本发明提出了一种玉米抗穗腐病的SNP位点、设计引物及其应用，涉及分子生物学技术领域。该位点包括Zm00001d053555基因，Zm00001d053555基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，Zm00001d053555基因的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示，其主要解决了现目前有关玉米穗腐病抗性品种及基因缺乏的技术问题。
本发明提供一种ZmSAUR15基因，其序列如SEQ ID NO.1所示。本发明还提供一种由ZmSAUR15基因编码的ZmSAUR15蛋白，其序列如SEQ ID NO.2所示。本发明还提供ZmSAUR15基因在提高玉米胚性愈伤组织诱导率方面的应用。本发明有效扩大了胚性愈伤组织诱导能力强的玉米种质资源的选择范围。
本发明提供了玉米穗行数相关基因GRMZM2G098557的InDel分子标记及应用，位于玉米基因组Chr4:199959398bp，等位基因为5bp插入/缺失，该InDel分子标记与玉米穗行数显著相关，等位基因为5bp的插入/缺失，在供试自交系中有插入/缺失两种纯合基因型，所述5bp的序列如SEQ ID NO.1所示，其位点侧翼序列如SEQ ID NO.2所示。本发明的分子标记可用于玉米辅助育种，对加快玉米的高产育种进程具有重要意义。
本发明公开了一种玉米抗虫和/或耐除草剂基因定向表达的基因开关系统及其构建方法和应用。该基因开关系统包括含有抗虫和/或耐除草剂基因的锁定元件，以及如SEQ ID NO.1所示开启锁定元件，并使其在特定组织中表达的核苷酸序列；SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列为位点特异性重组酶基因Cre。本发明利用玉米中内源绿色组织特异型启动子，并结合位点特异性重组系统及相关调控元件，构建玉米基因定向表达“基因开关”技术平台，实现外源基因的精准表达，为培育优质、安全、高效的转基因作物新品系提供强力技术支撑。
本发明公开了一种玉米叶斑马条纹叶色基因zb9以及与其连锁的InDel分子标记和应用。该基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，该基因在编码区第二外显子上含有一个单碱基突变，突变位点为G/A；该引物对的具体序列如SEQ ID NO.3和4所示。本发明InDel分子标记与玉米叶片斑马条纹调控基因zb9连锁紧密，可用于鉴定植株中是否含有玉米叶片斑马条纹调控突变基因zb9，检测结果可靠、简单易行。
本发明公开了一种玉米叶黄化基因oy2以及与其连锁的InDel分子标记和应用。该基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，该基因在编码区第十三个外显子上发生一个单碱基突变，突变位点为G/A；并设计了用于检测与该基因连锁的InDel分子标记的引物对，引物对的具体序列如SEQ ID NO.3和4所示。本发明InDel分子标记与玉米叶片黄化调控基因oy2连锁紧密，可用于鉴定植株中是否含有玉米叶片黄化调控突变基因oy2，检测结果可靠、简单易行。
本发明提供了玉米胚性愈伤组织诱导相关基因GRMZM2G020814的SNP分子标记及其应用，该SNP标记为3个，分别位于玉米第6号染色体164781353bp、164781655bp、164781665bp的位置，等位基因均为T和C，侧翼序列如SEQ ID No.1和2所示。3个SNP分子标记与玉米幼胚胚性愈伤组织诱导率显著相关，位点基因型为T/T的玉米自交系材料胚性愈伤组织诱导率高于位点基因型为C/C的玉米自交系材料。本发明的分子标记可用于玉米辅助育种，加速玉米幼胚高诱导率材料创制与新品种选育进程。
