[发明专利]基于片段化酶的DNA文库制备方法在审
申请号: | 202110299643.0 | 申请日: | 2021-03-22 |
公开(公告)号: | CN112680431A | 公开(公告)日: | 2021-04-20 |
发明(设计)人: | 赵曼曼;申冕;位小丫;张清仪;郑紫君 | 申请(专利权)人: | 吴江近岸蛋白质科技有限公司 |
主分类号: | C12N9/22 | 分类号: | C12N9/22;C07K19/00;C12N15/62;C12Q1/6806 |
代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 徐迅;马莉华 |
地址: | 215200 江苏省苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 片段 dna 文库 制备 方法 | ||
1.一种片段化酶,其特征在于,所述的片段化酶为H1组蛋白元件和FokI蛋白元件融合形成的融合蛋白,所述融合蛋白具有式I结构:
Z0―Z1―L2―Z2 (I)
式中,
Z0为无,或者选自:信号肽、标签序列、或其组合;
Z1为H1组蛋白元件;
Z2为FokI蛋白元件;
L2为无;
“―”为键;其中,
所述的H1组蛋白元件具有如SEQ ID NO:5的11-214位所示的氨基酸序列;和
所述的FokI蛋白元件具有如SEQ ID NO:5的215-410位所示的氨基酸序列。
2.如权利要求1所述的片段化酶,其特征在于,所述的片段化酶的氨基酸序列如SEQ IDNo: 5中第1-410位或SEQ ID No: 5中第11-410位所示。
3.一种片段化DNA的方法,其特征在于,包括步骤:
(a) 提供一如权利要求1-2中任一项所述的片段化酶;
(b) 将所述片段化酶与DNA样品混合反应,获得DNA片段;
其中,获得的DNA片段的长度为30-250bp。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,获得的DNA片段的长度为50-200bp。
5.如权利要求3所述的方法,其特征在于,获得的DNA片段的长度为50-150bp。
6.一种如权利要求1-2中任一项所述的片段化酶的用途,其特征在于,用于制备构建DNA测序文库的试剂;或用于对DNA样品进行片段化处理的试剂。
7.一种DNA测序文库的构建方法,其特征在于,包括步骤:
(a) 提供一基因组DNA样品;
(b) 对所述DNA样品,通过如权利要求1-2中任一项所述的片段化酶进行片段化反应,获得含有DNA片段的第一混合物;
(c) 向(b)中所述第一混合物中的DNA片段的两端添加接头,获得含末端带有接头的DNA片段的第二混合物;
(d) 用特异性引物对上一步骤中获得的末端带有接头的DNA片段进行扩增,从而获得所述DNA测序文库,其中,所述特异性引物为特异性扩增所述第二混合物中的末端带有接头的DNA片段的引物。
8.如权利要求7所述的构建方法,其特征在于,步骤(b)和(c)在同一反应体系中同时、或先后进行。
9.一种构建DNA测序文库的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:
(Z1) 如权利要求1-2任一项所述的片段化酶;
(Y) 说明书,所述的说明书记载了使用方法。
10.一种核酸分子,其特征在于,所述核酸分子编码如权利要求1所述的片段化酶。
11.一种载体,其特征在于,所述载体含有如权利要求10所述的核酸分子。
12.一种宿主细胞,其特征在于,所述宿主细胞含有如权利要求11所述的载体,或染色体中整合有外源的如权利要求10所述核酸分子,或表达如权利要求1所述的片段化酶。
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