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[发明专利]确定蛋白质信息的方法、装置、可读介质及电子设备-CN202211289842.4在审
发明人：边成;张志诚;李永会 -专利权人：抖音视界有限公司
申请日： 2022-10-20 - 公布日： 2023-01-03 - 主分类号： G16B25/10 文献下载
摘要：本公开涉及一种确定蛋白质信息的方法、装置、可读介质及电子设备，包括：获取待确定蛋白质信息的目标蛋白质序列；将目标蛋白质序列输入目标蛋白质表示模型，以获取目标蛋白质表示模型输出的目标蛋白质表示；根据目标蛋白质表示，确定目标蛋白质序列的蛋白质信息，蛋白质信息包括蛋白质结构信息、蛋白质功能信息、蛋白质稳定信息以及蛋白质交互作用信息中的至少一个；其中，目标蛋白质表示模型通过多个样本集预先生成，样本集包括样本蛋白质序列和样本蛋白质序列对应的样本序列信息，样本序列信息包括样本蛋白质表示、样本基因本体特征以及样本关系信息，样本关系信息用于表征样本蛋白质序列与样本基因本体特征之间的关系。
确定蛋白质信息方法装置可读介质电子设备

[发明专利]预测蛋白质间相互作用的方法、装置、介质及电子设备-CN201711271142.1有效
发明人：汤一凡;崔朝辉;赵立军;张霞 -专利权人：东软集团股份有限公司
申请日： 2017-12-05 - 公布日： 2020-04-07 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本公开涉及一种预测蛋白质间相互作用的方法、装置、介质及电子设备。方法包括：获取待预测的目标蛋白质序列对，其包括第一目标蛋白质序列和第二目标蛋白质序列；确定第一目标蛋白质序列和第二目标蛋白质序列各自的同源蛋白质序列；将两个目标蛋白质序列的同源蛋白质序列两两进行组合，获得至少一个同源蛋白质序列对；根据至少一个同源蛋白质序列对，在已知蛋白质序列对中进行检索；若在已知蛋白质序列对中检索到预定数量的同源蛋白质序列对时，预测第一目标蛋白质序列和第二目标蛋白质序列之间具有相互作用。由此，可实现蛋白质间相互作用的快速、准确地预测，为生物研究人员进行生物实验提供较为可靠的数据支持。
预测蛋白质相互作用方法装置介质电子设备

[发明专利]一种蛋白质结构预测方法、蛋白质结构预测装置及介质-CN202111506982.8有效
发明人：刘鑫 -专利权人：苏州浪潮智能科技有限公司
申请日： 2021-12-10 - 公布日： 2023-09-19 - 主分类号： G16B15/00 文献下载
摘要：本发明提供一种蛋白质结构预测方法、蛋白质结构预测装置及介质。蛋白质结构预测方法，应用于计算机设备，计算机设备包括CPU和至少一个GPU，包括：获取待预测蛋白质结构的目标蛋白质序列。在CPU中，根据目标蛋白质序列的序列长度，确定目标蛋白质序列对应匹配序列的比对数量阈值。根据比对数量阈值，将目标蛋白质序列与预置的蛋白质序列库中的多个蛋白质序列进行比对，确定目标蛋白质序列对应的匹配序列。在预置的蛋白质结构数据库中，确定匹配序列对应的匹配结构。将匹配序列和匹配结构输入至预置在GPU中的蛋白质结构预测模型中进行蛋白质结构预测，得到目标蛋白质序列对应的蛋白质预测结构。能够减少GPU内存的占用，提高GPU的运算速度，加快预测速率。
一种蛋白质结构预测方法装置介质

