[发明专利]白来航鸡红羽致因突变基因型的鉴定及专用标记

说明书

本发明公开了白来航鸡红羽致因突变及其标记与检测方法。本发明提供了检测白来航鸡基因组中红羽SNP位点的基因型的物质在鉴定待测白来航鸡与洛岛红公鸡的杂交后代羽毛颜色性状中的应用；红羽SNP位点为鸡基因组11号染色体正义链第18,288,303位。本发明的实验证明，本发明发现一个SNP位点，通过该SNP位点可以实现红羽致因突变基因型鉴定，利用该方法，成功鉴别白来航品系鸡红羽致因突变基因型。利用该鉴别方法，方便快捷，可以快速培育红羽致因突变纯合型新品系，从而应用到生产100%红羽表型的红羽粉壳蛋鸡新配套系培育，节省培育成本和时间，增加品种效益。

技术领域

本发明属于基因检测领域，尤其涉及白来航鸡红羽致因突变基因型的鉴定及专用标记。

背景技术

白来航鸡是世界上著名的蛋用型品种，广泛应用于新配套系的培育，在家禽育种工作中具有重大贡献。白来航蛋鸡全身羽毛为白色，属于显性白羽。前人研究表明，白来航鸡PMEL17 基因第10 外显子上的9 bp 插入突变是显性白羽性状形成的主要原因，所对应的等位基因为I（Kerje S, Sharma P U, Kim H, et al. The Dominant white, Dun andSmoky color variants in chicken are associated with insertion/deletionpolymorphisms in the PMEL17 gene.[J]. Genetics, 2004, 168(3):1507-1518.）。显性等位基因I 会抑制黑色素合成，因此，白来航鸡与其他有色羽鸡杂交时，显性白基因I会抑制其他色素基因表达，从而使携带该基因的个体全身羽毛呈现白色。

在生产上发现，白来航品系中部分鸡只与洛岛红等公鸡杂交时后代母鸡表现为红羽，推测此部分白来航鸡羽色基因存在突变，可以抑制显性白基因I的作用，当其与洛岛红等有色羽公鸡杂交时，后代母鸡有色羽基因得以显现，表现为红色。因此，定位该白来航群体中与红羽相关的致因突变位点，进而利用分子标记辅助选择技术对该突变位点基因型进行鉴定、筛选和纯化，通过建系扩群，培育出红羽致因突变纯合型的白来航新品系，用于培育满足市场需求的红羽新品种配套系是十分必要的。

鸡羽色受多基因调控，多个与红色羽色相关的基因或者突变已经被定位，影响真黑色素和褐黑色素相对分布的E扩展基因座编码的MC1R基因（melanocortin 1-receptor）第 33 位（C/Y）和第 244 位（L/P）的突变导致鸡全身一致的红-黄羽色（Takeuchi S，Suzuki H，Yabuuchi M，et al，Molecular cloning and sequence analysis of chickmelanocortin-1receptor gene[J].Biochim Biophys Acta，1996，1306（2-3）：122-126）。SOX10（SRY (sex determiningregion Y)-box 10）基因上游14 kb处8.3 kb的缺失可以导致鸡深褐色羽表型（Gunnarsson U, Kerje S, Bed'Hom B, et al. The Dark brownplumage color in chickens is caused by an 8.3-kb deletion upstream of SOX10.[J]. Pigment Cell & Melanoma Research, 2011, 24(2):268–274）。然而，这些突变位点均不能在北京市华都峪口禽业有限责任公司白来航品系中检测出来，说明该白来航群体存在其他突变位点与红羽相关。

白来航鸡携带与红羽相关的基因突变位点，但是并不表现出红羽表型，只能通过与洛岛红等有色羽公鸡杂交推测该母鸡是否携带红羽致因突变，而公鸡只能根据其全同胞母鸡的推测结果进行推测。这种传统方法不能准确区分红羽致因突变纯合型和杂合型个体。

发明内容

本发明的第一个目的是提供检测白来航鸡基因组中红羽致因突变基因型(红羽SNP位点的基因型)的物质的用途。