[发明专利]一种基于Unet和超像素的脑组织分割方法在审
申请号: | 202110052435.0 | 申请日: | 2021-01-15 |
公开(公告)号: | CN112785603A | 公开(公告)日: | 2021-05-11 |
发明(设计)人: | 李孟歆;徐睿;张天慧 | 申请(专利权)人: | 沈阳建筑大学 |
主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06T7/194;G06T7/00;G06T7/66;G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 沈阳之华益专利事务所有限公司 21218 | 代理人: | 邹琳 |
地址: | 110168 辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 unet 像素 组织 分割 方法 | ||
1.一种基于Unet和超像素的脑组织分割方法,其特征在于:包括如下步骤:
步骤1:对脑MR图像进行预处理,将颅骨区域进行剔除,减小非脑组织干扰;
步骤1.1:利用区域生长法对原始脑MR图像进行预处理,获得只包含颅骨区域和背景的二分类图像;
步骤1.2:利用像素点映射的方法,将脑组织部分分离提取出来;
步骤2:搭建DA-Unet网络模型,编码器部分,采用稠密连接块特征提取,在编码器解码器中间增加空洞空间金字塔池化ASPP模块,损失函数采用Lovász Softmax loss;
步骤2.1:构建输入通道,利用3×3的卷积层进行特征提取,之后使用2×2的最大池化层降低图像尺寸;
步骤2.2:利用稠密连接块构建DA-Unet编码器部分,每个稠密连接块包含数个卷积层,每个卷积层的输入是之前所有层输出的拼接,卷积层的构成顺序是批标准化、激活函数ReLU、卷积,稠密连接块内任意两层之间相互连接,确保各层间能最大量的信息流动,稠密块每层由一个1×1卷积和一个3×3卷积组成,将3个稠密连接块利用1×1卷积和一个步长为2的2×2平均池化层相来连接,之后利用一个1×1卷积和一个空洞率为2的3×3空洞卷积连接第4个稠密连接块,以上部分构成DA-Unet的编码器部分;
步骤2.3:在DA-Unet编码器之后,增加一个ASPP模块,ASPP模块包含一个1×1卷积层和全局平均池化层,还有3个空洞率分别为4、8、12的3×3空洞卷积层;
步骤2.4:构建DA-Unet解码器部分,在ASPP模块的输出部分,将以上五个输出在通道层相连接,经过一个1×1的卷积层来减少通道数,之后经过跳跃连接与第3块稠密连接块的输出特征图进行融合,通过3×3卷积后经2×2的上采样恢复图像尺寸,该过程反复3次后由1×1卷积层输出分割图像;
步骤2.5:损失函数进行调整,采用Lovász Softmax loss;
步骤3:使用DA-Unet网络模型,对预处理完成后的数据集进行训练、调参,得到最佳分割模型并保存;
步骤3.1:将预处理完成的脑MR图像按6:4分成训练集、测试集两部分;
步骤3.2:使用DA-Unet进行训练;
步骤3.3:输出测试集脑组织分割结果;
步骤4:对训练集脑MR图像的灰度值进行统计,构建高斯混合模型;
步骤4.1:随机抽取1/2的预处理完成脑MR图像,对其灰度值进行统计;
步骤4.2:将灰度值对应不同组织的统计结果制成直方图;
步骤4.3:利用高斯混合模型对直方图数据进行拟合;
步骤4.4:依据像素点灰度值计算每个点对不同组织的概率密度估计;
步骤5:设计概率密度加权的线性谱聚类(p-LSC)超像素算法对预处理后的脑MR图像进行分割;
步骤5.1:将每个像素点m的(gm,pm,xm,ym)特征信息映射到特征空间形成一个八维向量其中:
α、β、γ分别为所属特征类别的权重;
步骤5.2:设置种子点数量K,每个相邻种子点间固定距离水平间隔vx、竖直间隔vy;
步骤5.3:调整聚类中心,将聚类中心移动到该点3×3领域内梯度最低点;
步骤5.4:初始化聚类中心的加权均值mk和搜索中心Ck,其中:
m,n表示空间中的两个数据点,w(m)是权重,全部划分为K,πk表示第k(k=1,2,3......,K)个簇群,簇群的中心是mk,φ是映射函数;
步骤5.5:对每个像素点m设置标签L(m)=0同时初始化像素点间的距离D(m)=∞;
步骤5.6:对搜索中心Ck的τvx×τvy领域内的像素点p,计算其D值,D是特征空间中与加权均值mk的欧氏距离;
步骤5.7:如果Dd(m),那么d(m)=D,L(m)=k;
步骤5.8:更新所有类别的加权均值和搜索中心;
步骤5.9:重复步骤5.6、5.7,直至K簇的加权均值mk收敛;
步骤5.10:将小的超像素与邻近超像素进行合并;
步骤5.11:输出结果;
步骤6:使用映射方法对像素块分类完成分割;
步骤6.1:在进行超像素分割时输入DA-Unet分割结果;
步骤6.2:计算每个超像素的重心,通过像素点映射读取该像素点在DA-Unet上的分割结果,从而决定整个像素块的类别,达到分割的目的;
步骤6.3:输出结果。
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