一种提高大豆对胞囊线虫病抗性的基因及其应用,属于遗传育种技术领域。本发明针对感病大豆植株根内胞囊线虫雌虫数目多,且目前常规抗病操作难度大,技术成本高的问题,提供了一种提高大豆对胞囊线虫病抗性的基因,所述基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,采用发根农杆菌K599介导的遗传转化方法,将pCSXN1250‑GmRSCN16‑1重组质粒转入感病东农50植株并诱导发根,混合接种大豆胞囊线虫1号、3号和4号生理小种,证实GmRSCN16‑1基因对大豆胞囊线虫病具有明显抗性本发明可用于选育抗胞囊线虫病大豆品种。