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[发明专利]基于网络表示学习的表型关联关系分析方法-CN201910501477.0在审
发明人：彭佳杰;惠薇薇;管姣姣;尚学群 -专利权人：西北工业大学
申请日： 2019-06-11 - 公布日： 2019-09-17 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于网络表示学习的表型关联关系分析方法，用于解决现有表型方法准确度差的技术问题。技术方案是以蛋白质交互网络为载体，将表型映射到网络中作为子网，向量化表示表型子网，并作为表型的特征向量，利用提取到的表型特征，计算表型特征之间的欧氏距离作为表型之间的相似度。该方法可以更好的挖掘出表型的特征，更全面的衡量表型之间的相似度，进行准确的表型关联关系分析。本发明使用蛋白质交互网络，将网络表示学习应用于表型研究，为网络的每一个表型子网生成特征向量来进行表型关联关系分析，提高了表型关联关系分析的能力。实验表明，本发明不仅能够很好的预测表型之间的关系，还可以为表型生成特征向量，表型方法准确度好。
表型关联关系分析特征向量网络表示子网蛋白质交互表型特征准确度相似度网络表型研究欧氏距离向量化预测表映射学习衡量挖掘应用

[发明专利]一种基于表型可视化的罕见病辅助推理的方法及系统-CN202111201884.3在审
发明人：李昊旻;杨建;段会龙;舒强;袁天明;陈理华;余岚;潘佳容;孙逸;韩铭玉 -专利权人：浙江大学
申请日： 2021-10-15 - 公布日： 2022-01-04 - 主分类号： G16H50/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于表型可视化的罕见病辅助推理的方法及系统，方法包括以下步骤：构建表型语义层级网络和罕见病表型特征网络；计算疾病的表型共现关系和表型特异性；将表型语义层级网络、表型共现关系和罕见病表型特征网络可视化为网络图；根据表型语义层级网络、罕见病的表型共现关系、罕见病表型特征网络，对采集到的患者的表型特征进行相似度计算，得到候选疾病；基于表型语义层级网络、罕见病的表型共现关系和候选疾病对于患者的表型信息进行优化，获得优化后的表型集合；利用可视化的罕见病表型特征网络对比展示候选疾病和优化后的表型集合，辅助医生对罕见病进行鉴别诊断。
一种基于表型可视化罕见辅助推理方法系统

[发明专利]疾病的快速辅助定位方法-CN201710092648.X有效
发明人：李其刚;赵科研;杨京忠 -专利权人：成都奇恩生物科技有限公司
申请日： 2017-02-21 - 公布日： 2021-10-26 - 主分类号： G16H50/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种疾病的快速辅助定位方法，其包括：接收患者描述的罹患疾病的所有表型，并采用接收的所有表型构建患者描述表型集；获取表型注释数据库中具有患者描述的表型的所有疾病；查找每种疾病所对应的表型，并采用每种疾病所对应的表型分别构建相关疾病表型集；计算患者描述表型集与每个相关疾病表型集的相似度；比较患者描述表型集与所有相关疾病表型集的相似度，相似度值越大，则患者罹患当前相似度对应疾病的概率越大。
疾病快速辅助定位方法

[发明专利]一种致病基因排序方法、装置、电子设备和介质-CN202211496085.8在审
发明人：吴蓉蓉;王建峰;陈梅;余蕾;方云倩;徐昕;许青青;陆奇;任子云 -专利权人：苏州超云生命智能产业研究院有限公司
申请日： 2022-11-28 - 公布日： 2022-12-30 - 主分类号： G16H70/60 文献下载
摘要：该方法包括：获取患者临床信息；对患者临床信息进行提取和标准化处理，确定各个初始标准表型，并对每个初始标准表型进行向量化处理，获得表型向量；基于每个初始标准表型对应的表型向量和每个预设标准表型对应的表型向量，确定表型相似度，并基于表型相似度和预设相似度阈值，确定各个目标标准表型；基于疾病与表型之间的关联关系和各个目标标准表型，确定各个目标疾病和每个目标疾病对应的目标标准表型数量；基于目标标准表型数量和初始标准表型数量
一种致病基因排序方法装置电子设备介质

