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[发明专利]一种可控负载治疗性核苷类似物的RNA佐剂及其制备方法和应用-CN202310536645.6在审
发明人： 樊春海;姚广保;戴琨 -专利权人：上海交通大学
申请日： 2023-05-12 - 公布日： 2023-10-10 - 主分类号： A61K39/39 文献下载
摘要：本发明属于医药化学和生物技术领域，尤其涉及一种负载治疗性核苷类似物的RNA佐剂及其制备方法和应用，例如用于肿瘤的干扰素疗法的化学疗法的联合治疗，负载治疗性核苷类似物的RNA佐剂中，RNA佐剂为单链二维RNA纳米结构，RNA佐剂的单链中掺杂有治疗性核苷类似物。本发明负载治疗性核苷类似物的RNA佐剂不仅具有治疗性核苷类似物对肿瘤细胞的杀伤作用，同时还保持了RNA佐剂免疫激活的功能，能够诱导肿瘤细胞自分泌干扰素，激活一系列干扰素抗癌功能，并增强敏化了化疗效果，实现了肿瘤细胞的联合杀伤。
一种可控负载治疗核苷类似物 rna 佐剂及其制备方法应用

[发明专利]一种基于可控边长RNA纳米结构的巨噬细胞激活剂及其在实体瘤治疗的应用-CN202310536648.X在审
发明人： 樊春海;姚广保;戴琨 -专利权人：上海交通大学
申请日： 2023-05-12 - 公布日： 2023-09-08 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于可控边长RNA纳米结构的巨噬细胞激活剂及其在实体瘤治疗的应用，所述RNA纳米结构可以实现实体瘤免疫微环境的调控，实现了强于polyIC的先天免疫激活效果，并增强了aPD‑L1免疫疗法的治疗效果。
一种基于可控边长 rna 纳米结构巨噬细胞激活剂及其实体治疗应用

[发明专利]一种用于急性肾损伤的早期诊断的可编程DNA四面体纳米器件及其制备方法以及应用-CN202210043402.4有效
发明人： 樊春海;丁飞;张霜叶;赵紫微;葛志磊;李茜 -专利权人：上海交通大学
申请日： 2022-01-14 - 公布日： 2023-09-08 - 主分类号： G01N21/64 文献下载
摘要：本发明提供一种用于急性肾损伤的早期诊断的可编程DNA四面体纳米器件及其制备方法以及应用，所述DNA四面体纳米器件由DNA四面体、Kim‑1结合肽、近红外荧光分子组装而成，所述DNA四面体纳米器件可对肾损伤分子KIM‑1高保真度成像，用于急性肾损伤的早期诊断。本发明通过在DNA四面体上集成NIR荧光模块和Kim‑1靶向模块构建了一种框架核酸成像平台Kim‑TDF，工程Kim‑TDF在健康和AKI模型中的不同肾脏清除动力学允许原位锚定Kim‑1的细胞膜的高保真度荧光成像，从而实现比Kim‑1尿液分析至少提前6小时的无创AKI早期诊断。
一种用于急性损伤早期诊断可编程 dna 四面体纳米器件及其制备方法以及应用

[发明专利]一种基于点扫描策略的超分辨显微成像方法-CN202111284795.X有效
发明人： 樊春海;高兆帅;康斌 -专利权人：上海交通大学;南京大学
申请日： 2021-11-01 - 公布日： 2023-09-08 - 主分类号： G01N21/64 文献下载
摘要：本发明提供一种基于点扫描策略的超分辨显微成像方法，包括：获取特定功率下扫描关闭显微镜的理想点扩散函数；扫描关闭显微镜的结构与共聚焦显微镜相同且其激光功率大于共聚焦显微镜；激光功率为使得点扩散函数为共聚焦光斑的小半部分时的激光功率；利用荧光探针对待测样品进行标记；利用激光功率在共聚焦显微镜上获取待测样品的原始测量图像；对原始测量图像进行处理，得到最终的超分辨图像。本发明的图像获取是在现有的共聚焦显微镜进行的，显微镜硬件方面无任何改进，仅仅需要对用于激发的激光功率进行提高以获得荧光关闭效应，获取一个方向的高分辨图像，然后变换扫描方向，获取多个方向的超分辨信息，最后通过配套的软件重建超分辨图像。
一种基于扫描策略分辨显微成像方法

