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[发明专利]一种用于单细胞测序数据的缺失值填充方法及系统-CN202210133555.8在审
发明人：黄梦;刘佩;黄磊;赵品 -专利权人：黄梦
申请日： 2022-02-14 - 公布日： 2023-08-22 - 主分类号： G16B25/10 文献下载
摘要：本发明公开一种用于单细胞测序数据的缺失值填充方法及系统，所述方法是基于单细胞测序技术，该方法包括:1)原始真实数据搜集，2)仿真数据生成，3)数据预处理，4)利用低秩矩阵对基因表达的缺失值进行填充，5)下游分析包括缺失值的掩码分析、可视化、聚类分析、细胞marker基因分析和基因表达的变异系数分析。本发明属于生物信息分析技术领域，本发明提供的基于单细胞转录组测序的细胞基因表达缺失值的填充方法，有效地填补了基因表达矩阵的缺失值，改善了细胞的低维表示和聚类，恢复了基因关系和标记基因的相关性，更好地保留细胞之间的基因表达变异性，能够降低现有单细胞测序数据分析中，基因表达的缺失值带来的细胞分类方法的局限性，有利于提高细胞分类准确率，达到减小分类误差的效果。
一种用于单细胞序数缺失填充方法系统

[发明专利]衰老细胞模型及其制备方法-CN201711157123.6有效
发明人：刘光慧;曲静;王思;任若通 -专利权人：中国科学院生物物理研究所
申请日： 2017-11-20 - 公布日： 2020-11-10 - 主分类号： C12N15/90 文献下载
摘要：本发明公开了衰老细胞模型及其制备方法。本发明提供的衰老细胞模型的制备方法包括：降低多能干细胞ATF6的含量或活性，得到ATF6缺失多能干细胞；诱导ATF6缺失多能干细胞，得到ATF6缺失间充质干细胞，ATF6缺失间充质干细胞即为衰老细胞模型，多能干细胞为胚胎干细胞或诱导多能干细胞。本发明的衰老细胞模型表现为细胞增殖能力降低、退行速度加快、存活能力降低和整合能力降低，以及细胞内蛋白质稳态失衡，细胞内蛋白质聚集体的增加，能够用于建立筛选可调控成体干细胞蛋白质稳态维持，减缓细胞衰老的备选
衰老细胞模型及其制备方法

[发明专利]一种CRISPR/Cas9基因编辑方法敲除卵巢癌细胞中CFP1基因的方法-CN201810800068.6有效
发明人：潘巍巍;徐营;范衡宇 -专利权人：嘉兴学院
申请日： 2018-07-20 - 公布日： 2020-09-04 - 主分类号： C12N5/10 文献下载
摘要：本发明采用CRISPR/Cas9基因编辑方法敲除卵巢癌细胞中CpG结合蛋白CXXC锌指蛋白1可以抑制细胞增殖。通过CRISPR/Cas9基因编辑方法敲除卵巢癌细胞A2780细胞中的CFP1蛋白，建立CFP1缺失的卵巢癌细胞系。通过细胞增殖实验证明CFP1缺失可以抑制卵巢癌细胞的增殖；通过克隆形成实验证明CFP1蛋白缺失抑制卵巢癌细胞非锚定性细胞生长;通过流式细胞仪检测发现CFP1基因敲除还影响细胞周期变化;通过免疫印迹检测发现在卵巢癌细胞中CFP1缺失可以显著降低H3K4me3的表达，这表明在卵巢癌细胞中CFP1参与调节组蛋白甲基化。
一种 crispr cas9 基因编辑方法卵巢癌细胞 cfp1

[发明专利]nlrp3基因敲除的小鼠巨噬细胞系及构建方法-CN201710083814.X在审
发明人：张安定;林岚;吕伟华;韩丽;陈焕春 -专利权人：华中农业大学
申请日： 2017-02-16 - 公布日： 2017-07-25 - 主分类号： C12N5/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种nlrp3基因敲除的细胞系及构建方法，该方法利用CRISPR技术将染色体基因组上NLRP3的基因一个插入A而另外一个缺失AG而使得细胞完全丧失该蛋白的表达。而且该缺失细胞系形态生长速度等方面均与对照细胞无明显的差异。使用内毒素LPS能激活TNF‑α的表达，激活缺失细胞系的免疫反应，与正常细胞无显著性差异；而使用NLRP3的激活剂，其炎性小体激活的能力丧失，基本无IL‑1β的分泌。证实本发明中细胞系NLRP3功能缺失，而其它功能未受影响。综上，本发明中NLRP3缺失细胞系Nlrp3‑/‑RAW可作为研究NLRP3蛋白质功能、NLRP3炎性小体、药物负筛选的良好细胞模型。
nlrp3 基因小鼠巨噬细胞构建方法

