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[发明专利]在样品处理和检测期间为受控环境实现屏障-CN202310735022.1在审
发明人：内森·贝克特;内森·卡斯韦尔 -专利权人： 阿尔缇玛基因组学公司
申请日： 2019-12-06 - 公布日： 2023-09-19 - 主分类号： B01L1/02 文献下载
摘要：本文提供了用于处理和/或检测样品的方法。方法可包括在第一区域和第二区域之间提供屏障，其中第一区域包含样品，其中屏障将第一区域保持在与第二区域的第二气氛不同的第一气氛下，其中屏障的一部分包括相干运动的流体；和使用至少部分地包含在第一区域中的检测器来检测来自样品的一个或多个信号，同时将第一区域保持在与第二区域的第二气氛不同的第一气氛下。包含流体的屏障部分可具有低于第一气氛、第二气氛或两者的压力。
样品处理检测期间受控环境实现屏障

[发明专利]用于高通量测序的方法、系统和设备-CN202180080356.9在审
发明人：吉拉德·阿莫吉;内森·贝克特;马克·普拉特;阿纳托利·A·苏尔杜托维奇;内森·卡斯韦尔;帕特里克·D·金尼 -专利权人： 阿尔缇玛基因组学公司
申请日： 2021-09-30 - 公布日： 2023-08-08 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本文提供了用于诸如在工业规模上的高通量测序的方法、系统和设备。测序系统和/或设备可以包括一个或多个站，所述一个或多个站可以与一个或多个其他站并行和/或独立地操作。
用于通量方法系统设备

[发明专利]用于标记生物分子的试剂-CN202180071310.0在审
发明人：琳达·G·李;史蒂文·孟肯 -专利权人： 阿尔缇玛基因组学公司
申请日： 2021-08-17 - 公布日： 2023-07-11 - 主分类号： A61K49/00 文献下载
摘要：本公开提供了用于标记底物例如核苷酸、蛋白质、抗体、脂质和细胞的标记试剂。本文提供的标记试剂可包括荧光标记和半刚性接头。本文还提供了使用包含此类标记试剂的材料的核酸测序方法。还提供了用于使用能量转移同时标记多种底物的标记试剂。
用于标记生物分子试剂

[发明专利]在样品处理和检测期间为受控环境实现屏障-CN201980091436.7有效
发明人：内森·贝克特;内森·卡斯韦尔 -专利权人： 阿尔缇玛基因组学公司
申请日： 2019-12-06 - 公布日： 2023-07-11 - 主分类号： B01L1/02 文献下载
摘要：本文提供了用于处理和/或检测样品的方法。方法可包括在第一区域和第二区域之间提供屏障，其中第一区域包含样品，其中屏障将第一区域保持在与第二区域的第二气氛不同的第一气氛下，其中屏障的一部分包括相干运动的流体；和使用至少部分地包含在第一区域中的检测器来检测来自样品的一个或多个信号，同时将第一区域保持在与第二区域的第二气氛不同的第一气氛下。包含流体的屏障部分可具有低于第一气氛、第二气氛或两者的压力。
样品处理检测期间受控环境实现屏障

[发明专利]用于表面扩增的组合物及其用途-CN202180072129.1在审
发明人：弗洛里安·奥博尔斯特拉斯;西奥·尼基福罗夫;马克·斯泰普尔顿;丹尼尔·马祖尔;吉拉德·阿莫吉;伊什明德·曼;昌丹·希;本杰明·施罗德 -专利权人： 阿尔缇玛基因组学公司
申请日： 2021-08-20 - 公布日： 2023-06-13 - 主分类号： C12N9/00 文献下载
摘要：本公开提供了用于富集和分析例如生物样品的模板核酸分子的组合物、方法和系统。本文进一步提供了使用多个独特珠子种类的方法，每个珠子种类都包含独特的相同引物分子组。
用于表面扩增组合及其用途

[发明专利]包括可切割或可切除部分的核酸分子-CN202180026222.9在审
发明人： D·马祖尔;弗洛里安·奥博尔斯特拉斯 -专利权人： 阿尔缇玛基因组学公司
申请日： 2021-02-01 - 公布日： 2022-11-15 - 主分类号： B01J19/00 文献下载
摘要：本公开提供了包含与支持物偶联并且包含一个或多个可切割或可切除部分的核酸分子的组合物。还提供了富集并测序核酸分子的方法。
包括切割切除部分核酸分子