[发明专利]一种植物表型无损采集系统及方法-CN202110171976.5在审
发明人：降雨强;苏航;陈凡;王瑜;薛如仙;秦亚强;韩荣成;黄璐 -专利权人：中国科学院遗传与发育生物学研究所;爱奥思贝动力技术（苏州）有限公司
申请日： 2021-02-07 - 公布日： 2022-08-16 - 主分类号： G01N21/25 文献下载
摘要：本发明属于植物表型采集技术领域，尤其涉及一种植物表型无损采集系统及方法。该植物表型无损采集系统包括升降机构、旋转机构、待测植物放置座、内部结构表型成像装置和控制装置，还包括外部性状表型成像装置和生理表型成像装置中的一种或两种。旋转机构与升降机构连接，升降机构能够带动旋转机构在竖直方向上移动，旋转机构包括水平旋转架，内部结构表型成像装置以及外部性状表型成像装置和生理表型成像装置中的一种或两种固定在水平旋转架上，形成成像区域。由此，利用该植物表型无损采集系统，不用移动待测植物就能够实现待测植物的内部结构表型、外部性状表型和/或生理表型的同一时间的采集，提高了待测植物表型采集的准确性。
一种植物表型无损采集系统方法

[发明专利]植物表型获取方法-CN202110196384.9在审
发明人：降雨强;王瑜;陈凡;薛如仙;秦亚强;黄璐;韩荣成;胡伟娟 -专利权人：中国科学院遗传与发育生物学研究所
申请日： 2021-02-07 - 公布日： 2022-08-16 - 主分类号： G01N21/25 文献下载
摘要：本发明属于植物研究技术领域，尤其涉及一种植物表型获取方法。其中，将植物静止放置，通过围绕植物移动内部结构表型成像装置以及外部性状表型成像装置和生理表型成像装置这两个中的一个或两个，来获取植物的内部结构表型图像以及外部性状表型图像和生理表型图像这两个中的一个或多个，如此，不用移动植物就能够实现植物活体的内部结构表型图像以及外部性状表型图像和生理表型图像这二者中的一个或两个的同一时间的原位采集，由此，从图像中继续获取的表型信息也是同时同位的，从而提高了植物表型获取的准确性，也提高了利用表型做研究的结果的准确性。
植物表型获取方法

[发明专利]患者病历数据的处理方法、装置、电子设备及存储介质-CN202310394048.4在审
发明人：刘力锋;尚文斌;韩德栋;张兴 -专利权人：北京大学
申请日： 2023-04-13 - 公布日： 2023-08-22 - 主分类号： G16H10/60 文献下载
摘要：本发明提供的一种患者病历数据的处理方法、装置、电子设备及存储介质，通过患者表示矩阵根据预先构建的表型矩阵和患者表示矩阵，得到表型概率矩阵；根据所述表型概率矩阵对所述表型矩阵进行采样，得到表型均值矩阵；根据所述表型均值矩阵和所述患者表示矩阵，得到表型标准差矩阵；根据所述表型均值矩阵和所述表型标准差矩阵构建表型分布矩阵；对所述表型分布矩阵进行采样，得到个性化聚类的患者表示矩阵。通过本发明能够将患者的表征聚类到不同的表型，从而告诉预测过程中最重要的表型。与一般的表示学习模型相比，本发明具有具有更强的表示学习能力，从而可以处理更加复杂且实时变化的患者健康状况。
患者病历数据处理方法装置电子设备存储介质

[发明专利]细胞表型图像定量分析的高通量功能基因筛选方法及系统-CN201910041846.2有效
发明人：薛宇;宁万山;郭亚萍 -专利权人：华中科技大学
申请日： 2019-01-17 - 公布日： 2021-02-05 - 主分类号： G06K9/00 文献下载
摘要：本发明公开了细胞表型图像定量分析的高通量功能基因筛选方法及系统，属于基因筛选技术领域。利用全自动荧光显微镜拍取得到有待筛选表型和无待筛选表型的细胞图像；分别转化成有待筛选表型和无待筛选表型的黑白二值图像；再分割成包含单个有待筛选表型细胞的图像和包含单个无待筛选表型细胞的图像；将包含单个有待筛选表型细胞的图像在有待筛选表型的细胞图像中对应的部分作为阳性训练集，将包含单个无待筛选表型细胞的图像在无待筛选表型的细胞图像中对应的部分作为阴性训练集，得到能识别细胞表型的最终模型；将待筛选基因敲除或者过表达细胞的图像经过最终模型识别，得到待筛选基因与表型的关联性。
细胞表型图像定量分析通量功能基因筛选方法系统

