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[发明专利]一种肺腺癌分子分型模型的构建方法、设备、装置以及试剂盒-CN202111459974.2在审
发明人：商骏;姜和;郑媛婷;石乐明 -专利权人：复旦大学
申请日： 2021-12-02 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： G16B40/30 文献下载
摘要：本发明涉及生物技术领域，具体涉及肺腺癌亚型分子分型模型构建方法、分型设备、装置以及试剂盒。通过测定肺腺癌患者肿瘤组织COL11A1和THBS2等基因表达值，基于PAM算法构建肺腺癌患者进行分子分型模型，根据不同分型的预后特点进行，临床个性化诊疗。本发明的优点：能够将肺腺癌患者分成稳定的两类亚型，S1(预后好)和S2(预后差)，S1亚型的分子趋近原位癌/微浸润癌，而S2亚型与原位癌/微浸润癌分子差异明显。S2亚型拥有更活跃的肿瘤纤维化细胞(CAF)，可以使用CAF抑制剂进行术后辅助治疗，为临床医生匹配药物和精准选择治疗方案提供了依据。
一种腺癌分子模型构建方法设备装置以及试剂盒

[发明专利]一组人永生化B淋巴细胞系的建立和应用-CN201711309755.X有效
发明人：石乐明;郑媛婷;侯湾湾;李斌;陈兴栋;郁颖;王久存;金力 -专利权人：复旦大学
申请日： 2017-12-11 - 公布日： 2023-04-04 - 主分类号： C12N5/0781 文献下载
摘要：本发明提供了一组人永生化B淋巴细胞系的建立和应用，具体地，本发明将4株具有亲缘关系的永生化淋巴细胞系组合用作对检测平台进行准确性评判的标准物产品，并且将4株具有亲缘关系的永生化淋巴细胞系用作表观基因组、转录组、蛋白质组、代谢物组的标准物产品时，可形成内在的量值差异梯度，用于评价组学检测的灵敏度。
一组永生淋巴细胞系建立应用

[发明专利]同卵双胞胎家系人源B淋巴细胞系全基因DNA标准物质及制备方法和应用-CN202211001242.3在审
发明人：董莲华;郑媛婷;任路瑶;方向;张雨菁;杨竞成;王霞;石乐明 -专利权人：中国计量科学研究院;复旦大学
申请日： 2022-08-19 - 公布日： 2023-03-21 - 主分类号： G16B20/50 文献下载
摘要：本发明公开了一种同卵双胞胎家系人源B淋巴细胞系全基因DNA标准物质及制备方法和应用，包括同卵双胞胎家系中父、母、子代双胞胎共4个人源B淋巴细胞系全基因DNA，其标准参考数据集为：1)四个标准物质的高置信简单变异集合；2)高置信结构变异SV信息以及对应的高置信参考基因组区域；3)高置信的5’‑甲基胞嘧啶信息，包括5mC的标称特性及丰度参考数据集。本方法制备的标准物质可以用于评估基因组测序的性能；还可用于评估测序和数据分析过程中对SNV、Indel、SV和5mC检出的真阳性、假阳性、真阴性和假阴性水平，为基因组测序技术平台、实验室、相关产品的质量控制与性能验证提供标准物质和标准参考数据。
双胞胎家系淋巴细胞系基因 dna 标准物质制备方法应用

[发明专利]同卵双胞胎家系人源B淋巴细胞系代谢物标准物质及制备方法和应用-CN202210999916.7在审
发明人：董莲华;郑媛婷;戴新华;张乃心;方向;龚晓云;杨竞成;郁颖;石乐明 -专利权人：中国计量科学研究院;复旦大学
申请日： 2022-08-19 - 公布日： 2023-01-31 - 主分类号： G01N1/28 文献下载
摘要：本发明公开了一种同卵双胞胎家系人源B淋巴细胞系代谢物标准物质及制备方法和应用，包括从同卵双胞胎家系中父、母、子代双胞胎共4个人源B淋巴细胞系中提取的代谢物，其量值为父亲、母亲、一个子代分别与另一个子代中代谢物表达的比值。本发明的同卵双胞胎家系人源B淋巴细胞系代谢物标准物质可用于对代谢组检测进行质量控制和性能评价，也可用于评估和消除多批次检测中的技术噪音，为多中心、长期大队列研究的数据整合提供质量保证。
双胞胎家系淋巴细胞系代谢物标准物质制备方法应用

