[发明专利]循环肿瘤DNA重复序列的处理方法及装置有效
申请号: | 201810035620.7 | 申请日: | 2018-01-15 |
公开(公告)号: | CN108229103B | 公开(公告)日: | 2020-12-25 |
发明(设计)人: | 郭昊;于佳宁;韩天澄;宋雪;林小静 | 申请(专利权)人: | 无锡臻和生物科技有限公司 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G16B20/20 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 赵囡囡 |
地址: | 214500 江苏省无锡市锡山区*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明公开了一种循环肿瘤DNA重复序列的处理方法及装置。其中,该方法包括:获取待检测循环肿瘤DNA的测序数据和参考基因组序列,其中,测序数据为对待检测循环肿瘤DNA进行高通量测序得到的数据,测序数据包括:多对双端序列;将测序数据和参考基因组序列进行比对,得到第一比对结果,其中,第一比对结果至少包括:多对双端序列的基因组位置、碱基序列和对应的碱基质量值序列;基于第一比对结果,确定每对双端序列的类型,其中,类型包括:独立序列和重复序列。本发明解决了现有技术中测序数据的处理方法对样本测序进行重复序列删除或标记,准确度低的技术问题。 | ||
搜索关键词: | 循环 肿瘤 dna 重复 序列 处理 方法 装置 | ||
【主权项】:
1.一种循环肿瘤DNA重复序列的处理方法,其特征在于,包括:获取待检测循环肿瘤DNA的测序数据和参考基因组序列,其中,所述测序数据为对待检测循环肿瘤DNA进行高通量测序得到的数据,所述测序数据包括:多对双端序列;将所述测序数据和所述参考基因组序列进行比对,得到第一比对结果,其中,所述第一比对结果至少包括:所述多对双端序列的基因组位置、碱基序列和对应的碱基质量值序列;基于所述第一比对结果,确定每对双端序列的类型,其中,所述类型包括:独立序列和重复序列。
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