[发明专利]一种人类表型本体术语识别模型生成及识别方法和装置-CN202310944776.8在审
发明人：谢明哲;姜玥;栗海波 -专利权人：苏州赛福医学检验有限公司
申请日： 2023-07-31 - 公布日： 2023-10-24 - 主分类号： G06F16/33 文献下载
摘要：本发明公开了一种人类表型本体术语识别模型生成及识别方法和装置，应用于数据处理技术领域，包括：获取业务病例库，对业务病例库中每个病例进行分词处理，得到初始表型词汇；将初始表型词汇与医学术语数据库中的术语进行匹配，得到表型词库；基于表型词库和人类表型本体构建人类表型本体术语识别模型；其中，人类表型本体术语识别模型为识别所述表型词库中词汇与所述人类表型本体关联度的模型。与由人工对病例中的词汇进行选择，进而匹配人类表型本体的技术方案相比，本发明实现了对病例的智能分词处理，以及病例术语与人类表型本体智能地执行匹配处理，提高了匹配的准确性和匹配效率。
一种人类表型本体术语识别模型生成方法装置

[发明专利]电子病历表型抽取、表型名称规范化方法及系统-CN201811271476.3有效
发明人：江瑞;黄浩 -专利权人：清华大学
申请日： 2018-10-29 - 公布日： 2021-02-26 - 主分类号： G06F16/25 文献下载
摘要：本发明公开了一种电子病历表型抽取、表型名称规范化方法。该方法包括：表型抽取，将病历文本自然语句作为原始数据，采用Bi‑LSTM模型和CRF模型做命名实体识别，抽取出表型实体类；以及表型规范化，采用LSTM编码器对每个表型进行编码，计算病历中非标准表型的编码与标准表型编码的余弦相似度，将非标准表型映射到余弦相似度最高的表型。本发明还公开了一种电子病历表型抽取、表型名称规范化系统。本发明提高了电子病历中命名实体识别的准确率、召回正确率、以及对表型映射的准确率；免去了病历结构化过程中人工消耗，提高了病历结构化的效率；能更高效和准确地服务于医学数据挖掘、临床决策支持、临床风险评估等。
电子病历表型抽取名称规范化方法系统

[发明专利]用于疾病驱动因素的诊断和排序的表型谱相似性分析的方法和系统-CN202080094522.6在审
发明人：张贻谦;吴捷;N·迪米特洛瓦 -专利权人：皇家飞利浦有限公司
申请日： 2020-11-20 - 公布日： 2022-09-06 - 主分类号： G16B5/00 文献下载
摘要：一种用于表征个体的一个或多个基因或通路与疾病的相关性的方法(100)，包括：(i)获得(110)个体的表型谱，个体的表型谱包括表型特性以及差异基因和蛋白质表达信息；(ii)标识(120)与个体表型谱相似的经存储的表型谱的一个或多个数据库；(iii)至少部分地基于基因通路的已知疾病/表型关联与个体的表型谱之间的相似性，确定(130)基因通路与个体表型谱的相关性；(iv)至少部分地基于基因的已知疾病/表型关联与个体的表型谱之间的相似性，确定(140)基因与个体表型谱的相关性；以及(v)报告(150)与个体表型谱最相关的一个或多个基因通路和/或一个或多个基因。
用于疾病驱动因素诊断排序表型相似性分析方法系统

[发明专利]一种植物流水线表型采集平台及植物表型融合解析方法-CN202210971923.6有效
发明人：吴升;郭新宇;苟文博;王传宇;温维亮;樊江川;卢宪菊;郭小东;刘冠军 -专利权人：北京市农林科学院信息技术研究中心
申请日： 2022-08-15 - 公布日： 2022-11-29 - 主分类号： G06V10/762 文献下载
摘要：本发明提供一种植物流水线表型采集平台及植物表型融合解析方法，属于植物信息采集技术领域，采集平台包括：表型采集装置包括传动结构、成像箱体和植物载具，由传动结构带动植物载具进行切换，通过成像箱体内的传感器获取不同角度和不同光谱的植物样本图片；控制系统用于控制表型采集装置的信号通信和预设高通量植物表型数据的传送；数据采集系统采集不同类型的预设高通量植物表型数据。所述表型融合解析方法基于所述采集平台。本发明提出的植物流水线表型采集平台，用于作物表型自动化采集和生长过程连续检测，并采用表型数据自动化融合数据解析方法，有效解决了植物表型性状高通量采集解析问题。
一种植物流水线表型采集平台融合解析方法

