本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种脂肪酶基因、脂肪酶及其应用。本发明脂肪酶基因Lrl‑op,其GC含量为51%,密码子适应指数为0.84,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明脂肪酶基因Lrl‑op,是根据毕赤酵母密码子的偏好性,通过对多枝横梗霉基因组序列进行综合优化得到。本发明脂肪酶LRL是一种1,3位特异性脂肪酶,其氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示。本发明不仅丰富了脂肪酶的种类和来源途径,而且脂肪酶LRL的酶活性较高,热稳定性和pH稳定性较好,可用于分解甘油酯和/或油脂改性。