[发明专利]一种肿大细胞病毒vSOCS/vTK双基因敲除株及其制备方法和应用-CN201711355686.6有效
发明人：何建国;郭长军;翁少萍;林易凡 -专利权人：中山大学
申请日： 2017-12-16 - 公布日： 2021-07-30 - 主分类号： C12N7/01 文献下载
摘要：本发明提供了一种肿大细胞病毒vSOCS/vTK双基因缺失株及其制备方法和应用，为肿大细胞病毒株缺失vSOCS基因和vTK基因后制成的减毒病毒株。本发明还提供了一种带筛选标记的肿大细胞病毒vSOCS/vTK双基因缺失株及其制备方法和应用，为肿大细胞病毒缺失了vSOCS基因和vTK基因，且在基因缺失的部位通过同源重组分别插入第一筛选标记基因和第二筛选标记基因后制成的减毒病毒株本发明提供的肿大细胞病毒vSOCS/vTK双基因缺失株是一种敲除了vSOCS和vTK致病基因的重组基因工程疫苗，毒力很弱，不会导致被免疫的鱼类发病死亡，采用浸泡免疫即可达到显著的免疫效果，无须注射，应用价值极大
一种肿大细胞病毒 vsocs vtk 基因及其制备方法应用

[发明专利]一种杂合性缺失的检测方法-CN201510050352.2有效
发明人：李甫强;谢国云;史旭莲;王杰;梁瀚;侯勇;吴逵 -专利权人：深圳华大基因研究院
申请日： 2015-01-30 - 公布日： 2019-10-15 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本申请公开了一种杂合性缺失的检测方法，本申请的检测方法以单细胞测序为基础，以dbSNP数据库为背景，以染色体臂为检测单元，对单个细胞的SNP位点进行分析，并通过hampel identifier法判断离群点，鉴别出杂合性缺失，从而检测获得准确的单个细胞的杂合性缺失信息。本申请的检测方法率先在单细胞全基因组上水平检测各个细胞的杂合性缺失；以染色体臂为检测单元，检测精度高；开辟了单细胞杂合性缺失检测先河；为单个细胞差异的鉴别，以及肿瘤组织中细胞的异质性研究奠定了基础；不仅可以用于推断肿瘤的发生发展过程
一种杂合性缺失检测方法

[发明专利]一种基于机器学习的细胞识别方法及装置-CN202010288371.X有效
发明人：张海山;魏彦杰;滕彦宁;周家秀;冯圣中 -专利权人：中国科学院深圳先进技术研究院
申请日： 2020-04-14 - 公布日： 2021-08-24 - 主分类号： G06K9/00 文献下载
摘要：本发明涉及机器学习技术领域，具体涉及一种基于机器学习的细胞识别方法及装置。本发明通过从数据库中获取特征标识对应的细胞特征数据集；对细胞特征数据集进行特征提取，得到窗口细胞特征集；对窗口细胞特征集进行缺失值处理，得到细胞缺失特征集；对细胞缺失特征集进行验证，得到预训练机器学习模型以及预测准确率；根据预测准确率，获取细胞缺失特征集的最佳时间窗口；在所有最佳时间窗口上进行筛选操作，得到细胞筛选特征集；基于机器学习算法，将细胞筛选特征集输入至预训练机器学习模型进行训练，得到细胞分类机器学习模型；对待识别细胞数据进行识别，输出细胞类别，本发明解决了现有基于机器学习的细胞识别装置识别精度低的技术问题。
一种基于机器学习细胞识别方法装置

