“G06F19/14”专利分类搜索_专利查询_文献下载_出售_求购_买卖_交易

钻瓜专利网为您找到相关结果13个，建议您升级VIP下载更多相关专利

[发明专利]一种批量计算基因组直系同源基因进化速率的方法-CN201510965003.3有效
发明人：郭月;刘静;杜建厂 -专利权人：江苏省农业科学院
申请日： 2015-12-18 - 公布日： 2018-05-22 - 主分类号： G06F19/14 文献下载
摘要：本发明公开了一种批量计算基因组直系同源基因进化速率的方法。本发明所提供的计算基因组直系同源基因进化速率的方法综合运用了基于Blast成对比对结果后进行聚类搜索直系同源基因的InParanoid程序，基于多序列比对分析的MUSCLE程序，基于编码蛋白DNA序列之间的比较来评估同义和非同义替代比率的PAML软件包yn00程序，以及结合Perl脚本语言编程等方法。实验证明，本发明所提供的批量计算基因组直系同源基因进化速率的方法比较系统，检测基因组计算基因组直系同源基因进化速率各参数值的重复效果好，速度快，易实现批量化、自动化和流程化。
一种批量计算基因组直系同源基因进化速率方法

[发明专利]用于序列对齐的系统、方法、和装置-CN201580070639.X在审
发明人： S·卡玛拉卡兰 -专利权人：皇家飞利浦有限公司
申请日： 2015-12-21 - 公布日： 2017-08-29 - 主分类号： G06F19/14 文献下载
摘要：公开了一种用于减少将种类分配到感染分离物的计算时间的系统、方法、和装置。公开了一种用于基于参考序列的系统发生树来将搜索索引划分成一个或多个子索引的方法。公开了一种用于将读取划分成测试集并与子索引对齐以便将种类分配到感染分离物的方法。公开了一种使用子索引来将序列读取对齐到参考序列的数据库的系统。
用于序列对齐系统方法装置

[发明专利]一种基因编码序列的优化方法及装置-CN201710089460.X在审
发明人：段广有;徐凤丹;金亮;廖国娟;葛毅 -专利权人：苏州金唯智生物科技有限公司
申请日： 2017-02-20 - 公布日： 2017-07-14 - 主分类号： G06F19/14 文献下载
摘要：本发明公开了一种基因编码序列的优化方法及装置，方法包括生成M个基因编码序列，作为初代群体P(0)，其中，M为大于1的整数；计算当代群体中每个基因编码序列的适应度；判断是否达到终止计算条件；当未达到终止计算条件时，对第t代群体P(t)的基因编码序列进行选择、交叉和变异运算，得到第t+1代群体P(t+1)，返回执行计算当代群体中每个基因编码序列的适应度的步骤，t取0、1、2…；当达到终止计算条件时，选择适应度最大的基因编码序列作为优化后的基因编码序列。本发明通过采用遗传算法对基因编码序列进行优化，对于根据用户需求设置的参数采用加权求和的方式计算基因编码序列的适应度，使得优化后的基因编码序列满足用户的需求。
一种基因编码序列优化方法装置

[发明专利]一种通过熵变分析离子束注入全基因组突变及定向进化物理机制的方法-CN201710109300.7在审
发明人：陈恒雷;吕长武;孔维新 -专利权人：新疆大学
申请日： 2017-02-27 - 公布日： 2017-07-14 - 主分类号： G06F19/14 文献下载
摘要：本发明提供了一种通过熵变分析离子束注入全基因组突变及定向进化物理机制的方法，该方法包括DNA分子有效体积和自由体积概念的引入、熵变函数的定义、细胞核有效熵变和自由熵变的计算、离子束注入全基因组突变及定向进化物理机制的分析等步骤。优选地，在通过熵变分析离子束注入全基因组突变及定向进化物理机制的步骤中还包括DNA分子有效体积和自由体积概念的引入、熵变函数的定义与有效熵变和自由熵变的计算，经过上述对细胞核有效熵变和自由熵变的计算和分析可获得离子束注入全基因组突变及定向进化物理机制，为离子束生物工程、重离子放疗等电离辐射技术提供了一种全新的分析方法和理论指导。
一种通过分析离子束注入基因组突变定向进化物理机制方法

