[发明专利]一种用于检测桃拉综合征病毒的CRISPR-Cas13a等温检测引物组及应用在审
申请号: | 202110585330.1 | 申请日: | 2021-05-27 |
公开(公告)号: | CN113186352A | 公开(公告)日: | 2021-07-30 |
发明(设计)人: | 黄俊;张徐俞;李业;杨稳;付媛媛;朱凝瑜;郑晓叶;俞晓平;骆志成;樊伟东 | 申请(专利权)人: | 杭州奥盛仪器有限公司;浙江科技学院;浙江省水产技术推广总站 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州天勤知识产权代理有限公司 33224 | 代理人: | 沈金龙 |
地址: | 310000 浙江省杭*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 综合征 病毒 crispr cas13a 等温 引物 应用 | ||
1.一种用于检测桃拉综合征病毒的CRISPR-Cas13a等温检测引物组,其特征在于,包括一个包含三条crRNA的crRNA组和一个RNA探针,三条crRNA分别命名为:TSV-crRNA3、TSV-crRNA5和TSV-crRNA7,RNA探针命名为TSV-Probe,核苷酸序列分别为:
TSV-crRNA3:GAUUUAGACUACCCCAAAAACGAAGGGGACUAAAACAGCAAATCACACTGTTCACACTTGAAGA;
TSV-crRNA5:GAUUUAGACUACCCCAAAAACGAAGGGGACUAAAACGTGGGGAGCTTAAACTGGACACACTGTG;
TSV-crRNA7:GAUUUAGACUACCCCAAAAACGAAGGGGACUAAAACTATTTTCTCGCTCAATTTCCTCACACAA;
TSV-Probe:Fam-rUrUrUrUrU-BHQ1。
2.如权利要求1所述的CRISPR-Cas13a等温检测引物组在制备用于检测桃拉综合征病毒的试剂盒中的应用。
3.一种用于检测桃拉综合征病毒的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的CRISPR-Cas13a等温检测引物组。
4.如权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,还包括阳性对照,所述阳性对照为含有桃拉综合征病毒的RNA片段,序列如SEQ ID No.1所示。
5.一种非疾病诊断为目的的检测桃拉综合征病毒的方法,其特征在于,使用权利要求3或4所述试剂盒,所述方法包括以下步骤:
(1)待检样品RNA的提取;
(2)CRISPR等温检测反应,以步骤(1)提取的待检样品RNA作为模板,使用权利要求1所述的CRISPR-Cas13a等温检测引物组进行等温扩增反应,等温扩增反应使用等温扩增仪;
(3)结果判断:通过等温扩增仪自行分析反应中的荧光变化来判断反应扩增结果,仪器软件界面出现扩增曲线为阳性,表明待检样品含有桃拉综合征病毒;否则为阴性,表明待检样品不含桃拉综合征病毒。
6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤(1)中采用动物组织RNA提取试剂盒提取样品总RNA。
7.如权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤(2)中CRISPR等温检测反应时反应体系:10×Cas13a缓冲液2μL,Cas13a酶1μL,crRNA 1μL;RNase抑制剂1μL;TSV-Probe 0.5μL,模板1μL,用超纯水补齐至20μL。
8.如权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤(2)中等温扩增程序为:37℃反应60min。
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