[发明专利]一种通过肠道菌群相对丰度预测肝脏疾病的分析技术

权利要求书

1.一种肠道菌群相对丰度预测肝脏疾病的分析技术，其特征在于：包括如下步骤：

步骤一，取健康人、非酒精性脂肪肝、肝硬化、肝癌患者中段粪便并提取总RNA，通过对微生物16SrRNA基因V4可变区进行PCR扩增，进行文库构建，对微生物rRNA基因V4可变区进行测序，分析粪便中肠道菌群相对丰度；

步骤二，将上述肠道菌群相对丰度进行ROC分析，获得AUC、灵敏度、特异度和cut-off值，选取AUC0.7，相对丰度cut-off值0.001的肠道微生物作为检测指标预测肝脏疾病。

2.根据权利要求1所述的肠道菌群相对丰度预测肝脏疾病的分析技术，其特征在于：在步骤一中，取健康人、非酒精性脂肪肝、肝硬化、肝癌患者100mg中段粪便并提取总RNA。

3.根据权利要求2所述的肠道菌群相对丰度预测肝脏疾病的分析技术，其特征在于：在步骤一中，所述肝硬化患者包括代偿性肝硬化、轻度失代偿性肝硬化、重度失代偿性肝硬化患者。

4.根据权利要求3所述的肠道菌群相对丰度预测肝脏疾病的分析技术，其特征在于：经分析筛选后，作为预测非酒精性脂肪肝的肠道微生物包括：p_firmicutes，c_clostridia，o_clostridiales，f_ruminococcaceae，f_bacteroidaceae，g_bacteroides，g_lachnoclostridium，s_bacteroides_vulgatus，s_blautia_obeum，p_bacteroidetes/p_firmicutes；作为预测代偿性肝硬化的肠道微生物包括：p_proteobacteria，g_streptococcus；作为预测轻度失代偿性肝硬化的肠道微生物包括：c_clostridia，o_clostridiales，f_lachnospiraceae，g_blautia，g_unidentified_lachnospiraceae，c_bacilli，o_lactobacillales，f_streptococcaceae，g_streptococcus，s_ruminococcus_sp_5_1_39bfaa，c_negativicutes，o_selenomonadales，f_veillonellaceae，g_romboutsia，g_unidentified_ruminococcaceae，g_fusicatenibacter，s_bifidobacterium_adolescentis，s_lactobacillus_salivarius，s_blautia_obeum，o_pasteurellales，f_pasteurellaceae，g_anaerostipes，g_veillonella，f_lactobacillaceae，g_lactobacillus；作为预测重度失代偿性肝硬化的肠道微生物包括：o_enterobacteriales，f_enterobacteriaceae，c_gammaproteobacteria，g_unidentified_enterobacteriaceae，s_escherichia_coli，p_proteobacteria，c_bacilli，o_lactobacillales，f_streptococcaceae，g_streptococcus，g_veillonella，o_pasteurellales，f_pasteurellaceae，p_firmicutes，c_clostridia，o_clostridiales，f_lachnospiraceae，f_ruminococcaceae，g_faecalibacterium，p_actinobacteria，g_unidentified_lachnospiraceae，g_blautia，o_bifidobacteriales，f_bifidobacteriaceae，g_bifidobacterium，s_ruminococcus_sp_5_1_39bfaa，c_erysipelotrichia，o_erysipelotrichales，f_erysipelotrichaceae，g_romboutsia，f_bacteroidaceae，g_bacteroides，g_dorea，g_roseburia，g_fusicatenibacter，g_anaerostipes，g_unidentified_ruminococcaceae，s_bacteroides_uniformis，s_bifidobacterium_adolescentis，s_bacteroides_uniformis，f_tannerellaceae，g_parabacteroides；作为预测肝癌的肠道微生物包括：p_bacteroidetes/p_firmicutes，p_firmicutes，c_clostridia，o_clostridiales，f_lachnospiraceae，f_ruminococcaceae，p_proteobacteria，g_faecalibacterium，g_blautia，c_gammaproteobacteria，o_enterobacteriales，f_enterobacteriaceae，c_negativicutes，o_selenomonadales，c_alphaproteobacteria，f_porphyromonadaceae，g_parabacteroides，g_ruminococcus_torques_group，s_ruminococcus_sp_5_1_39bfaa，f_veillonellaceae，s_bacteroides_fragilis，o_sphingobacteriales，g_fusicatenibacter，c_erysipelotrichia，o_erysipelotrichales，f_erysipelotrichaceae，o_rhizobiales，s_parabacteroides_distasonis，g_romboutsia，s_bacteroides_plebeius，p_tenericutes，c_mollicutes，g_dorea，f_streptococcaceae，g_prevotella_9，f_rikenellaceae，g_alistipes，g_anaerostipes，g_streptococcus，g_megamonas，f_lactobacillaceae，g_lactobacillus，s_blautia_obeum，g_veillonella，g_unidentified_ruminococcaceae。