[发明专利]马短串联重复序列的复合扩增体系及检测试剂盒

说明书

本发明涉及马短串联重复序列的复合扩增体系及检测试剂盒，用于检测马基因型中具有多态性的遗传标记基因，属于生物技术领域。本发明选择了16个位于不同染色体上的具有高灵敏性及扩增特异性的马STR位点以及一个性别判定位点，分别设计引物并标记荧光基团，一次性扩增，用于马群体遗传学分析、亲子鉴定检测，具有快速、准确、灵敏度好等优点。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体来说，涉及马多个短串联重复序列的复合扩增体系及检测试剂盒。

背景技术

短串联重复序列(short tandem repeats，STR)：又称微卫星序列，是一类广泛存在于真核生物基因组中的DNA重复序列。由2～6bp的核心序列构成，重复次数通常为15～30次，具有容易通过PCR扩增、电泳分型、分布广泛、多态信息含量高、呈共显性遗传等优点。其中最显著的优点是它的共显性遗传特征，这就使得纯合子和杂合子基因型可以被区分出来，极大地增加了亲子鉴定的准确性。目前STR复合扩增分型技术已逐步取代传统的血清学方法，成为人类亲缘关系鉴定的主要方法。有关人的亲子鉴定、个体认定已经形成了一套稳定的STR检测方法，而动物的此类相关研究相对滞后，可利用的STR位点较少。

马的许多特性都是高度遗传的，马主们认为马的后代的特质很大程度上与其父母相关，所以马的谱系对于很多马主和购马者而言是十分重要的。目前对马进行亲子鉴定的试剂盒大多数是以美国ABI公司生产的选取VHL20、HTG4、AHT4、HMS7、HTG6、HMS6、AHT5、ASB2、HTG7、HMS3、HMS2共11个STR位点的试剂盒，该试剂盒由于检测位点较少可能会有无法推测亲子关系的情况，此时便需要额外增加检测到17对或22对STR位点，目前国内还没有此种类型的马亲子鉴定试剂盒，鉴于此，特提出本发明。

发明内容

针对上述领域的不足，本发明提供一种马短串联重复序列的复合扩增体系及检测试剂盒，本复合扩增体系及试剂盒包含16个STR位点及1个性别位点，可应用于马的群体遗传学分析或亲子鉴定检测中。

本发明涉及马短串联重复序列的复合扩增体系，该复合扩增体系中包括16对引物，可同时扩增16个STR位点：HMS7、HMS2、HMS3、AHT4、VHL20、LEX33、UCDEQ425、LEX34、COR58、COR7、COR18、COR71、COR82、Chr20、Chr29、Chr3，所述引物分别为：

所述扩增HMS7的上游引物序列如SEQ ID NO1所示，

所述扩增HMS7的下游引物序列如SEQ ID NO2所示；

所述扩增HMS2的上游引物序列如SEQ ID NO3所示，

所述扩增HMS2的下游引物序列如SEQ ID NO4所示；

所述扩增HMS3的上游引物序列如SEQ ID NO5所示，

所述扩增HMS3的下游引物序列如SEQ ID NO6所示；

所述扩增AHT4的上游引物序列如SEQ ID NO7所示，

所述扩增AHT4的下游引物序列如SEQ ID NO8所示；

所述扩增VHL20的上游引物序列如SEQ ID NO9所示，

所述扩增VHL20的下游引物序列如SEQ ID NO10所示；

所述扩增LEX33的上游引物序列如SEQ ID NO11所示，

所述扩增LEX33的下游引物序列如SEQ ID NO12所示；

所述扩增UCDEQ425的上游引物序列如SEQ ID NO13所示，

所述扩增UCDEQ425的下游引物序列如SEQ ID NO14所示；