[发明专利]微卫星标记引物的开发方法及其应用有效
申请号: | 201811239076.4 | 申请日: | 2018-10-23 |
公开(公告)号: | CN109536615B | 公开(公告)日: | 2020-09-18 |
发明(设计)人: | 郭梁;张殿昌;郭华阳;杨静文;杨权;张楠;朱克诚;刘宝锁;林慧洁 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院南海水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6806;C12N15/11;C12N15/10;G16B25/20;G16B30/00 |
代理公司: | 广州知友专利商标代理有限公司 44104 | 代理人: | 宣国华;何秋林 |
地址: | 510300 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明属于遗传育种技术领域,具体涉及微卫星标记引物的开发方法及其应用,其中微卫星标记引物的开发方法主要特点体现在其引物设计上,本发明利用重测序技术,在检测群体全基因组SNP、Indel和SSR变异规律的基础上,设计和筛选微卫星标记的引物,从而提高了微卫星标记引物的开发通量和效率。 | ||
搜索关键词: | 卫星 标记 引物 开发 方法 及其 应用 | ||
【主权项】:
1.一种微卫星标记引物的开发方法,其特征是包括如下步骤:(1)重测序:选取待测物种,进行重测序;(2)检测SNP和Indel变异:将步骤(1)获得的测序序列与该物种的参考基因组比对,获取其SNP和Indel变异;(3)获取多态性高的微卫星位点:对参考基因组的重复基序进行检测,获得微卫星位点,对微卫星位点进行分型,筛选出多态性高的微卫星位点;(4)设计微卫星位点的扩增引物并筛选:利用步骤(2)中的SNP和Indel变异信息和步骤(3)中获得的多态性高的微卫星位点信息,设计获得微卫星标记引物,并选取部分微卫星标记引物进行PCR验证。
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