[发明专利]一种基于DNA编码的受体配体编程细胞外囊泡和细胞相互作用的方法-CN202310415585.2在审
发明人：王凯喆;魏雨涵;闫庆龙;李江;王丽华;樊春海 -专利权人：祥符实验室
申请日： 2023-04-18 - 公布日： 2023-08-18 - 主分类号： C12N5/09 文献下载
摘要：本发明提供一种基于DNA编码的受体配体编程细胞外囊泡和细胞相互作用的方法，所述方法包括：将胆固醇修饰的DNA单链作为配体通过与细胞外囊泡震荡，插入到细胞外囊泡磷脂双分子层中；将三条胆固醇修饰的DNA单链和一条含有与配体互补配对序列的DNA混合，退火，形成具有DNA四面体结构的受体；所述受体通过三个顶点的胆固醇插入到细胞膜中，识别DNA配体功能化的细胞外囊泡，从而实现细胞对不同来源的细胞外囊泡的高效、特异性摄取。根据本发明，提供了一种可编程、通用、高效、特异性的细胞外囊泡与细胞相互作用的操控方法，为活细胞递送、细胞通讯调控等应用提供了一种新工具。
一种基于 dna 编码受体编程细胞外囊泡相互作用方法

[发明专利]一种用于增强超短cfDNA转化率的方法-CN202310383077.0在审
发明人：宋萍;赵海培;樊春海 -专利权人：上海交通大学
申请日： 2023-04-11 - 公布日： 2023-07-28 - 主分类号： C12Q1/686 文献下载
摘要：本发明提供一种用于增强超短cfDNA转化率的方法，所述方法包括：1)缩短引物长度至10～20bp，2)给所述引物加上TAG平衡缩短引物对扩增效率的影响，给所述引物加上TAG后使引物的吉布斯自由能变化量在‑12至‑4.6kcal/mol之间，3)Tag联合抑制探针，4)降低qPCR退火温度，从而实现超短cfDNA的高转化率检测。根据本发明提供的一种用于增强超短cfDNA转化率的方法，不仅提高了血浆样本中超短cfDNA检测的转化率，而且提高了cfDNA对疾病检测的灵敏度，根据本发明提供的方法还有望应用于高灵敏癌症筛查试剂盒或分析方法的开发。
一种用于增强超短 cfdna 转化方法

[发明专利]一种基于同步光源的X射线点击化学标记探针及其制备方法以及应用-CN202310182703.X在审
发明人：蔡小青;诸颖;汤乔伟;殷大鹏;张继超;樊春海 -专利权人：中国科学院上海高等研究院
申请日： 2023-03-01 - 公布日： 2023-07-21 - 主分类号： G01N23/223 文献下载
摘要：本发明提供一种基于同步光源的X射线点击化学探针及其制备方法以及应用，包括：1)合成一种聚多巴胺表面修饰有点击反应所需基团的聚多巴胺‑金属；2)在培养有细胞的培养基中加入修饰试剂以修饰可靶向各种亚细胞器的生物分子；3)将步骤1)合成得到的聚多巴胺‑金属加入步骤2)修饰之后的培养基中，至点击反应完成；4)将步骤3)中得到的细胞滴加在适用于同步辐射X射线成像的基底上，在同步辐射X射线下成像观察，细胞内生物分子在X射线下具有特异性的吸收峰，即得。根据本发明，提供了一种基于点击化学和同步X射线的对细胞内多种生物分子进行高特异性识别和高分辨率成像的方法，具有良好的生物医学应用前景。
一种基于同步光源射线点击化学标记探针及其制备方法以及应用