[发明专利]一种蛋白质互作网络构建的方法-CN201510760997.5在审
发明人：朱平;张葵;郑艳 -专利权人：中国人民解放军第四军医大学
申请日： 2015-11-10 - 公布日： 2016-03-09 - 主分类号： G06F19/28 文献下载
摘要：本发明公开了一种蛋白质互作网络构建的方法，包括以下步骤：获取感兴趣的蛋白质集合；构建目标蛋白质的一级互作蛋白质数据库，并以此绘制目标蛋白质的一级蛋白质互作网络；构建目标蛋白质的二级互作蛋白质数据库，联合目标蛋白质的一级蛋白质互作网络，绘制目标蛋白质的互作蛋白质数据库。与现有技术相比，本发明构建蛋白质互作网络使用的候选数据库全面广泛，对已有数据库的整合使用和拓展应用思路新颖。该蛋白质互作数据库可以全面广泛地存储现有蛋白质互作关系，来源可靠并便于查询。对未知蛋白质功能的试验验证提供可靠的依据。
一种蛋白质网络构建方法

[发明专利]目标蛋白质的纯化方法-CN201710199775.X有效
发明人：髙桥亮 -专利权人：希森美康株式会社
申请日： 2017-03-30 - 公布日： 2022-05-03 - 主分类号： C07K1/18 文献下载
摘要：本发明提供目标蛋白质的纯化方法，其包括，使含肽标签的氨基酸序列、蛋白质分解酶的切断位点的氨基酸序列及目标蛋白质的氨基酸序列的融合蛋白质和蛋白质分解酶在溶液中接触，从上述融合蛋白质切断上述肽标签的工序；及通过使含上述肽标签、上述目标蛋白质和上述蛋白质分解酶的溶液与离子交换树脂接触，分离上述目标蛋白质和上述肽标签，取得含上述目标蛋白质的溶液的工序。
目标蛋白质纯化方法

[发明专利]蛋白质查找方法和设备-CN200780033987.5无效
发明人：寺本礼仁;皆川宏贵;上條宪一 -专利权人：日本电气株式会社
申请日： 2007-07-09 - 公布日： 2009-08-26 - 主分类号： G06F19/00 文献下载
摘要：一种蛋白质查找方法，其中基于通过蛋白质组分析获得的蛋白质表达谱图数据查找与信息直接或间接相关的蛋白质作为目标蛋白质，该方法包括基于通过对谱图数据中的信息和蛋白质表达量的监督学习获得的蛋白质的显著性选择与信息有关的蛋白质作为目标蛋白质；以及基于评估数据评估目标蛋白质的性能。
蛋白质查找方法设备

[发明专利]一种蛋白质功能预测方法及装置-CN201811603061.1有效
发明人：汤一凡;崔朝辉;赵立军;张霞 -专利权人：东软集团股份有限公司
申请日： 2018-12-26 - 公布日： 2021-07-30 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本申请实施例公开了一种蛋白质功能预测方法及装置，该方法包括：获得目标蛋白质的氨基酸序列特征和参考蛋白质的氨基酸序列特征；基于目标蛋白质的氨基酸序列特征和参考蛋白质的氨基酸序列特征，判断目标蛋白质的功能和参考蛋白质的功能是否满足相似判断规则；若是，则根据参考蛋白质的功能确定目标蛋白质的功能。从与功能相关的氨基酸序列的深层特征层面判断目标蛋白质的功能和参考蛋白质的功能之间的相似度，能够避免氨基酸序列表面特征的歧义性对功能相似性判断的影响，从而提高了蛋白质功能预测的覆盖率。
一种蛋白质功能预测方法装置

[发明专利]蛋白质功能的预测方法和装置、存储介质及电子设备-CN202310274958.9在审
发明人：贺勇;李兆融;张顺 -专利权人：阿里云计算有限公司
申请日： 2023-03-17 - 公布日： 2023-06-27 - 主分类号： G16B5/00 文献下载
摘要：本申请公开了一种蛋白质功能的预测方法和装置、存储介质及电子设备。其中，该方法包括：获取目标蛋白质对应的目标字符序列，其中，目标字符序列中的字符表征组成目标蛋白质的氨基酸的种类；通过目标神经网络模型对目标字符序列进行处理，得到目标信息矩阵，其中，目标信息矩阵用于表征目标蛋白质的氨基酸的序列信息和目标蛋白质的氨基酸的结构信息；依据目标信息矩阵对目标蛋白质进行功能预测，得到预测结果，其中，预测结果至少包括目标蛋白质对应的至少一个蛋白质功能。本申请解决了相关技术中基于蛋白质的氨基酸序列特征来进行蛋白质功能预测而导致预测准确度比较低的技术问题。
蛋白质功能预测方法装置存储介质电子设备