[发明专利]用于预测未观察到的表型（PUP）的方法和组合物-CN201180036467.6有效
发明人：郭志刚;V.K.基肖尔 -专利权人：先正达参股股份有限公司
申请日： 2011-06-02 - 公布日： 2013-04-03 - 主分类号： G06F19/14 文献下载
摘要：在此提供了用于预测未观察到的表型的多种方法。在一些实施方案中，这些方法包括：(a)确定在一个基因分型的并且表型分型的参比种群中针对一种表型的多个标记的标记效应，其中该参比种群包括一个F2代、一个F3代、或一个后续代；(b)对一个预测种群的一株或多株植物针对该多个标记进行基因分型，其中该预测种群中的一株或多株植物中的每一株都是两个亲本的一个后代并且每一个亲本与被用来产生该参比种群的这两个亲本植物中的至少一个具有至少80%的遗传一致性；(c)基于步骤(b)的基因分型，针对该预测种群中的一株或多株植物中的每一株对在步骤(a)中所确定的这些标记效应进行求和；以及(d)基于来自步骤(c)的这些标记效应之和来预测在该预测种群中的一株或多株植物的一种表型。在此还提供了用于产生具有一种感兴趣的表型的植物的方法、以及用于估算在种群之间的遗传相似性的方法。
用于预测观察到表型 pup 方法组合

[发明专利]一种谷子育种材料细胞质类型的划分方法-CN201210203604.7有效
发明人：刘正理;张梅申;张永信;张婷;夏雪岩;程汝宏;师志刚;李伟 -专利权人：河北省农林科学院谷子研究所
申请日： 2012-06-20 - 公布日： 2012-10-24 - 主分类号： G06F19/14 文献下载
摘要：本发明公开了一种谷子育种材料细胞质类型的划分方法，其特征在于包括以下步骤：(1)细胞质来源进化树的构建；(2)母本衍生进化图的构建；(3)特定遗传相似系数的确定及细胞质来源的分子聚类；(4)谷子育种材料细胞质类型的确定。本发明为培育不同细胞质类型的不育系和杂交种奠定了基础，为创制不同细胞质类型的谷子不育系，培育不同细胞质类型的谷子杂交种奠定基础。
一种谷子育种材料细胞质类型划分方法

[发明专利]一种基因内含子进化重构装置及方法-CN201110459713.0有效
发明人：向浏欣;蔡应繁 -专利权人：重庆邮电大学
申请日： 2011-12-31 - 公布日： 2012-07-04 - 主分类号： G06F19/14 文献下载
摘要：本发明涉及一种基因内含子进化重构装置及方法，所述装置包括同源基因数据获取单元，用于获取同源基因数据；内含子位点判断单元，用于对获取的同源基因数据进行判断是否有内含子位点数据；内含子位点标定单元，用于对同源基因数据标定内含子位点；系统进化树构建单元，用于对带有内含子位点的同源基因数据集构建系统进化树；内含子进化重构单元，用于对构建的系统进化树根据最大简约法重构内含子进化；本发明在系统进化树的基础上重构内含子进化，客观地描述内含子进化历程，是后续内含子功能研究的基础，本发明对进化树的数量和每棵进化树的同源基因的数量没有限制，对同源基因内含子的任何存在形式都可以重构，具有广泛性应用前景。
一种基因内含进化装置方法

[发明专利]蛋白质三维结构的预测方法及预测装置-CN201010287704.3有效
发明人：吕强 -专利权人：苏州大学
申请日： 2010-09-17 - 公布日： 2012-04-04 - 主分类号： G06F19/14 文献下载
摘要：本发明提供了一种蛋白质三维结构的预测方法，包括：a、选择目标蚁群，初始化蚁群算法参数；b、初始化蛋白质构象，建立蛋白质构象与片段库的映射关系；c、以蛋白质构象上的任一位置为起点，目标蚁群在信息素的指引下进行优化，对优化后的蛋白质构象进行能量计算，选择能量最小的蛋白质构象；d、对能量最小的蛋白质构象进行局部优化，并进行能量计算，根据计算结果更新信息素矩阵，并将局部优化后的蛋白质构象的能量与能量最小的蛋白质构象的能量进行比较，选择能量小的蛋白质构象；e、重复步骤c～d，得到较优蛋白质构象；f、对较优蛋白质构象进行Loop重建，得到最优蛋白质构象。本发明还提供了一种蛋白质三维结构的预测装置。
蛋白质三维结构预测方法装置