[发明专利]一种用于人脑组织成像的同步辐射X射线成像染色方法-CN202310340808.3在审
发明人：王丽华;周峰;蔡小青;诸颖;胡钧;樊春海 -专利权人：中国科学院上海高等研究院
申请日： 2023-03-31 - 公布日： 2023-07-14 - 主分类号： G01N1/30 文献下载
摘要：本发明提供一种用于人脑组织成像的同步辐射X射线成像染色方法，包括以下步骤：1)提供低温冷冻环境，其温度范围为4℃～‑196℃；2)获取捐赠人脑组织，将其低温冷冻保存6h～24h；3)配制高尔基染色液，将获得的人脑组织浸染于其中1天～365天；4)对人脑组织进行包埋、切片；5)还原显黑、脱水、透明和封片；6)光学显微镜成像观察和/或同步辐射X射线成像观察。本发明将低温冷冻保存方法与优化后的高尔基染色方法相结合，首次实现了人脑组织上的有效染色，提高了神经元的标记效率，实现了人脑组织神经元形态及连接的同步辐射X射线成像，该方法有望为人脑同步辐射X射线介观联接图谱的绘制提供染色方法。
一种用于人脑组织成像同步辐射射线染色方法

[发明专利]一种框架核酸的电化学制备方法及其应用-CN202111255391.8有效
发明人：沈建磊;李茜;翟婷婷;孙晨蕴;樊春海 -专利权人：上海交通大学
申请日： 2021-10-27 - 公布日： 2023-07-14 - 主分类号： C25B3/07 文献下载
摘要：本发明提供一种框架核酸的电化学制备方法及其应用，包括：电化学装置的构建：电化学装置通过PDMS层与玻璃片层粘贴而成，包括：反应区和控制区，以银/氯化银为工作电极，以氧化铱为参比电极、铱为对电极；框架核酸的自组装：通过电化学策略构建形貌、生物化学性质可设计的框架核酸，提供所需的DNA单链，加入反应区，通过向工作电极施加一定的电位使反应区内发生水的氧化反应，溶液pH降低，发生DNA变性；通过向工作电极施加另一电位使反应区内发生水的还原反应，溶液pH升高，发生DNA复性，实现框架核酸的电化学自组装。本发明利用控制工作电极电位可快速精准调控溶液pH的特点，从而得到一系列尺寸及特定官能团修饰的框架核酸。
一种框架核酸电化学制备方法及其应用

[发明专利]一种DNA数据存储的选择性访问方法-CN202310366711.X在审
发明人： 樊春海;宋萍;翁智;司云培 -专利权人：祥符实验室
申请日： 2023-04-07 - 公布日： 2023-07-11 - 主分类号： G16B50/00 文献下载
摘要：本发明提供一种DNA数据存储的选择性访问方法，包括以下步骤：S1：基于二进制与DNA碱基的映射关系，将数字信息转化为DNA序列；S2：基于GC含量、均聚物、引物结合自由能变化ΔG、自身互补性、以及二级结构的综合考量设计引物组；S3：合成DNA序列；S4：选择待访问文件的相对应引物组，通过多重PCR选择性扩增待访问内容的DNA序列；S5：通过测序读取DNA序列信息；S6：对读取的DNA序列信息进行解码，恢复文件。本发明基于对GC含量、均聚物、引物结合自由能变化ΔG、自身互补性、以及二级结构的一系列综合考量设计PCR引物的方法，最终实现对DNA数据库中目标文件的低成本的、高准确度的、快速的读取。
一种 dna 数据存储选择性访问方法

[发明专利]一种基于同步辐射光源的X射线荧光及荧光的双模态成像探针、制备方法及应用-CN202111494793.3有效
发明人：王丽华;樊春海;孙艳红;闫美玲;诸颖 -专利权人：中国科学院上海高等研究院
申请日： 2021-12-08 - 公布日： 2023-07-07 - 主分类号： A61K49/04 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于同步辐射光源的X射线荧光及荧光的双模态成像探针、制备方法及应用。所述双模态成像探针是一种藻红B‑免疫球蛋白G复合物，通过免疫球蛋白G的酪氨酸氨基与藻红B的活化羧基共价偶联而成，所述藻红B‑免疫球蛋白G复合物同时具有荧光信号和X射线荧光信号。针对现有技术一直缺乏特异性同步辐射X射线荧光成像探针的问题，本发明首次创造性地提出这样一种藻红B‑免疫球蛋白G复合物及其制备方法，并由此提供了一种目标神经元双模态成像方法，对神经元成像以及同步辐射光源在生物医学领域的研究都具有重要的意义和应用价值。
一种基于同步辐射光源射线荧光双模成像探针制备方法应用