[发明专利]用于制备多核苷酸分子文库的方法-CN202080091919.X在审
发明人：弗洛里安·奥博尔斯特拉斯;丹尼尔·马祖尔 -专利权人： 阿尔缇玛基因组学公司
申请日： 2020-11-05 - 公布日： 2022-08-19 - 主分类号： C12Q1/6844 文献下载
摘要：本发明涉及一种通过将双链多核苷酸连接到多个不同的靶多核苷酸双链体上来生成不同多核苷酸分子文库的方法，所述双链多核苷酸包含：(a)包含退火部分和突出部分的第一链；以及(b)基本上由退火部分组成的第二链，其中所述第二链与所述第一链的所述退火部分互补并退火。
用于制备多核苷酸分子文库方法

[发明专利]使用分子条形码进行准确碱基判定的方法-CN202080056857.9在审
发明人：吉拉德·阿莫吉;伊亚尔·内斯坦;马克·普拉特 -专利权人： 阿尔缇玛基因组学公司
申请日： 2020-06-12 - 公布日： 2022-06-03 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本公开内容提供了使用分子条形码对序列进行准确碱基判定的方法。用于对核酸分子进行测序的方法可以包括：(a)使用条形码分子对来自样品的核酸分子进行条形码化，以生成包含条形码序列的条形码化核酸分子；(b)对条形码化核酸分子进行测序以生成测序信号，该测序信号包括对应于条形码序列的信号，其中该测序信号不是测序读取；(c)使用对应于条形码序列的信号将测序信号分组成组，其中给定组的测序信号包括对应于(i)对于给定组是相同的并且(ii)与其他组的条形码序列不同的条形码序列的信号；(d)处理给定组内的测序信号以生成聚集信号集，该聚集信号集不是测序读取；以及(e)将该聚集信号集组合以生成共有序列。
使用分子条形码进行准确碱基判定方法

[发明专利]RNA测序方法-CN202080063117.8在审
发明人： F·奥伯斯特拉斯;G·阿尔莫吉 -专利权人： 阿尔缇玛基因组学公司
申请日： 2020-07-10 - 公布日： 2022-04-29 - 主分类号： C12Q1/6816 文献下载
摘要：本文描述了用于确定来自mRNA分子的目的区域的序列的方法。测序的多核苷酸可以包含条形码区域、均聚物区域(例如，poly‑A区域)和与mRNA分子相关的靶区域。根据一些方法，条形码区域省去了均聚物区域中存在的相同碱基。根据一些方法，用于测序的引物的延伸在均聚物区域内停止。根据一些方法，配置测序流循环和多核苷酸的不同条形码区域，使得引物在延伸至均聚物区域之前延伸至跨多个多核苷酸的条形码区域的末端。根据一些方法，使用两个引物或可切割的引物分别对条形码区域和靶区域进行测序。
rna 方法

[发明专利]测序核酸分子的方法-CN202080049041.3在审
发明人：弗洛里安·奥博尔斯特拉斯;吉拉德·阿莫吉;琳达·李;伊莱恩·特帕格尼尔;郑根元 -专利权人： 阿尔缇玛基因组学公司
申请日： 2020-05-01 - 公布日： 2022-03-22 - 主分类号： C12Q1/6874 文献下载
摘要：本公开提供了用于核酸序列鉴定的方法。所述方法可以包括使多个核酸分子与包含一定浓度的核苷酸的反应混合物接触，这导致核酸分子的部分标记。所述方法可包括在前一测序循环中的可逆终止子的去封闭完成之前开始下一可逆终止的测序循环。
核酸分子方法

[发明专利]用于检测残留疾病的方法和系统-CN202080051437.1在审
发明人： G·阿尔莫吉;M·普拉特;O·巴拉德;S·费格勒;F·奥伯斯特拉斯 -专利权人： 阿尔缇玛基因组学公司
申请日： 2020-05-15 - 公布日： 2022-03-01 - 主分类号： C12Q1/6827 文献下载
摘要：本文描述了用于测量疾病(如癌症)水平的方法、设备和系统，例如测量来自个体的与患病组织(如癌症组织)相关的样品中的核酸分子(如无细胞DNA)的分数。还描述了用于测量个体中疾病的存在、复发、进展或消退的方法、设备和系统。某些方法包括使用与个体相关的核酸测序数据，将指示选自个体化疾病相关小核苷酸变异(SNV)基因座组合的所测序基因座衍生自患病组织的比率的信号与指示跨所选基因座的测序假阳性误差率的背景因子或指示跨所选基因座的抽样方差的噪声因子相比较。
用于检测残留疾病方法系统

