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[发明专利]DNA甲基化测序文库的制备方法和甲基化检测方法-CN202111398746.9有效
发明人： 陈澍宜 -专利权人：竹石生物科技（苏州）有限公司
申请日： 2021-11-24 - 公布日： 2023-07-11 - 主分类号： C40B50/06 文献下载
摘要：本申请公开了一种DNA甲基化测序文库及制备方法和甲基化检测方法。本申请在建立测序文库时先采用核酸外切酶切除双链DNA的突出末端，在加上内参DNA和测序用接头序列之后，利用酶转化和PCR扩增法来建立DNA甲基化测序文库，因此，本申请能够避免采用未甲基化的dNTP进行末端修复时所带来的测序数据冗余和甲基化失真现象。同时，本申请通过提高双链DNA的建库起始量来弥补由于末端切除而造成的DNA整体数据量降低的现象，因此，本申请最终测得的DNA甲基化水平非常接近于真实的甲基化水平，具有较好的甲基化测序精度。
dna 甲基化序文制备方法检测

[发明专利]病变差异位点识别方法、装置、设备和存储介质-CN202211713209.3在审
发明人：纪永坤;卢国华;陈澍宜 -专利权人：泰州竹石医学检验实验室有限公司
申请日： 2022-12-28 - 公布日： 2023-04-21 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本申请公开了病变差异位点识别方法、装置、设备和存储介质，方法包括将多个待测DNA分词序列提供给注意力网络模型；通过实施被配置为通过对序列中分词编码并进行自注意力处理以得到分词对应注意力分数和特征向量的注意力网络模型来获得各分词对应注意力分数和分词序列的特征向量；将分词序列的特征向量提供给分类识别网络模型；通过实施被配置为基于特征向量执行病变DNA和非病变DNA识别的分类识别网络模型来获得分类识别结果；根据待测DNA分词序列中各分词对应注意力分数以及分类识别结果进行比对，确定病变差异位点。本申请充分利用了DNA序列信息来寻找病变差异位点，并利用了注意力机制和神经网络分类结果，使识别能力提升。
病变差异识别方法装置设备存储介质

[发明专利]病变DNA识别方法、装置、电子设备及存储介质-CN202111429360.X在审
发明人： 陈澍宜 -专利权人：竹石生物科技（苏州）有限公司
申请日： 2021-11-29 - 公布日： 2022-02-25 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明提供一种病变DNA识别方法、装置、电子设备及存储介质，所述方法包括：获取待测DNA序列并对所述待测DNA序列进行预处理以得到多个DNA序列片段；针对每个DNA序列片段，将其输入已训练的第一神经网络模型以输出与该DNA序列片段对应的第一特征向量；针对每个第一特征向量，将其输入已训练的第二神经网络模型以输出与该第一特征向量对应的第二特征向量，并将该第一特征向量和与其对应的第二特征向量相加，以得到合并特征向量；将每个所述合并特征向量输入已训练的分类器以得到分类结果，所述分类结果指示输入的所述待测DNA序列是否为病变DNA。本发明可提高病变DNA识别的准确率。
病变 dna 识别方法装置电子设备存储介质

[发明专利]病变特异性数据筛选及处理方法、装置、设备及存储介质-CN202111439901.7在审
发明人： 陈澍宜 -专利权人：竹石生物科技（苏州）有限公司
申请日： 2021-11-30 - 公布日： 2022-02-25 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明提供一种病变特异性数据筛选及处理方法、装置、设备及存储介质，所述方法包括：对病变样本数据和对照样本数据进行预处理，得到第一病变样本读段数据集合和第一对照样本读段数据集合；基于第一病变样本读段数据集合和第一对照样本读段数据集合寻找两个集合之间的目标差异性甲基化区域，并得到表示每个目标差异性甲基化区域的第二病变样本读段数据集合和第二对照样本读段数据集合；计算每个第二病变样本读段数据和第二对照样本读段数据的甲基化连续性得分，并以第二对照样本读段数据集合作为参照以及根据甲基化连续性得分从第二病变样本读段数据集合中筛选出病变特异性数据。本发明有利于提高神经网络的训练质量和识别准确率。
病变特异性数据筛选处理方法装置设备存储介质

[发明专利]DNA甲基化测序文库及其构建方法和检测方法-CN202111398633.9在审
发明人： 陈澍宜 -专利权人：竹石生物科技（苏州）有限公司
申请日： 2021-11-24 - 公布日： 2022-02-11 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本申请公开了一种DNA甲基化测序文库及其构建方法和检测方法。本申请在建立测序文库时并未对双链DNA进行末端修复，而是先将双链DNA变性为单链DNA，然后利用该单链DNA作为建库模板并结合酶学转化法来建立DNA甲基化测序文库，因此，本申请能够避免由于进行末端修复而带来的修复碱基被测序仪读取的现象，从而避免由此造成的测序数据冗余现象。另外，本申请并未采用未甲基化的dNTPs进行末端修复，不会在末端引入新的甲基化水平，从而不会引起测得的甲基化水平失真现象。
dna 甲基化序文及其构建方法检测

[发明专利]DNA甲基化测序文库及制备方法和DNA甲基化检测方法-CN202111398632.4在审
发明人： 陈澍宜 -专利权人：竹石生物科技（苏州）有限公司
申请日： 2021-11-24 - 公布日： 2022-01-25 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本申请公开了一种DNA甲基化测序文库及制备方法和DNA甲基化检测方法。本申请在建立测序文库时采用全甲基化的dNTP对双链DNA进行末端修复，然后利用酶转化和PCR扩增来建立DNA甲基化测序文库，因此，本申请能够避免仅采用未甲基化的dNTP进行末端修复时所带来的测序数据冗余现象。另外，末端修复后所引入的甲基化水平很容易从甲基化检测结果中进行剔除，故本申请虽然进行了末端修复，但是最终不会产生由于末端修复而导致的甲基化信息干扰，从而不会造成甲基化水平失真现象。
dna 甲基化序文制备方法检测

[发明专利]一种药物组合物及其在制备治疗非小细胞肺癌的药物方面的应用-CN202111273210.4在审
发明人： 陈澍宜;王谦;杨光辉 -专利权人：诺恩生物科技(苏州)有限公司
申请日： 2021-10-29 - 公布日： 2022-01-04 - 主分类号： A61K31/5377 文献下载
摘要：本发明公开了一种药物组合物及其在制备治疗非小细胞肺癌的药物方面的应用，所述药物组合物的药学有效成分包括第一组分和第二组分，其中，第一组分为吉非替尼，第二组分为具有通式(Ⅰ)所示结构的化合物A，化合物A能够增强吉非替尼对EGFR‑突变的NSCLC细胞的活性、侵袭和迁移的抑制能力，并增强吉非替尼对EGFR‑突变的NSCLC细胞凋亡的促进能力，通过化合物A与吉非替尼联合使用，有效拓展了吉非替尼的应用范围，改善NSCLC患者对吉非替尼的原发性耐药和获得性耐药，有利于提高吉非替尼对NSCLC患者的治疗效果，对吉非替尼在NSCLC治疗方面的临床应用具有重要价值。
一种药物组合及其制备治疗细胞肺癌方面应用