[发明专利]增强免疫反应的人半乳凝素-9缺失体的制备及应用-CN200910260048.5有效
发明人：黎燕;沈倍奋;韩根成;李育蓉;冯健男 -专利权人：中国人民解放军军事医学科学院基础医学研究所
申请日： 2009-12-24 - 公布日： 2010-08-04 - 主分类号： C07K14/47 文献下载
摘要：本发明公开了增强免疫反应的人半乳凝素-9缺失体的制备方法，含有蛋白DNA序列的表达载体以及用该表达载体转化的宿主细胞。本发明还提供了人半乳凝素-9缺失体在提高细胞免疫方面的应用。所述蛋白具备促进DC细胞及巨噬细胞活化功能，表现为增强细胞免疫反应，而缺失了人半乳凝素-9全蛋白的免疫抑制作用。
增强免疫反应人半乳凝素缺失制备应用

[发明专利]一种中性粒细胞缺失动脉粥样硬化模型小鼠的建立方法-CN201810078748.1有效
发明人：梁银明;张黎琛;卢燎勋;黄蓉;晁天柱;郑前前;罗静;谷妍蓉 -专利权人：新乡医学院
申请日： 2018-01-23 - 公布日： 2020-01-17 - 主分类号： A01K67/027 文献下载
摘要：本发明涉及一种中性粒细胞缺失动脉粥样硬化模型小鼠的建立方法，属于基因工程和遗传修饰技术领域。本发明首次将Gfi1点突变引入到ApoE敲除小鼠基因组，构建出了首例中性粒细胞缺失动脉粥样硬化小鼠遗传模型。通过实验证实，在该模型小鼠中，动脉粥样硬化斑块显著减少，动脉粥样硬化症状明显减轻，表明中性粒细胞缺失动脉粥样硬化模型小鼠构建是成功的，而且中性粒细胞缺失会减轻动脉粥样硬化的病变程度。本发明所获得的中性粒细胞缺失并发动脉粥样硬化的模型小鼠将对于揭开中性粒细胞对动脉粥样硬化的形成与修复的作用及动脉粥样硬化诊断治疗具有十分重要的潜在应用价值。
中性粒细胞动脉粥样硬化小鼠动脉粥样硬化模型模型小鼠构建动脉粥样硬化斑块动脉粥样硬化诊断动脉粥样硬化症状基因工程敲除小鼠遗传模型遗传修饰点突变基因组并发病变修复引入治疗应用成功

[发明专利]一种缺失型重组人中脑星形胶质细胞源性神经营养因子-CN201410370506.1在审
发明人：刘爱华;王辉;莘旭妮 -专利权人：北京泳健生物技术有限公司
申请日： 2014-07-31 - 公布日： 2016-02-10 - 主分类号： C07K14/475 文献下载
摘要：本发明属于生物医药领域，具体涉及一种用于治疗帕金森综合症的缺失型重组人中脑星形胶质细胞源性神经营养因子。通过对人中脑星形胶质细胞源性神经营养因子进行N端部分缺失突变，得到的缺失型重组人中脑星形胶质细胞源性神经营养因子具有活性更高的特点。
一种缺失重组人中星形胶质细胞神经营养因子

[发明专利]伪狂犬病毒基因缺失株、猪伪狂犬病灭活疫苗及其制备方法和应用-CN201810948945.4在审
发明人：彭丽英;林鸷;何錫忠 -专利权人：上海市农业科学院
申请日： 2018-08-20 - 公布日： 2020-02-28 - 主分类号： C12N7/01 文献下载
摘要：本发明公开了一种伪狂犬病毒基因缺失株，该基因缺失株是由野生型伪狂犬病毒PRV株gE基因序列缺失若干个碱基引起阅读框移码突变而构建成的伪狂犬病毒gE基因缺失株。本发明还公开了一种猪伪狂犬病灭活疫苗的制备方法，包括以下步骤：构建伪狂犬病毒gE基因缺失株；训化猪睾丸细胞并将其悬浮培养；接种伪狂犬病毒gE基因缺失株，当细胞有80％‑90％以上病变时，收获细胞培养物，得含上清液的细胞毒液；取上清液测定毒价，将检测合格的细胞毒液置于灭菌容器内灭活；灭活后的细胞毒液与佐剂混合，得猪伪狂犬病灭活疫苗。
狂犬病毒基因缺失狂犬病疫苗及其制备方法应用