[发明专利]一种长非编码核糖核酸靶基因预测方法-CN201010258125.6无效
发明人：陈喆;吴剑丙;刘培 -专利权人：浙江中医药大学附属第一医院
申请日： 2010-08-19 - 公布日： 2012-03-14 - 主分类号： G06F19/14 文献下载
摘要：本发明根据长非编码RNA的靶基因作用规律，找到了一种可行的长非编码RNA的靶基因的生物信息学方法，可直接针对长非编码RNA的靶基因内进行锁定，以便于进一步的实验验证。本发明主要包括如下流程：步骤1：获取感兴趣的基因集合；步骤2：建立长非编码RNA数据库；步骤3：长非编码RNA的顺式靶基因预测；步骤4：长非编码RNA的反式靶基因预测。最终，靶向感兴趣基因的长非编码RNA，可以直接进行实验验证。
一种编码核糖核酸基因预测方法

[发明专利]信息处理装置、信息处理方法和程序-CN201110137752.9无效
发明人：吉田芳 -专利权人：索尼公司
申请日： 2011-05-25 - 公布日： 2011-12-14 - 主分类号： G06F19/14 文献下载
摘要：提供了信息处理装置、信息处理方法和程序。一种根据本发明的信息处理装置，包括：数据获取单元，获取表示一串一个以上字符的串数据；以及系统发育分析单元，分析由数据获取单元获取的串数据以在由串数据表示的串中提取同源串片段，并基于所提取的同源串片段的位置关系和同源关系执行系统发育分析。
信息处理装置方法程序

[发明专利]一种microRNA编码区靶基因预测的方法-CN201010190174.0无效
发明人：曾华宗 -专利权人：上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2010-06-01 - 公布日： 2011-12-07 - 主分类号： G06F19/14 文献下载
摘要：本发明涉及一种microRNA靶基因预测的方法，适用于microRNA位于基因编码区的靶基因的预测。本发明包括如下流程：步骤1，建立待研究生物的编码区序列数据库；步骤2，与其他物种编码区序列进行序列比对，寻找保守区段；步骤3，设计靶基因预测程序，并进行编译和调试；步骤4，对于每一个microRNA，扫描所有基因的编码区，从保守序列中获得结合位点；步骤5，靶基因的统计及查询；步骤6，实验验证。该方法的优点在于：实施简单、结果可靠性高，能满足大部分microRNA编码区靶基因预测的需要。
一种 microrna 编码基因预测方法

[发明专利]超级细菌基因特征的生物信息学研究方法-CN201110027414.X无效
发明人：陆广琴 -专利权人：上海市金山区青少年活动中心
申请日： 2011-01-25 - 公布日： 2011-09-14 - 主分类号： G06F19/14 文献下载
摘要：本发明公开了一种超级细菌基因特征的生物信息学研究方法，包括：(a)利用CodomW软件对超级细菌的基因进行分析，确定AT含量和GC含量；(b)利用BLAST查找与超级细菌相关的基因序列；(c)利用Clastalx软件对超级细菌与BLAST上查找到的超级细菌相关的基因序列进行比对；(d)利用MEGA进行同源性画树。采用本发明的研究方法研究NDM-1基因特征，发现在Enterococcus faecium；Klebsiella pneumoniae；Escherichia coli三种基因上有NDM-1，且NDM-1具有稳定性高、灵活性高的基因特征，为后续对超级细菌的研究提供有益的参考。
超级细菌基因特征生物信息学研究方法

[发明专利]基于多核处理器的核糖核酸次级结构并行预测方法-CN201110030505.9无效
发明人：刘利;李锐喆;姜进磊;杨广文 -专利权人：清华大学
申请日： 2011-01-28 - 公布日： 2011-05-25 - 主分类号： G06F19/14 文献下载
摘要：基于多核处理器的核糖核酸次级结构并行预测方法，属于生物信息计算和并行计算领域；该方法采用Zuker算法上三角矩阵数据划分为若干n*n的数据存储块，每个数据存储块中数据采用行主序或列主序方式存储在连续内存空间上；每个存储块是内存访问即异步DMA的基本单位；将每个存储块再划分为若干更小的计算块；若计算块为上三角形，则将该计算块用“0”填充为方阵；将多个存储块组成一个调度块，调度块是任务动态调度的基本单位，由多个核对Zuker算法的多个调度块进行并行计算，每个核一次仅计算一个调度块；仅当一个调度块所直接依赖的调度块都被计算完毕，它才被调度到一个核上去计算。本发明可提高Zuker算法性能的方法，高效预测RNA次级结构。
基于多核处理器核糖核酸次级结构并行预测方法

1
共 13 条