[发明专利]基于甲基化修饰的肿瘤标记物STAMP-EP7及其应用有效
申请号: | 201910363081.4 | 申请日: | 2019-04-30 |
公开(公告)号: | CN109988844B | 公开(公告)日: | 2022-10-04 |
发明(设计)人: | 李振艳;罗怀兵 | 申请(专利权)人: | 上海奕谱生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人: | 陈静 |
地址: | 200233 上海市徐汇*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 甲基化 修饰 肿瘤 标记 stamp ep7 及其 应用 | ||
1.检测分离的多核苷酸的CPC位点甲基化水平的试剂在制备检测肿瘤的试剂或试剂盒中的用途,所述多核苷酸选自(a)-(d):
(a) SEQ ID NO: 1所示核苷酸序列的多核苷酸;
(b) SEQ ID NO: 1中第281~309位、第282~308位、第1~389位或第418~970位所示的多核苷酸的片段;
(c) 与(a)的多核苷酸完全互补的多核苷酸,其核苷酸序列如SEQ ID NO: 3所示;
(d) 与(b)的多核苷酸片段完全互补的多核苷酸片段;
所述肿瘤为血液系统肿瘤,妇科及生殖系统肿瘤,消化系统肿瘤或呼吸系统肿瘤;其中,所述血液系统肿瘤为白血病,所述妇科及生殖系统肿瘤为乳腺癌,所述消化系统肿瘤为食管癌、直肠癌、肝癌或胰腺癌,所述呼吸系统肿瘤为肺癌。
2.如权利要求1所述的用途,其特征在于,所述检测分离的多核苷酸的CPC位点甲基化水平的试剂是引物或探针。
3. 如权利要求2所述的用途,其特征在于,所述引物是核苷酸序列如SEQ ID NO: 5和SEQ ID NO: 6所示的引物。
4. 如权利要求2所述的用途,其特征在于,所述引物是核苷酸序列如SEQ ID NO: 7和SEQ ID NO: 8所示的引物。
5. 如权利要求2所述的用途,其特征在于,所述引物是核苷酸序列如SEQ ID NO: 9和SEQ ID NO: 10所示的引物。
6.如权利要求1所述的用途,其特征在于,将选自(a)-(d)的多核苷酸进行转变使其修饰的CpG位点的胞嘧啶C不变,非修饰的胞嘧啶转为T或U;之后进行检测。
7. 如权利要求6所述的用途,其特征在于,将(a)的多核苷酸进行转变后,获得SEQ IDNO: 2所示核苷酸序列的多核苷酸。
8. 如权利要求6所述的用途,其特征在于,将(c)中的多核苷酸进行转变后,获得SEQID NO: 4所示核苷酸序列的多核苷酸。
9. 如权利要求1所述的用途,其特征在于,所述肿瘤的样本包括:石蜡包埋样本、血液样本、胸腔积液样本以及肺泡灌洗液样本、腹水及 灌洗液样本、胆汁样本、粪便样本、尿液样本、唾液样本、痰液样本、脑脊液样本、细胞涂片样本、宫颈刮片或刷片样本、组织及细胞活检样本。
10.一种制备检测肿瘤的试剂的方法,其特征在于,所述方法包括:提供选自(a)-(d)的分离的多核苷酸:
(a) SEQ ID NO: 1所示核苷酸序列的多核苷酸;
(b) SEQ ID NO: 1中第281~309位、第282~308位、第1~389位或第418~970位所示的多核苷酸的片段;
(c) 与(a)的多核苷酸完全互补的多核苷酸,其核苷酸序列如SEQ ID NO: 3所示;
(d) 与(b)的多核苷酸片段完全互补的多核苷酸片段;
所述肿瘤为血液系统肿瘤,妇科及生殖系统肿瘤,消化系统肿瘤或呼吸系统肿瘤;其中,所述血液系统肿瘤为白血病,所述妇科及生殖系统肿瘤为乳腺癌,所述消化系统肿瘤为食管癌、直肠癌、肝癌或胰腺癌,所述呼吸系统肿瘤为肺癌。
11.如权利要求10所述的方法,其特征在于,所述的试剂包括:引物或探针。
12. 如权利要求11所述的方法,其特征在于,所述引物是核苷酸序列如SEQ ID NO: 5和SEQ ID NO: 6所示的引物。
13. 如权利要求11所述的方法,其特征在于,所述引物是核苷酸序列如SEQ ID NO: 7和SEQ ID NO: 8所示的引物。
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