[发明专利]一种基于机器学习的circRNA与miRNA、RBP相互作用关系的预测方法

摘要

本发明实施例公开了一种基于机器学习的circRNA与miRNA、RBP相互作用关系的预测方法，包括步骤：（1）构建circMIRNA、circRBP数据集和独立测试集。（2）运用工具提取上述数据集中circRNA的序列衍生特征。（3）首先，将circMIRNA数据集所提取的序列特征输入支持向量机进行训练，得到已训练的circRNA‑miRNA相互作用分类器。其次，将circRBP数据集所提取的序列特征输入支持向量机进行训练，得到已训练的circRNA‑RBP相互作用分类器。最后，将上述结果取并集，得到circRNA与miRNA，RBP的相互作用关系。（4）采用两步法分别判断circRNA‑miRNA相互作用分类器与circRNA‑RBP相互作用分类器的最优特征子集。（5）分别将优化的特征子集输入上述circRNA‑miRNA相互作用分类器与circRNA‑RBP相互作用分类器，重新训练得到优化的circRNA与miRNA，RBP相互作用关系预测模型。