本发明为“小麦禾谷孢囊线虫特异性SCAR标记及其快速PCR检测方法”，属生物技术领域。小麦禾谷孢囊线虫特异性SCAR标记的DNA片段，其特征在于该DNA片段具有如SEQ ID NO 1所示的核苷酸序列。根据小麦禾谷孢囊线虫特异性SCAR标记的DNA片段设计的特异性引物HaF1和HaR1，在PCR快速检测小麦禾谷孢囊线虫的方法中，可扩增出1010bp的特异性片段。本发明提高了分子检测灵敏度并且快速准确，在小麦禾谷孢囊线虫检测和小麦孢囊线虫病的早期诊断方面，具有很高的应用价值。
本发明公开了禾谷孢囊线虫EST‑SSR分子标记的引物组合及应用。禾谷孢囊线虫EST‑SSR分子标记的引物组合，其引物序列如SEQ ID NO：1‑16所示。根据禾谷孢囊线虫转录组序列信息，用MISA软件分析EST数据信息并大批量搜索SSR位点，根据SSR两翼序列设计EST‑SSR引物。经过PCR扩增，STR分型检测筛选出8个多态性高的EST‑SSR分子标记，能有效地对17个地理种群的禾谷孢囊线虫进行遗传多样性分析。本发明可应用于我国禾谷孢囊线虫的种群遗传结构和遗传变异水平等的研究。
本发明涉及禾谷孢囊线虫Ha‑63744蛋白、编码基因及其应用。禾谷孢囊线虫的Ha‑63744蛋白，其序列如SEQ ID NO：1所示，编码该蛋白的基因序列如SEQ ID NO：2所示。本发明提供的Ha‑63744基因，在线虫食道腺表达，在禾谷孢囊线虫的寄生后三龄时期、四龄幼虫时期表达量较高。利用dsRNA处理沉默Ha‑63744基因后，小麦根部的禾谷孢囊线虫数量明显低于对照，表明该基因在禾谷孢囊线虫寄生致病过程中发挥重要作用，可作为植物抗线虫工程的靶标基因。
