[发明专利]检测染色体畸变的方法有效

专利信息
申请号: 201810147310.4 申请日: 2016-06-23
公开(公告)号: CN108467884B 公开(公告)日: 2023-01-17
发明(设计)人: 皮尔·马格拉夫-罗加拉;斯文·豪克 申请(专利权)人: 兹托视觉有限公司
主分类号: C12Q1/6841 分类号: C12Q1/6841
代理公司: 青岛联智专利商标事务所有限公司 37101 代理人: 邵新华;迟承柏
地址: 德国不*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 检测 染色体 畸变 方法
【权利要求书】:

1.至少四个彼此不同的位点特异性杂交探针在制备用于通过原位杂交,通过检测生物样品中的染色体区域和/或DNA区域而检测其中基因ALK和ROS1受影响的染色体倒位和/或易位的诊断剂中的用途,其中所述原位杂交以间期原位杂交形式进行,其中

(a)标记有检测标记A的第一位点特异性杂交探针和标记有检测标记B的第二位点特异性杂交探针位于第一染色体片段的远端和近端侧面,并在通过原位杂交生成的信号图像中产生融合信号A-B,

(b)标记有检测标记A的第三位点特异性杂交探针和标记有检测标记B的第四位点特异性杂交探针位于第二染色体片段的远端和近端侧面,并在通过原位杂交生成的信号图像中产生融合信号A-B,且

(c)所述第三位点特异性杂交探针和/或所述第四位点特异性杂交探针标记有另外的检测标记X1,并在通过原位杂交生成的信号图像中产生融合信号和混合信号A-B/X1,

其中所述另外的检测标记X1不同于所述检测标记A和B,和

其中所述杂交探针由所述检测标记直接标记,所述检测标记是荧光染料并且与探针中的核酸或核酸片段偶联,

其中混合信号是由至少两个彼此不同并位于同一位点特异性杂交探针上的检测标记产生的信号;和

其中利用所述信号图像识别存在的染色体畸变,和/或将存在的染色体畸变分配至染色体区域和/或DNA区域。

2.根据权利要求1所述的用途,

其中使用至少六个不同的位点特异性杂交探针,其中在每种情况下,两个位点特异性杂交探针位于染色体片段的远端和近端侧面。

3.根据权利要求2所述的用途,其中

(a)标记有检测标记A的第一位点特异性杂交探针和标记有检测标记B的第二位点特异性杂交探针位于染色体片段的远端和近端侧面,并在通过原位杂交生成的信号图像中产生融合信号A-B,

(b)2至12个另外的位点特异性杂交探针位于多达六个另外的染色体片段的远端和近端侧面,其中另外,在每种情况下,

位于染色体片段的远端和近端侧面的两个位点特异性杂交探针中的一个标记有检测标记A,且在每种情况下,位于染色体片段的远端和近端侧面的两个位点特异性杂交探针中的一个标记有检测标记B,使得在每种情况下,位于染色体片段的远端和近端侧面的所述位点特异性杂交探针在通过原位杂交产生的信号图像中产生融合信号A-B,和

(c)至少一个所述位点特异性杂交探针标记有至少一个另外的检测标记X,使得标记有所述至少一个另外的检测标记X的位点特异性杂交探针在通过原位杂交产生的信号图像中产生融合信号和混合信号A-B/X,

其中,在通过原位杂交产生的信号图像中,染色体畸变处的融合信号和混合信号A-B/X变为混合信号A/X和/或B/X,和/或

其中,在通过原位杂交产生的信号图像中,染色体畸变处的融合信号A-B变为单个信号A和/或B,

使得使用通过原位杂交产生的信号图像,染色体畸变被分配至染色体区域和/或DNA区域和/或被分配至两个位点特异性杂交探针位于远端和近端侧面的染色体片段。

4.根据权利要求3所述的用途,其中多个所述位点特异性杂交探针标记有至少一个另外的检测标记X,使得标记有至少一个另外的检测标记的位点特异性杂交探针在通过原位杂交产生的信号图像中产生融合信号和混合信号A-B/X。

5.根据权利要求1-3中任一项所述的用途,

其中所述位点特异性杂交探针在每种情况下由覆盖待测染色体区域和/或DNA区域的单核酸片段形成。

6.根据权利要求1-3中任一项所述的用途,其中所述位点特异性杂交探针在每种情况下由覆盖待测染色体区域和/或DNA区域的多个核酸片段形成。

7.根据权利要求1-3中任一项所述的用途,

(i)其中杂交特异性探针的单个核酸片段仅用一个检测标记进行标记,和/或

(ii)其中杂交特异性探针的单个核酸片段用多个彼此不同的检测标记进行标记,

其中可能性(i)和(ii)的组合还产生混合信号。

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