述上游引物SSR327‑F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述下游引物SSR327‑R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。还公开了上述铁柱冬瓜杂交种子纯度的鉴定方法,该引物能产生184bp的母本特异性标记SSR327184和199bp的父本特异性标记SSR327199,重复性好、特异性强。该方法利用上述SSR引物,能准确、快速、便捷、有效的鉴定铁柱冬瓜杂交种子纯度。
本发明公开了一种冬瓜籽型基因的SNP分子标记,该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,该SEQ ID NO.1所示序列自5’端起第1120位碱基是SNP位点,其碱基为T或C。还公开了用于扩增上述的SNP分子标记的引物对,所述引物对包括上游引物和下游引物,其中上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,该引物对能产生单边籽材料特异性标记和双边籽材料特异性标记,重复性好,特异性强;还公开了一种冬瓜籽型的鉴定方法,该方法准确、快速、成本低、鉴定周期短,操作简便。还进一步公开了上述SNP分子标记以及引物对在鉴定冬瓜籽型中的应用。