[发明专利]同卵双胞胎家系人源B淋巴细胞系全转录组RNA标准物质及制备方法和应用-CN202211001239.1在审
发明人： 郑媛婷;董莲华;郁颖;方向;侯湾湾;王霞;杨竞成;刘雅晴;石乐明 -专利权人：中国计量科学研究院;复旦大学
申请日： 2022-08-19 - 公布日： 2023-01-31 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明公开了一种同卵双胞胎家系人源B淋巴细胞系全转录组RNA标准物质及制备方法和应用，该标准物质包括从同卵双胞胎家系中父、母、子代双胞胎共4个人源B淋巴细胞系中提取的全转录组RNA，其量值为父亲、母亲、一个子代分别与另一个子代中差异基因表达的比值。该标准物质来自健康人的血液中永生化的B淋巴细胞系，与真实样本具有极高的相似度，可体现真实样本的质量结果。该标准物质一套有4个样本，标准数据集有一套3个样本对比值，可通过多个样本实现对转录组测序数据的评估；该标准数据集是基于两种不同测序技术原理获得的9,000‑11,000个基因表达水平的比值，更适用于转录组测序中对多基因的表达结果的评估。
双胞胎家系淋巴细胞系转录 rna 标准物质制备方法应用

[发明专利]同卵双胞胎家系人源B淋巴细胞系蛋白质组标准物质及制备方法和应用-CN202211003356.1在审
发明人： 郑媛婷;丁琛;戴新华;董莲华;石乐明;方向 -专利权人：中国计量科学研究院;复旦大学
申请日： 2022-08-19 - 公布日： 2022-12-02 - 主分类号： G01N1/28 文献下载
摘要：本发明公开了一种同卵双胞胎家系人源B淋巴细胞系蛋白质组标准物质及制备方法和应用，该标准物质包括从同卵双胞胎家系中父、母、子代双胞胎共4个人源B淋巴细胞系中提取的总蛋白质，其量值为父亲、母亲、一个子代分别与另一个子代中差异基因表达的比值。该标准物质来自健康人的血液中永生化的B淋巴细胞系，与真实样本具有极高的相似度，可体现真实样本的质量结果。该标准物质一套有4个样本，标准数据集有一套3个样本对比值，可通过多个样本实现对数据的评估；该标准数据集是基于两种不同技术获得的多个蛋白表达水平的比值，更适用于蛋白质组测序中对多个蛋白质的表达结果的评估。
双胞胎家系淋巴细胞系蛋白质标准物质制备方法应用

[发明专利]一种高通量自动化血浆小RNA文库构建方法及其应用-CN202111000539.3在审
发明人： 郑媛婷;幺欣彤;孙善月;杨竞成;任路瑶;王海燕;侯湾湾;郁颖;石乐明 -专利权人：复旦大学
申请日： 2021-08-27 - 公布日： 2022-07-29 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明提供了一种高通量自动化血浆小RNA文库构建方法及其应用，具体地涉及高通量自动化血浆小RNA文库的构建，所述高通量自动化血浆小RNA文库构建方法可用作血浆小RNA表达水平定量研究、挖掘与疾病相关的潜在生物标志物。应用本发明的优化方法，可以在一天之内对96个起始量小于5ng的微量小RNA样本完成文库构建，通过高通量测序后，可以获得质量良好的数据。经性能评估分析，本发明的技术具有良好的跨批次稳定性，对于不同生物样本小RNA表达水平的内在生物学差异具有良好的区分能力，可用于超大型队列的小RNA文库构建实验。
一种通量自动化血浆 rna 文库构建方法及其应用

