本发明公开了一种平鲷SNP分子标记的多态性引物,所述多态性引物为18对,18对引物的核苷酸序列依次如SEQ ID NO:1~36所示,18对引物用于扩增的平鲷SNP分子标记为36个,编号依次为RSSNP1~RSSNP36,所述RSSNP1~RSSNP36位于如SEQ ID NO:37~54所示的序列中,还公开了上述引物在平鲷遗传多样性分析中的应用。本发明首次在平鲷上批量建立了具有丰富多态性的SNP分子标记,并筛选出了18对多态性引物,为平鲷的家系鉴定、种群遗传结构、遗传育种,增殖放流等研究提供了高效的分析技术工具;本发明所使用的开发SNP标记的方法,简便、快捷、高效,节约了人力和成本。
本发明公开了一种用于扩增黑棘鲷SNP分子标记的多态性引物,所述引物为引物对1‑引物对29,每对引物均包括上游引物和下游引物,所述引物对1‑引物对29的碱基序列依次如SEQ ID NO:1~58所示。还公开了引物在黑棘鲷遗传多样性分析中的应用以及上述SNP分子标记和引物的筛选方法。本发明首次在黑棘鲷上批量建立了具有丰富多态性的48个SNP分析标记,并筛选出了29对多态性引物,为黑棘鲷的家系鉴定、种群遗传结构、遗传育种,增殖放流等研究提供了高效的分析技术工具;本发明提供的黑棘鲷SNP分子标记及其多态性引物的筛选方法,简便、快捷、高效,节约了人力和成本。
本发明公开了一种卵形鲳鲹性别快速鉴定引物,所述引物为引物P18‑1,所述引物P18‑1包括正向引物P18‑1‑F和反向引物P18‑1‑R,所述正向引物P18‑1‑F的碱基序列如SEQ ID NO:1所示,所述反向引物P18‑1‑R的碱基序列如SEQ ID NO:2所示。还公开了包括上述引物的试剂盒以及利用上述引物快速鉴定卵形鲳鲹性别的方法,以及上述引物、试剂盒以及方法在鉴定卵形鲳鲹性别方面的应用。该引物,特异性好,灵敏度好,准确度高,鉴定成功率高达97%,相比于毛细管电泳鉴定方法,本申请方法不需复杂的设备,缩短了检测周期,降低了检测成本。
本发明公开了一种用于鉴别黄鳍棘鲷和平鲷的引物,所述引物为引物1或引物2,所述引物1包括正向引物1F和反向引物1R,所述正向引物1F的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述反向引物1R的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;所述引物2包括正向引物2F和反向引物2R,所述正向引物2F的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,所述反向引物2R的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示。本发明还公开了一种鉴别黄鳍棘鲷和平鲷的试剂盒和方法,以及上述引物、试剂盒和方法在鉴别黄鳍棘鲷和平鲷中的应用。
本发明公开了一种卵形鲳鲹半胱氨酸双加氧酶ToCDO基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。还公开了含有上述卵形鲳鲹半胱氨酸双加氧酶ToCDO基因编码的蛋白,表达载体、重组菌株和重组蛋白,以及上述基因、蛋白、表达载体、重组菌株和重组蛋白在催化L‑半胱氨酸生成L‑半胱亚磺酸中的应用以及在体外制备半胱亚磺酸产品中的应用。本发明以工程菌重组表达的方式获得半胱氨酸双加氧酶蛋白,该蛋白体外催化生成L‑半胱亚磺酸过程简单易于合成,具有较高催化活性,有效提高了催化效率,为L‑半胱亚磺酸的生物合成提供了新的高效方法。
本发明公开了一种黄鳍棘鲷抗海豚链球菌病SNP分子标记,所述SNP分子标记的序列如SEQ ID NO:1所示,所述SEQ ID NO:1所示序列自5’端开始的第201位的碱基N为T或G,还公开了一种用于扩增所述SNP分子标记的引物,以及上述SNP分子标记或上述引物在鉴定抗海豚链球菌能力的黄鳍棘鲷中的应用,以及在筛选具有抗海豚链球菌能力的黄鳍棘鲷中的应用和在黄鳍棘鲷抗海豚链球菌优良品种早期筛选中的应用,本发明可以对黄鳍棘鲷育种材料进行早期选择,有效提高了选育具有抗海豚链球菌黄鳍棘鲷品种的效率和准确性。
本发明公开了一种二长棘犁齿鲷SNP位点标记组合的扩增引物,所述二长棘犁齿鲷SNP位点标记组合的扩增引物为25对,其核苷酸序列依次如SEQ IDNO:1~50所示,用于扩增的二长棘犁齿鲷SNP位点标记组合为50个,编号分别为ECSNP1~ECSNP50,分别位于如SEQ ID NO:51~75所示的序列中。还公开了上述引物在二长棘犁齿鲷遗传多样性分析中的应用。本发明首次在二长棘犁齿鲷上批量建立了具有丰富多态性的SNP分子标记,筛选出了25对多态性引物,为二长棘犁齿鲷的家系鉴定、种群遗传结构、遗传育种,增殖放流等研究提供了高效的分析技术工具。
本发明公开了一种与卵形鲳鲹抗刺激隐核虫病相关性状的SNP分子标记,该SNP分子标记由卵形鲳鲹LAAO基因中克隆得到,位于LAAO基因外显子中,该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的6499位和6535位碱基处分别存在两个等位基因突变(C/T)和(G/A),还公开了用于扩增SNP分子标记的引物,以及上述SNP分子标记或引物在鉴别或选育抗刺激隐核虫病卵形鲳鲹品种方面的应用。本发明筛选的分子标记对卵形鲳鲹抗刺激隐核虫病性状进行了关联分析,本发明的两个标记可应用于以抗病性状为目标的卵形鲳鲹育种材料早期筛选,能够有效提高育种的效率和缩短育种年限。
本发明涉及一种与黑鲷耐低温性状相关的SNP标记,所述SNP标记为黑鲷SCD1‑a基因序列的第3125位碱基,该碱基为A或T;所述SCD1‑a基因的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;所述SNP标记位点的AA基因型个体在相同养殖条件下的低温耐受时间显著高于TT基因型个体。利用本发明提供的SNP标记及其检测引物可检测黑鲷耐低温的性状,该方法准确可靠、操作简单,能够有效、快速的筛选出符合要求的性状,辅助早期实现短时间、低成本的选育出耐受低温的黑鲷的个体,进而增加优良品质的黑鲷数量,培育黑鲷耐低温品种,提高黑鲷的养成率,缩短养殖周期,进而提高黑鲷产量,促进其可持续健康养殖,具有广阔的应用前景。
本发明公开了一种用于棘头梅童鱼SSR多重PCR引物,所述SSR多重PCR引物包括9对特异性引物,分别为引物对Clu982、Clu1605、Clu740、Clu493、Clu1563、Clu873、Clu1288、Clu1020和Clu370,其中每对引物包括一个正向引物和一个反向引物,所述9对特异性引物的碱基序列依序分别如SEQ ID NO:1~18所示。还公开了包括这些引物的试剂盒,以及棘头梅童鱼微卫星荧光多重PCR的方法。和上述引物、试剂盒以及方法在在评估棘头梅童鱼遗传多样性方面的应用。