[发明专利]通过合成方法的快进测序-CN202080048933.1在审
发明人： M·普拉特;G·阿尔莫吉;D·布林扎;E·特雷帕涅尔;O·巴拉德;Y·埃齐奥尼;F·奥伯斯特拉斯 -专利权人： 阿尔缇玛基因组学公司
申请日： 2020-05-01 - 公布日： 2022-02-25 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本文描述了针对多核苷酸生成偶联测序读段对的方法，以及分析偶联测序读段对的方法。可以分析偶联测序读段对来检测多核苷酸变体，包括在偶联测序读段对内不直接测序的基因座处。其他分析方法包括使用偶联测序读段对来构建或验证共有序列。可以如下针对多核苷酸生成偶联测序读段对：通过使用标记的核苷酸延伸引物，通过针对第一区域生成测序数据；使用以第二区域流动顺序提供的核苷酸进一步将引物延伸通过第二区域，其中引物延伸第二区域比引物延伸通过第一区域进行得更快；和通过使用标记的核苷酸进一步延伸引物来生成与多核苷酸的第三区域的序列相关的测序数据。
通过合成方法快进

[发明专利]用于检测核酸变体的方法-CN202080048530.7在审
发明人： Y·埃齐奥尼;S·费格勒;G·阿尔莫吉;M·普拉特;F·奥伯斯特拉斯 -专利权人： 阿尔缇玛基因组学公司
申请日： 2020-05-01 - 公布日： 2022-02-18 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本文描述了用于检测测试样品中的短遗传变体的方法。在一些示例性方法中，使用一个或匹配得分来判定短遗传变体，所述匹配得分使用从测试核酸分子获得的一个或多个测序数据集来确定，其中通过使用根据流动循环顺序在分开的核苷酸流中提供的非终止核苷酸对测试核酸分子进行测序来确定测试测序数据集。本文还描述了使用两个或更多个不同的流动循环顺序和/或每个循环具有五个或更多个核苷酸流的扩展流动循环顺序对测试核酸分子进行测序的方法。
用于检测核酸变体方法

[外观设计]样品架-CN202130601736.5有效
发明人：雅各布·沃尔夫;内森·贝克特 -专利权人： 阿尔缇玛基因组学公司
申请日： 2021-09-10 - 公布日： 2022-02-18 - 主分类号： 24-02 文献下载
摘要：1.本外观设计产品的名称：样品架。2.本外观设计产品的用途：用作样品架。3.本外观设计产品的设计要点：在于形状。4.最能表明设计要点的图片或照片：设计1立体图1。5.指定设计1为基本设计。
样品

[发明专利]用于分析物检测和分析的方法、装置和系统-CN202080036151.6在审
发明人：内森·贝克特;吉拉德·阿莫吉;内森·卡斯韦尔;雅各布·A·沃尔夫;克里斯托弗·巴比;丹尼斯·普里斯廷斯基;马克·普拉特;吉恩·波罗维;奥西普·施瓦兹;斯蒂芬妮·库贝奇卡;史蒂文·孟肯;约瑟夫·安东尼;何塞·马丁·索萨;菲利普·尤·辉·李 -专利权人： 阿尔缇玛基因组学公司
申请日： 2020-03-13 - 公布日： 2021-12-24 - 主分类号： G02B21/26 文献下载
摘要：提供了用于分析物检测和分析的系统和方法。系统可包括开放衬底。开放衬底可被配置为旋转或以其他方式移动。开放衬底可包括单独可寻址位置的阵列，其中分析物固定在其上。可以在空间上对底物进行索引以识别来自一种或多种来源的核酸分子和/或其序列，以及各自的一种或多种来源。可将包含多个探针的溶液引导遍及阵列以将多个探针中的至少一个与分析物中的至少一个偶联以形成结合探针。检测器可被配置为通过扫描衬底来检测来自结合探针的信号，同时最小化衬底的温度波动或由气泡引起的光学像差。
用于分析检测方法装置系统

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