本发明提供一种非对映异构体(3S,1′S)型[化合物(I)]和(3R,1′S)型[化合物(II)]高苯丙氨酸羧酸酯-苯并氮杂卓类化合物的高效制备方法:1.将3-[(1′S)-高苯丙氨酸羧酸酯]-苯并氮杂卓类化合物的非对映异构体(3R,1′S)/(3S,1′S)型中的(3R,1′S)型利用羧酸盐结晶诱导的方式分离出来,再通过酯化反应得到(3R,1′S)型高苯丙氨酸羧酸酯-苯并氮杂卓类化合物。2.将上述分离出来的3R-[(1′S)-高苯丙氨酸羧酸盐]-苯并氮杂卓类化合物于pH=5~6的缓冲体系中进行高(绝对)选择性(无外消旋化)的差向异构化[highly selective (no racemization) epimerization]得到(3S,1′S)型羧酸(盐)化合物,再通过酯化反应得到(3S,1′S)型高苯丙氨酸羧酸酯-苯并氮杂卓类化合物。