[发明专利]一种蛋白质功能预测方法、装置、终端设备及介质-CN202310130268.6在审
发明人：邓磊;郑荣涛 -专利权人：中南大学
申请日： 2023-02-17 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： G16B15/00 文献下载
摘要：本申请适用于生物信息学技术领域，提供了一种蛋白质功能预测方法、装置、终端设备及介质，通过获取目标蛋白质的序列、相互作用蛋白质的序列、同源蛋白质的序列以及目标蛋白质的结构模板，构建多序列比对；根据多序列比对和结构模板构建三维结构；提取目标蛋白质和相互作用蛋白质的序列特征，得到目标蛋白质和相互作用蛋白质的序列特征；利用蛋白质混合层对序列特征进行混合，得到第一混合特征；对目标蛋白质的序列特征和第一混合特征进行混合，得到第二混合特征；提取三维结构的结构特征；根据第二混合特征和结构特征，得到功能置信分数；根据功能置信分数对目标蛋白质功能进行预测。本申请能提高蛋白质功能预测的准确性。
一种蛋白质功能预测方法装置终端设备介质

[发明专利]用于预测蛋白质复合物结构的方法、设备、介质及程序产品-CN202310431117.4有效
发明人：许锦波 -专利权人：北京分子之心科技有限公司
申请日： 2023-04-20 - 公布日： 2023-09-15 - 主分类号： G16B15/20 文献下载
摘要：本申请的目的是提供用于预测蛋白质复合物结构的方法、设备、介质及程序产品，该方法包括从蛋白质序列数据库中查询获取目标蛋白质复合物的所有单链MSA，其中，每个单链MSA对应所述目标蛋白质复合物的一个成分链；基于蛋白质语言模型匹配所有单链MSA里面的蛋白质序列，以产生目标蛋白质复合物的MSA；将所述目标蛋白质复合物的MSA输入深度学习模型以获得所述目标蛋白质复合物的预测结构，有效提高蛋白质复合物结构预测的准确性和计算效率
用于预测蛋白质复合物结构方法设备介质程序产品

[发明专利]蛋白质及葡萄糖脱氢酶的精制方法-CN03824734.8有效
发明人：山冈秀亮;黑坂啓介;川瀬至道 -专利权人：爱科来株式会社
申请日： 2003-08-20 - 公布日： 2006-03-22 - 主分类号： C12N9/04 文献下载
摘要：本发明涉及从含有电子传递蛋白质的目标蛋白质溶解的蛋白质溶液、利用液体层析法、精制所述目标蛋白质的方法。液体层析法通过如下这样来进行，即，在填充有填充剂的填充槽中导入所述蛋白质溶液，使所述填充剂和所述目标蛋白质结合后，除去杂质，使用含有羟基胆烷酸盐的洗脱液，从所述填充剂中洗脱所述目标蛋白质。目标蛋白质，例如是含有具有葡萄糖脱氢活性的蛋白质的葡萄糖脱氢酶。液体层析法，组合疏水层析法和阴离子交换层析法来进行。
蛋白质葡萄糖脱氢酶精制方法

[发明专利]一种药物筛选方法、装置和计算机可读存储介质-CN202110069803.2在审
发明人：郑良振;沈涛;王晟;刘伟;黄俊洲 -专利权人：腾讯科技（深圳）有限公司
申请日： 2021-01-19 - 公布日： 2022-07-29 - 主分类号： G16C20/50 文献下载
摘要：本发明实施例公开了一种药物筛选方法、装置和计算机可读存储介质；本发明实施例在获取目标蛋白质的蛋白质信息和候选药物分子的分子信息后，该目标蛋白质为能被药物分子作用的标靶大分子，然后，分别对蛋白质信息和分子信息进行特征提取，得到目标蛋白质的蛋白质特征和候选药物分子的分子特征，根据蛋白质信息和分子信息，确定目标蛋白质与候选药物分子在分子力场下的相互作用信息，然后，基于蛋白质特征、分子特征和相互作用信息，计算目标蛋白质与候选药物分子之间的结合强度，根据结合强度，在候选药物分子中筛选出目标药物分子；该方案可以提高药物筛选的准确率。
一种药物筛选方法装置计算机可读存储介质