[发明专利]一种用于模拟DNA链置换的亚微米元DNA系统的制备方法及其应用-CN202310435275.7在审
发明人： 樊春海;姚广保;齐美园 -专利权人：祥符实验室;上海交通大学
申请日： 2023-04-21 - 公布日： 2023-07-04 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明提供一种用于模拟DNA链置换的亚微米元DNA系统的制备方法及其应用。包括如下步骤：A1：选择长链DNA作为支架链；A2：分别将支架链、不同类型的核心短链DNA和延伸出的元碱基DNA链混合在1×TAE缓冲液中；A3：PCR退火实现不同类型单链元DNA的组装；A4：通过加入TAE缓冲液，离心，获得单链元DNA S1、S2和S3；A5：将单链元DNA S1和部分互补单链元DNA S2以1:1混合，PCR退火，获得双链元DNA[S1:S2]。本发明的自主重构技术操作简单，特异性强，灵敏度高，适用范围广，与现有重构技术相比，本发明无需外源重构因子的引入即可实现亚微米尺度系统的自主程序化重构。
一种用于模拟 dna 置换微米系统制备方法及其应用

[发明专利]一种同步X射线可见的点击化学成像标签及其制备方法-CN202310182738.3在审
发明人：汤乔伟;诸颖;殷大鹏;蔡小青;孔华庭;樊春海 -专利权人：中国科学院上海高等研究院
申请日： 2023-03-01 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： G01N23/04 文献下载
摘要：本发明提供一种同步X射线可见的点击化学成像标签及其制备方法。制备方法包括以下步骤：1)氨水加入到乙醇溶液中，加入盐酸多巴胺溶液反应获得聚多巴胺；2)将溶液中和，超声后透析提纯聚多巴胺；3)将聚多巴胺加入氨水中，调节pH至弱碱性，加入点击反应基团修饰试剂，反应后分离提纯；4)将金属离子和所得修饰后的聚多巴胺溶解于缓冲体系中；5)反应一段时间后至化合物生成；以及6)将所得化合物的溶液滴加在基底上，在同步辐射X射线下成像观察，即得。本发明成功制备了一种同步X射线可见的点击化学成像标签，为进一步制备多种同步X射线点击化学成像探针及实现对细胞内多种生物分子进行高特异性识别和高分辨率成像打下了良好的基础。
一种同步射线可见点击化学成像标签及其制备方法

[发明专利]一种基于DNA折纸技术的分子计算方法及其应用-CN202111544719.8在审
发明人：王丽华;张祎男;尹晓尧;崔呈俊;樊春海 -专利权人：上海前瞻创新研究院有限公司;上海交通大学;军事科学院军事医学研究院生物医学分析中心
申请日： 2021-12-16 - 公布日： 2023-06-20 - 主分类号： G16B15/00 文献下载
摘要：本发明属于生物技术领域，更具体地，本发明涉及一种基于DNA折纸技术的分子计算方法及其应用。本发明提供的分子计算方法方法通过利用DNA origami在定位组件中的寻址能力以及DNA识别的可编程性来执行复杂的数学模型，用DNA组分的定位避免了可扩散链的干扰，有利于增加分子反应网络的复杂性，为促进分子计算开辟了新的途径。
一种基于 dna 折纸技术分子计算方法及其应用

[发明专利]一种DNA水凝胶介导的眼用药物输运系统及其制备方法和应用-CN201811359754.0有效
发明人： 樊春海;诸颖;任宁;夏凯;王丽华 -专利权人：中国科学院上海应用物理研究所
申请日： 2018-11-15 - 公布日： 2023-05-12 - 主分类号： A61K9/06 文献下载
摘要：本发明提供一种DNA水凝胶介导的眼用药物输运系统及其制备方法和应用，该制备方法包括以下步骤：1)将眼用药物溶解或分散于可降解的功能高分子材料中获得药物微球；2)制备DNA水凝胶单体；以及3)将步骤1)所得药物微球与步骤2)所得DNA水凝胶单体混合，使所述药物微球分散于所述DNA水凝胶单体中，DNA水凝胶单体间通过DNA连接酶或交联链碱基互补配对自组装，即得。根据本发明提供的一种基于DNA水凝胶的眼用药物输运系统能够高效装载药物，增加药物在眼部的富集并延长滞留时间，从而显著提高对眼科疾病的治疗效果，具有良好的医学应用前景。
一种 dna 凝胶用药输运系统及其制备方法应用

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