[发明专利]用于评价骨髓增殖性肿瘤相关基因突变的试剂盒

说明书

本发明可以简便地鉴定骨髓增殖性肿瘤相关基因突变的基因型。本发明包含：与JAK2中骨髓增殖性肿瘤相关基因突变进行特异性杂交的突变型探针；与CALR中骨髓增殖性肿瘤相关基因突变进行特异性杂交的突变型探针；以及与MPL中骨髓增殖性肿瘤相关基因突变进行特异性杂交的突变型探针。

技术领域

本发明涉及能够评价作为骨髓增殖性肿瘤诊断项目而有用的基因突变的探针组、包含该探针组的微阵列。

背景技术

骨髓增殖性肿瘤(MPN：Myeloproliferative neoplasms)是一种由于髓系细胞形成肿瘤而发病的疾病。MPN的特征在于髓系细胞(粒细胞、胚细胞、骨髓巨核细胞和肥大细胞等)的明显增殖。MPN包括慢性髓细胞性白血病(chronic myelogenous leukemia：CML)、慢性中性粒细胞白血病(chronic neutrophilic leukemia：CNL)、真性红细胞增多症或真性多血症(polycythemia vera：PV)、原发性骨髓纤维化(primary myelofibrosis：PMF)、原发性血小板增多症(essential thrombocythemia：ET)、慢性嗜酸性粒细胞白血病(chroniceosinophilic leukemia：CEL)、高嗜酸性粒细胞综合征(hypereosinophilic syndrome：HES)、肥大细胞增生症(mastocytosis)以及无法分类的骨髓增殖性肿瘤(myeloproliferative neoplasms，unclassifiable：MPN，U)。

对于MPN的诊断，如非专利文献1所述，是以临床参数、骨髓形态和基因突变数据为指标。对于费城染色体阴性患者，可以通过将这些数据结合起来进行诊断来诊断除CML以外的MPN。作为基因突变数据，具体可以使用三个基因即JAK2、CALR和MPL的相关突变信息，还可以追加使用ASXL1、EZH2、TET2、IDH1/IDH2、SRSF2和SF3B1的相关突变信息。尤其是JAK2、CALR和MPL，考虑到它们是MPN发病的分子基础，因此基因群中有无突变在MPN的确诊中是重要因素。

另外，非专利文献2公开了关于JAK2，在PV、ET和PMF中观察到大量JAK2V617F突变(第617位的缬氨酸置换突变为苯丙氨酸)，另外在少数PV中除了上述突变以外还观察到外显子12中的插入/缺失型突变。JAK2(Janus活化激酶2(Janus activating kinase 2))是编码控制促红细胞生成素受体信号的蛋白质的基因。

非专利文献2还公开了关于MPL，在PMF和ET中观察到MPLW515L/K突变PMF。MPL是编码血小板生成素受体的基因。

非专利文献2还公开了关于CALR，52碱基缺失的1型突变和5碱基插入的2型突变的频率最高，在ET和PMF中观察到这些突变。非专利文献2还公开了1型突变在PMF中频率更高，与ET中的向骨髓纤维化的转换有关。CALR是编码内质网分子伴侣之一钙网蛋白的基因。

而且，作为JAK2基因的突变分析方法，专利文献1公开了JAK2V617F位点特异性荧光标记探针。专利文献2公开了在JAK2V617F突变为阴性且显示出骨髓增殖性肿瘤的患者中发现的与JAK2V617F突变不同的突变的检测技术。

再另外，作为用于检测MPL基因多态性的探针，专利文献3公开了用于检测MPL中的W515K突变和W515L突变的探针组。

再另外，专利文献4公开了用于鉴定CALR中的突变的技术。

现有技术文献

专利文献

专利文献1：日本特开2012-034580

专利文献2：国际公布WO2009/060804

专利文献3：国际公布WO2011/052755