本发明公开一种自校准的12 bit SAR ADC结构及自校准方法,属于模拟数字转换技术领域。该自校准的12 bit SAR ADC结构包括自校准电容阵列、选择开关S[6:0]、比较器、分压电阻串、寄存器和两个逻辑控制模块。其中,自校准电容阵列下极板接比较器的负端或共模电平VCOM,上极板通过选择开关S[6:4]接输入电压VREF或者VSS;其最低位的电容上极板通过选择开关S[3:0]选择分压系数连接到分压电阻串上;比较器的输出端连接寄存器,寄存器与两个逻辑控制模块相连。本发明还提供了12 bit SAR ADC结构的自校准方法,能够精准的消除比较器的失调,还能够将失调以校准码的方式呈现出来,依据校准码计算出比较器的内部失调电压,判断失调的大小是否能够接受以及失调是否被完全消除。