[发明专利]一种抗胰腺癌药物组合物及其应用、药盒和包装件-CN201310753515.4有效
发明人： 郑媛婷;蔡卫民;李涛;邵腾飞 -专利权人：复旦大学
申请日： 2013-12-31 - 公布日： 2018-10-26 - 主分类号： A61K31/517 文献下载
摘要：本发明属于生物医药技术领域，涉及一种抗胰腺癌用药物组合物及应用、药盒和包装件。所述药物组合物、药盒及包装件含有作为联合制剂供同时、分开或顺序使用的治疗有效量的阿米洛利和治疗有效量的表皮生长因子酪氨酸激酶抑制剂厄洛替尼，其中，阿米洛利与厄洛替尼的摩尔比为500:1～1:50。本发明的药物组合物、药盒及包装件用于治疗肿瘤时，能获得优于厄洛替尼单独使用的药效，提高临床化疗的效果。
一种胰腺癌药物组合及其应用包装

[发明专利]ZFHX4作为食管癌预后诊断的生物标志物-CN201710071851.9在审
发明人：庆涛;郑媛婷;索晨;朱嗣博;张蕾;石乐明 -专利权人：复旦大学
申请日： 2017-02-09 - 公布日： 2017-05-17 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明属于基因工程及肿瘤医学技术领域，具体为ZFHX4作为食管癌预后诊断的生物标志物的用途。本发明通过检测ZFHX4基因的体细胞突变来预测食管癌患者预后。本发明确立了ZFHX4基因突变是食管癌预后差的指标之一，也可以作为新的食管癌治疗靶点。
zfhx4 作为食管癌预后诊断生物标志

[发明专利]一种治疗肿瘤的药物组合物及其制备方法-CN201510024274.9在审
发明人： 郑媛婷;李涛;蔡卫民;孙红;赵贝 -专利权人：复旦大学
申请日： 2015-01-16 - 公布日： 2016-08-10 - 主分类号： A61K31/7068 文献下载
摘要：本发明属生物医药技术领域，具体涉及一种由治疗有效量的PI3K抑制剂5-(2,6-dimorpholinopyrimidin-4-yl)-4-(trifluoromethyl)pyridin-2-amine和吉西他滨组成的药物组合物及其制备方法。本发明的药物组合物作为联合制剂供同时、分开或顺序使用用于治疗肿瘤，经体外实验和体内实验，结果显示，能够获得优于两种药物单独使用的药效，对细胞的抑制作用更明显，对PANC-1体内移植瘤模型的抑制作用显著强。
一种治疗肿瘤药物组合及其制备方法

[发明专利]PI3K抑制剂与紫杉醇的药物组合物及其在制备抗肿瘤药物中的应用-CN201510023509.2在审
发明人： 郑媛婷;赵贝;蔡卫民;李涛;孙红 -专利权人：复旦大学
申请日： 2015-01-16 - 公布日： 2016-08-10 - 主分类号： A61K31/5377 文献下载
摘要：本发明属生物医药技术领域，具体涉及一种由治疗有效量的PI3K抑制剂5-(2,6-dimorpholinopyrimidin-4-yl)-4-(trifluoromethyl)pyridin-2-amine和紫杉醇组成的药物组合物。本发明的药物组合物作为联合制剂供同时、分开或顺序使用用于治疗肿瘤，经体外实验和体内实验，结果显示，能够获得优于两种药物单独使用的药效，对细胞的抑制作用更明显，对PANC-1体内移植瘤模型的抑制作用显著强。本发明的药物组合物可用于制备治疗肿瘤的药物。
pi3k 抑制剂紫杉醇药物组合及其制备肿瘤中的应用