[发明专利]基于迭代优化预训练大模型采样的定向蛋白质改造方法-CN202310925090.4在审
发明人：陈华钧;秦铭;张强;丁科炎;吴槟;王泽元 -专利权人：浙江大学
申请日： 2023-07-26 - 公布日： 2023-10-20 - 主分类号： G16B20/50 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于迭代优化预训练大模型采样的定向蛋白质改造方法，包括：基于蛋白质预训练大模型对目标蛋白质关键突变位置进行预测，得到候选突变氨基酸的概率分布；根据概率分布采用最优传输距离采样候选突变氨基酸以得到目标突变蛋白质；利用高通量实验设备合成目标突变蛋白质并进行生化测试，得到湿实验标注结果；将带有湿实验标注结果的目标突变蛋白质对模型进行有监督训练，利用训练后的模型对目标蛋白质关键突变位置进行预测并降序排序；依据降序排序筛选多个突变蛋白质，并结合天然蛋白质对大模型做无监督微调；利用微调后的蛋白质预训练大模型，重复上述过程直至达到蛋白质改造预期目标。该方法蛋白质改造效率和准确度高。
基于优化训练模型采样定向蛋白质改造方法

[发明专利]一种抗肿瘤蛋白质药物的质量稳定工艺-CN201010616473.6无效
发明人：马兴元;朱玲;石磊;唐莉莉;郑文云;莫剑 -专利权人：华东理工大学
申请日： 2010-12-31 - 公布日： 2012-03-07 - 主分类号： A61K38/17 文献下载
摘要：本发明公开一种抗肿瘤蛋白质药物的质量稳定工艺，所述质量稳定工艺包括以下步骤：（1）目标蛋白质的大肠杆菌表达与发酵制备；（2）大肠杆菌工程菌的破碎与包涵体的回收；（3）包涵体洗涤与目标蛋白质的回收；（4）目标蛋白质强阳离子柱sepharose Fast Flow层析纯化；（5）弱阴离子柱DEAE琼脂糖凝胶层析纯化与回收目标蛋白质；（6）目标蛋白质的稳定保存；（7）制备目标蛋白质冻干粉针剂与冻干工艺；所述目标蛋白质是指一类TAT及其突变体携载的抗肿瘤活性survivin突变体蛋白质。本发明同时兼顾产量、生物活性和稳定性三方面，很好地解决了一类抗肿瘤蛋白质药物的质量稳定的全程控制工艺。
一种肿瘤蛋白质药物质量稳定工艺

[发明专利]制备固定化酶或固定化蛋白质的方法以及固定化酶或固定化蛋白质-CN201910962047.9在审
发明人：罗晖;常雁红;田珺玮;贾瑞琦;孙宏旭;汪月 -专利权人：北京科技大学
申请日： 2019-10-11 - 公布日： 2021-04-13 - 主分类号： C12N11/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种制备固定化酶或固定化蛋白质的方法以及固定化酶或固定化蛋白质。所述方法包括：将SpyCatcher共价结合在载体上；构建在N端或C端融合有SpyTag的目标酶或目标蛋白质；使共价结合有SpyCatcher的载体与融合有SpyTag的目标酶或目标蛋白质相互接触。所述固定化酶或固定化蛋白质包含载体、与所述载体共价结合的SpyCatcher、和在N端或C端融合有SpyTag的目标酶或目标蛋白质，所述目标酶或目标蛋白质通过所述SpyTag与所述SpyCatcher共价结合而固定在载体上本发明还是涉及一种共价结合有SpyCatcher的载体及其用于从蛋白质混合物中将N端或C端融合有SpyTag的目标酶或目标蛋白质选择性固定化的用途。
制备固定蛋白质方法以及

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