[发明专利]基于双模式融合的水稻高通量表型组平台装置及使用方法-CN202310172365.1在审
发明人：杨万能;冯慧;宋鹏;黄成龙;段凌凤;翟瑞芳;刘建晓;叶军立;耿泽栋;李为坤;张俊;陈国兴;熊立仲 -专利权人：华中农业大学
申请日： 2023-02-27 - 公布日： 2023-05-30 - 主分类号： A01G7/06 文献下载
摘要：本发明涉及基于双模式融合的水稻高通量表型组平台装置及使用方法。该平台装置实现了盆栽水稻顶视角度下冠层表型和侧视角度下植株表型的高通量兼容检测。轨道式表型组采集模块可用于获取水稻盆栽顶视图像及表型参数，流水线式表型组采集模块与所述轨道式表型组采集模块相邻，可用于获取单盆水稻盆栽植株的侧视图像及表型参数，起升转运模块用于完成植株在轨道式表型组采集模块和流水线式表型组采集模块之间的转运本发明不仅可通过轨道式采集模式和流水线式采集模式对盆栽植株进行高通量表型参数获取，还实现了通过目标小区的定期检测和关键阈值判断来及时启动全自动采集模式，全面精确获取作物关键生长期表型参数，大幅提高了自动化效率
基于双模融合水稻通量表型平台装置使用方法

[发明专利]一种基于机器视觉的小麦育种材料表型性状快速采集方法-CN202210160105.8有效
发明人：臧贺藏;王猛;郑国清;李国强;赵晴;张杰;周萌 -专利权人：河南省农业科学院农业经济与信息研究所
申请日： 2022-02-22 - 公布日： 2023-04-07 - 主分类号： G06Q10/10 文献下载
摘要：本发明公开一种基于机器视觉的小麦育种材料表型性状快速采集方法，包括：建立小麦育种试验表型性状数据库，所述数据库用于存储各试验数据；设定小麦育种材料表型性状信息的取值范围；基于小麦育种试验表型性状数据库构建小麦育种材料表型性状信息采集系统；将各育种试验站点承担的试验任务分发到小麦育种材料表型性状信息采集系统的客户端，即采集终端；基于分发的试验任务，通过小麦育种材料表型性状信息采集系统快速采集小麦育种材料表型性状信息；将采集的小麦育种材料表型性状信息上传至小麦育种材料表型性状信息采集系统的服务器端进行备份本发明保证小麦育种试验表型性状数据采集的稳定性、完整性和真实性。
一种基于机器视觉小麦育种材料表型性状快速采集方法

[发明专利]高通量植物表型信息采集测量系统及方法-CN202310402492.6有效
发明人：韩志国;王春颖;张佳菲;赵洪兵 -专利权人：慧诺瑞德（北京）科技有限公司;型云科技（上海）有限公司
申请日： 2023-04-17 - 公布日： 2023-06-30 - 主分类号： G01B11/00 文献下载
摘要：本申请提供了一种高通量植物表型信息采集测量系统及方法，高通量植物表型信息采集测量系统包括：至少一个苗床，苗床用于放置多个容器，容器内盛放有植物；固定式表型信息采集测量装置，与苗床间隔设置，用于采集植物的表型信息；至少一个移动搬运装置，移动搬运装置用于搬运容器在苗床与固定式表型信息采集测量装置之间往复移动，以将植物从苗床搬运至固定式表型信息采集测量装置内进行表型信息采集，或者将植物从固定式表型信息采集测量装置搬运至苗床上进行存放本申请提供的高通量植物表型信息采集测量系统及方法简单方便，占用空间小，省时省力，可以高效快捷的实现高通量的植物表型信息采集工作，采集的表型信息效果好，准确性高。
通量植物表型信息采集测量系统方法

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