[发明专利]一种缺失型人角质细胞生长因子-1的重组制备方法-CN201910433688.5有效
发明人：何勇;曹宇;冷国政;杨辉;何跃;范开 -专利权人：重庆派金生物科技有限公司
申请日： 2019-05-23 - 公布日： 2023-06-02 - 主分类号： C07K14/475 文献下载
摘要：本发明涉及一种缺失型人角质细胞生长因子‑1的重组制备方法，其包括用于获取缺失型人角质细胞生长因子‑1的重组表达方法、用于形成重组缺失型人角质细胞生长因子‑1的102位和106位间的一对二硫键的二硫键形成方法，其中，缺失型人角质细胞生长因子‑1的氨基酸序列特征为SEQ ID NO:1。本发明的重组表达方法，通过采用含T7启动子或BAD启动子的表达载体与表达宿主组成表达体系，直接表达得到的缺失型人角质细胞生长因子‑1，其N端无甲硫氨酸，无需工具酶酶切；本发明的二硫键形成方法，通过采用半胱氨酸作为添加剂，重组缺失型人角质细胞生长因子‑1的102位和106位间正确形成一对二硫键配对形成效率大于95％，具有与天然型KGF‑1相同的生物效价和生物作用。
一种缺失角质细胞生长因子重组制备方法

[发明专利]高度增殖的重组细胞-CN201180024867.5无效
发明人：劳伦斯·范梅尔德恩;约翰·蒂默曼斯 -专利权人：布鲁塞尔大学
申请日： 2011-05-20 - 公布日： 2013-01-23 - 主分类号： C12N1/36 文献下载
摘要：本发明涉及增加细胞生长的方法，其特征在于tldD和/或tldE基因中的缺失或一个或多个突变，与dam中的一个或多个突变，或者dam基因中的部分缺失或缺失相结合，本发明还涉及获得的细胞并涉及其用途。
高度增殖重组细胞

[发明专利]特征参数不完整情况下的细胞核分类与识别方法-CN200910060846.3有效
发明人：徐端全;庞宝川 -专利权人：武汉兰丁医学高科技有限公司
申请日： 2009-02-24 - 公布日： 2009-07-29 - 主分类号： G06K9/00 文献下载
摘要：本发明涉及一种特征参数不完整情况下的细胞核分类与识别方法，包括以下步骤：a.在细胞核训练样本集中，通过统计区分哪些特征参数是易失特征，哪些特征参数是非易失特征；b.训练过程中，在细胞核训练样本集中，利用单个的易失特征值作为输出，非易失特征作为输入，通过支持向量回归SVR训练程序得到单个易失特征值的回归估计模型；c.识别过程中，对于单个细胞核，如果有缺失特征参数，利用训练得到的回归估计模型和它的未缺失特征参数，回归估计该缺失特征参数；d.利用经过填充的缺失特征参数，结合未缺失的特征参数，组成新的细胞核特征向量，利用该特征向量进行细胞核的分类识别。
特征参数完整情况细胞核分类识别方法

[发明专利]一种GPD1L缺失人胚胎干细胞细胞株及其构建方法和应用-CN202111207615.8有效
发明人：董韬;林岩;岳丽玲;沈雷;潘洪明;纪慧;金海峰;刘吉成 -专利权人：齐齐哈尔医学院
申请日： 2021-10-18 - 公布日： 2023-08-18 - 主分类号： C12N5/10 文献下载
摘要：本发明提供了一种GPD1L缺失人胚胎干细胞细胞株及其构建方法和应用，涉及属于基因工程技术领域。根据基因编辑原理，合成靶向GPD1L基因4号外显子的sgRNA，构建基因敲除质粒，经过转染人胚胎干细胞后筛选，得到GPD1L双等位基因4号外显子中插入碱基A，导致GPD1L表达后在其蛋白质第157氨基酸位置出现终止密码子本发明构建的GPD1L缺失人胚胎干细胞系，其GPD1L蛋白缺失，核型正常，干细胞多能性标志物正常，连续传代稳定性好，动物体内可形成三胚层畸胎瘤，无支原体污染。可以利用GPD1L缺失人胚胎干细胞H9系研究GPD1L缺失对分化心肌细胞的功能影响及治疗药物的筛选。
一种 gpd1l 缺失胚胎干细胞细胞株及其构建方法应用

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