[发明专利]用于分析多能干细胞生物标志物的方法及其实施方式

说明书

本文公开了用于检测代谢改变的细胞的存在的体外方法。本文还公开了用于检测静止细胞存在的体外方法。本文公开了用于检测和预测癌症存在的体外方法。本文公开了用于监测对抗癌疗法的响应的体外方法。本公开内容分析用于检测或预测或监测癌症的多能干细胞的至少一种生物标志物的表达。本文公开了多能干细胞标志物的至少一种生物标志物的相关用途以及包括体外检测或预测方法的治疗方法。

发明领域

本公开内容广义上涉及多能干细胞生物标志物领域，并且具体地提供了通过使用血液样品中的多能干细胞生物标志物来检测和预测癌症的体外方法。

发明背景

癌症是全世界主要的健康问题，造成了数以百万计的死亡。据报道，全世界每年约有1100万人被诊断为携带肿瘤的患者，并且推测到2020年该数目将增加至超过1600万人(Ferlay等人，International journal of cancer136.5 E359-E386.2015)。这种疾病的生物异质性及其所困扰的巨大人群提出了何时进行治疗和谁将被治疗以及使用哪些疗法的关键问题。这些重要的问题只能通过开发更精确和更有信息的生物标志物来解决。

癌症的治疗很大程度上取决于疾病的诊断阶段。随着全球水平的技术改进，在最近几十年中治疗癌症的机会已经增加。检查点是疾病被检出的阶段。如果在晚期检测到癌症，则存在癌症无法治疗的某些情形。如果在非常早期的阶段诊断出癌症，则成功治疗的机会会增加。在这一方面，检测方法起着至关重要的作用，并且特定生物标志物的使用是活跃的研究领域。

癌症症状的非特定性质使得诊断是困难的。在某些情况下，患者保持渐近性的。因此，癌症的早期体征和症状常常被患者忽略，这为癌症在没有任何医学干预的情况下扩散提供了机会。到患者寻求医学帮助时，癌症可能超出了可用的临床治疗。此外，不能获得良好的生物标志物是癌症治疗的另一个障碍。

可以通过几种方式检测癌症，包括医学成像、组织活检和液体活检。一旦检测到可能的癌症，通常通过对来自组织活检的组织样品进行显微镜检查来诊断。当提到治疗结果和存活时，特别是当提到高度恶性肿瘤时，早期检测和诊断癌症是必要的。几十年来，用于检测人类癌症的唯一方法是通过手术取出肿瘤的一小部分，并用显微镜对其进行检查以寻找组织中的癌细胞。不幸的是，这种手术干预只能在肿瘤达到一定体积或开始成为功能性病症的原因时进行。由于该方法只能在存在临床症状时使用，因此不能被认为是癌症早期诊断的最佳方法，或者换句话说，不能作为在癌症的任何临床征象之前常规进行的筛查测验。因此，需要开发一种简单而又高度灵敏和特异的癌症检测系统和方法来克服上述问题和其它问题。

生物标志物不仅对于诊断目的是重要的，而且还具有很大的预后价值。通过鉴定正确的生物标志物，可以非常详细地评价癌症进展以及化疗药物的效果和成功。亟需鉴定用于不同癌症的可靠生物标志物，以及开发有效检测和预测癌症和/或代谢改变和/或静止细胞的方法。

发明概述

在本公开内容的一个方面，提供了用于检测代谢改变的细胞的存在的体外方法，所述方法包括：(a)获得血液样品；(b)从血液样品中富集多能干细胞，以获得包含所述多能干细胞的混合物；(c)从步骤(b)的混合物中获得核酸；(d)用所述核酸进行分析多能干细胞的至少一种生物标志物的表达水平的测定；以及(e)将所述样品中所述多能干细胞的至少一种生物标志物的表达水平与对照样品中所述至少一种生物标志物的表达水平进行比较，其中与所述对照样品中所述至少一种生物标志物的表达水平相比，所述样品中所述至少一种生物标志物的表达水平的增加检测出代谢改变的细胞的存在。