本发明提供了玉米穗行数相关基因GRMZM2G098557的InDel分子标记及应用，位于玉米基因组Chr4:199959398bp，等位基因为5bp插入/缺失，该InDel分子标记与玉米穗行数显著相关，等位基因为5bp的插入/缺失，在供试自交系中有插入/缺失两种纯合基因型，所述5bp的序列如SEQ ID NO.1所示，其位点侧翼序列如SEQ ID NO.2所示。本发明的分子标记可用于玉米辅助育种，对加快玉米的高产育种进程具有重要意义。
本发明提供了玉米穗行数相关基因GRMZM2G098557的SNP分子标记及应用，该SNP标记为2个，所述标记分别位于玉米基因组Chr4:199959357bp和Chr4:199959358bp的位置，侧翼序列如SEQ ID No.1所示。2个SNP分子标记与玉米穗行数相关基因显著相关，第一SNP位点基因型为A/A的玉米自交系材料的穗行数高于位点基因型为G/G的玉米自交系。第二SNP位点基因型为G/G的玉米自交系材料的穗行数高于位点基因型为A/A的玉米自交系。本发明的分子标记可用于玉米辅助育种，加速玉米高产创制与新品种选育进程。
本发明公开了烟草查尔酮合成酶NtCHS1基因，编码区核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明通过实验证明，改变烟草中查尔酮合成酶基因的表达水平，可以调节烟草花色、株高以及绿原酸和芸香苷等类黄酮化合物的含量，因此，本发明构建了含有NtCHS1基因的重组表达载体、NtCHS1基因沉默载体，并转化烟草植株。本发明通过过表达或沉默技术调节NtCHS1基因的表达，可以获得花色深浅各异或株高较低的转基因烟草植株，提高了烟草的观赏价值；并且可以提高烟草中绿原酸和芸香苷合成，实现了利用烟草大量生产芸香苷和绿原酸的目的，使得烟草叶片获得了更广泛的应用，具有重大的经济价值和应用前景。