[发明专利]一种对高通量RNA测序数据的质量控制方法及装置-CN201410409210.6在审
发明人：郁颖;庆涛;赵琛;杜婷婷;郑媛婷;石乐明 -专利权人：复旦大学
申请日： 2014-08-19 - 公布日： 2016-02-24 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明属于高通量RNA测序技术领域，公开了一种通过加入外源参照物对高通量RNA测序数据进行质量评估和质量控制的方法，其包括：系统评估外源参照序列在测定样品中的比例、定量水平、基因覆盖度及测序错误率等特征，以及评估批次效应并在此基础上优化数据分析方案。本发明还公开了一种对高通量测序进行质量控制的装置，包括：基因表达测算单元、相关性分析单元、基因覆盖度分析单元和碱基错误率分析单元。本发明可以针对RNA质量、转录组测序实验过程及数据分析流程等多个环节进行质量控制，从而大幅提高高通量测序数据的可靠性和可重复性。
一种通量 rna 序数质量控制方法装置

[发明专利]用于药物代谢及药效、毒性评价的代谢酶-水凝胶体系-CN201310310303.9在审
发明人：杨慧莹;蔡卫民;郑媛婷 -专利权人：复旦大学
申请日： 2013-07-23 - 公布日： 2015-02-11 - 主分类号： C12N11/08 文献下载
摘要：本发明属医药技术领域，涉及一种用于药物代谢及药效、毒性评价的代谢酶-水凝胶体系；该体系由药物代谢酶和水凝胶载体组成；其中，药物代谢酶由微粒体、重组酶等具有代谢功能的蛋白质大分子构成；水凝胶载体由普郎尼克、丙烯酰胺和双丙烯酰胺通过过硫酸铵、N,N,N',N'-四甲基二乙胺的催化，聚合而成；交联后的水凝胶载体在清洗、冻干等预处理后，吸附可控浓度的药物代谢酶，形成代谢酶-水凝胶体系。该代谢酶-水凝胶体系机械强度适宜、无毒、重现性好、操作简便、且具有温敏性，可全面预测药物及其代谢物对细胞的作用，进而进行药效或毒性的准确评价。
用于药物代谢药效毒性评价凝胶体系

[发明专利]一种抗肺癌药物组合物及其应用、药盒和包装件-CN201310753527.7有效
发明人： 郑媛婷;蔡卫民;李涛;邵腾飞;周宁;杨慧莹 -专利权人：复旦大学
申请日： 2013-12-31 - 公布日： 2014-07-23 - 主分类号： A61K45/00 文献下载
摘要：本发明属于生物医药技术领域，涉及一种抗肺癌用药物组合物及应用、药盒和包装件。所述药物组合物、药盒及包装件含有作为联合制剂供同时、分开或顺序使用的治疗有效量的阿米洛利和治疗有效量的表皮生长因子酪氨酸激酶抑制剂EGFR-TKI，包括但不仅限于厄洛替尼、吉非替尼；其中，所述阿米洛利与EGFR-TKI的摩尔比为500:1～1:50。本发明所述的药物组合物、药盒及包装件用于治疗肿瘤时，能获得优于EGFR-TKI单独使用的药效，并且对由于K-ras突变而导致EGFR-TKI耐药的肿瘤也有疗效。
一种肺癌药物组合及其应用包装

[发明专利]23-HBA在制备降低阿霉素所致心脏毒性的药物中的应用-CN201010514113.5无效
发明人：王广基;郝刚;周芳;吴晓兰;郑媛婷;叶文才;朱萱萱;阿基业;张经纬;刘林生;张筱璇;周颖;孙渊;罗丹;季玮 -专利权人：中国药科大学
申请日： 2010-10-21 - 公布日： 2011-02-02 - 主分类号： A61K31/56 文献下载
摘要：本发明涉及天然药物领域，具体涉及23-羟基白桦酸(23-HBA)在制备降低阿霉素所致心脏毒性的药物中的应用，本发明公开了23-羟基白桦酸与阿霉素联合用药时可以降低肿瘤小鼠心脏组织中阿霉素的浓度，逆转阿霉素所致的心肌毒性，改善心脏功能，从而可以用于抗肿瘤药物阿霉素的心肌保护剂。
23 hba 制备降低阿霉素所致心脏毒性药物中的应用

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