[发明专利]基于片段化酶的DNA文库制备方法在审

专利信息
申请号: 202110299643.0 申请日: 2021-03-22
公开(公告)号: CN112680431A 公开(公告)日: 2021-04-20
发明(设计)人: 赵曼曼;申冕;位小丫;张清仪;郑紫君 申请(专利权)人: 吴江近岸蛋白质科技有限公司
主分类号: C12N9/22 分类号: C12N9/22;C07K19/00;C12N15/62;C12Q1/6806
代理公司: 上海一平知识产权代理有限公司 31266 代理人: 徐迅;马莉华
地址: 215200 江苏省苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 基于 片段 dna 文库 制备 方法
【权利要求书】:

1.一种片段化酶,其特征在于,所述的片段化酶为H1组蛋白元件和FokI蛋白元件融合形成的融合蛋白,所述融合蛋白具有式I结构:

Z0―Z1―L2―Z2 (I)

式中,

Z0为无,或者选自:信号肽、标签序列、或其组合;

Z1为H1组蛋白元件;

Z2为FokI蛋白元件;

L2为无;

“―”为键;其中,

所述的H1组蛋白元件具有如SEQ ID NO:5的11-214位所示的氨基酸序列;和

所述的FokI蛋白元件具有如SEQ ID NO:5的215-410位所示的氨基酸序列。

2.如权利要求1所述的片段化酶,其特征在于,所述的片段化酶的氨基酸序列如SEQ IDNo: 5中第1-410位或SEQ ID No: 5中第11-410位所示。

3.一种片段化DNA的方法,其特征在于,包括步骤:

(a) 提供一如权利要求1-2中任一项所述的片段化酶;

(b) 将所述片段化酶与DNA样品混合反应,获得DNA片段;

其中,获得的DNA片段的长度为30-250bp。

4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,获得的DNA片段的长度为50-200bp。

5.如权利要求3所述的方法,其特征在于,获得的DNA片段的长度为50-150bp。

6.一种如权利要求1-2中任一项所述的片段化酶的用途,其特征在于,用于制备构建DNA测序文库的试剂;或用于对DNA样品进行片段化处理的试剂。

7.一种DNA测序文库的构建方法,其特征在于,包括步骤:

(a) 提供一基因组DNA样品;

(b) 对所述DNA样品,通过如权利要求1-2中任一项所述的片段化酶进行片段化反应,获得含有DNA片段的第一混合物;

(c) 向(b)中所述第一混合物中的DNA片段的两端添加接头,获得含末端带有接头的DNA片段的第二混合物;

(d) 用特异性引物对上一步骤中获得的末端带有接头的DNA片段进行扩增,从而获得所述DNA测序文库,其中,所述特异性引物为特异性扩增所述第二混合物中的末端带有接头的DNA片段的引物。

8.如权利要求7所述的构建方法,其特征在于,步骤(b)和(c)在同一反应体系中同时、或先后进行。

9.一种构建DNA测序文库的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:

(Z1) 如权利要求1-2任一项所述的片段化酶;

(Y) 说明书,所述的说明书记载了使用方法。

10.一种核酸分子,其特征在于,所述核酸分子编码如权利要求1所述的片段化酶。

11.一种载体,其特征在于,所述载体含有如权利要求10所述的核酸分子。

12.一种宿主细胞,其特征在于,所述宿主细胞含有如权利要求11所述的载体,或染色体中整合有外源的如权利要求10所述核酸分子,或表达如权利要求1所述的片段化酶。

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