[发明专利]一种基因大肠杆菌表达谱芯片的基因网络构建方法

摘要

本发明所述的方法的一大特点便是将大肠杆菌的表达谱基因芯片的数据进行统计学分析处理进行网络构建，用于研究基因之间的相互作用关系，该方法实施的基本流程为：步骤1、待检测样品进行大肠杆菌表达谱芯片检测获得原始数据。步骤2、对原始数据进行预处理及统计学分析并筛查差异表达的基因。步骤3、文档搜索及格式化。步骤4、将文档分离成单个句子，作为后续分析基本单位。步骤5、基因描述的定位。步骤6、统一基因描述中使用的基因符号。步骤7、建立基因互作动词词典。步骤8、生成需要研究基因的同义词字典，并从上述句子中提取出基因的描述。步骤9、统计分析基因名、基因互作动词和需要研究的基因同时出现的句子，整理成列表。步骤10、构建相互作用关系网络。

主权项

本发明专利所述的一种基于大肠杆菌表达谱芯片的基因网路构建及进行基因之间相互作用关系研究的方法，其主要特征如下：步骤1、待检测样品进行大肠杆菌表达谱芯片检测获得原始数据；步骤2、对原始数据进行预处理及统计学分析并筛查差异表达的基因；步骤3、文档搜索及格式化；步骤4、将文档分离成单个句子，作为后续分析基本单位；步骤5、基因描述的定位；步骤6、统一基因描述中使用的基因符号；步骤7、建立基因互作动词词典；步骤8、生成需要研究基因的同义词字典，并从上述句子中提取出基因的描述；步骤9、统计分析基因名、基因互作动词和需要研究的基因同时出现的句子，整理成列表；步骤10、构建相互作用关系网络。