[发明专利]用于定量RNA转录物变体的方法和产物有效

专利信息
申请号: 201580035408.5 申请日: 2015-07-09
公开(公告)号: CN106471134B 公开(公告)日: 2021-11-12
发明(设计)人: L·保罗;P·库巴拉;T·莱达 申请(专利权)人: 莱科赛根有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;C12Q1/6806
代理公司: 中国贸促会专利商标事务所有限公司 11038 代理人: 张小勇
地址: 奥地利*** 国省代码: 暂无信息
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摘要: 发明涉及转录组学领域,并提供了用于样品中转录物变体的受控鉴定和/或定量的方法,包括提供模拟转录物变体的人工多核酸分子的参照集,并将所述参照集作为外部对照添加到包含转录物变体的样品。本发明还提供这样的参照集以及产生这样的参照集的方法。
搜索关键词: 用于 定量 rna 转录 变体 方法 产物
【主权项】:
一种用于在一个或多个样品中受控鉴定和/或定量转录物变体的方法,包括:a)提供模拟转录物变体的人工核酸(NA)分子的参照集,该参照集包含至少一个、优选至少两个、更优选至少三个、特别是至少五个不同家族的NA分子,每个家族由至少两种、优选至少三种、更优选至少四种、特别是至少五种不同NA分子组成,其中,独立地对于每个家族,所述每个家族的所有NA分子是相同人工基因的参照转录物变体,和其中,独立地对于每个家族,所述每个家族的NA分子共有长度为至少80个核苷酸(nt)的序列,并且所述每个家族的至少两种NA分子相差至少80nt长度的至少另一个序列,和其中所述NA分子中至少两种、优选每种以预设的摩尔量存在;和b)将所述参照集作为外部对照添加到包含转录物变体的一个或多个样品;和c1)基于读长生成和分配进行NA测序,其中使用参照集的读长产生参照读长分配,并且所述参照读长分配用于控制、验证或修饰一个或多个样品的转录物变体的读长分配;或者c2)对所述一个或多个样品进行NA检测或定量方法,优选微阵列分析或qPCR,其中至少一个探针结合参照集的至少一个NA分子,并且基于从至少一个探针结合参照集的至少一个NA分子产生的信号的测量结果用于控制、验证或修饰基于在所述NA检测或定量方法中一个或多个样品的转录物变体结合探针产生的信号的测量结果。
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