[发明专利]利用非编码RNA进行癌症筛选、治疗和预后的试剂盒

说明书

本发明提供一种利用非编码RNA进行癌症检测、治疗和预后的试剂盒。本发明提供的非编码RNA可以用于作为癌症的检测和预后的标记物，同时可以作为癌症治疗的靶标。

技术领域

本发明涉及分子生物学技术领域，特别涉及一种利用非编码RNA进行癌症检测、治疗和预后的试剂盒。

背景技术

随着基因组测序技术的迅速发展，人们发现70％的基因组序列被转录生成RNA，但其中只有不到2％的序列编码蛋白，其余被称为非编码RNA。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)指转录本长度大于200个核苷酸，不具备蛋白编码功能的一类RNA。以往人们认为，非编码RNA是“垃圾产物”，但最近研究发现，长链非编码RNA参与调控多项重要的生命过程，其中包括肿瘤的发生发展。长链非编码RNA具备一级序列信息，可通过碱基互补配对与核酸分子相互作用；同时也可形成二级结构与蛋白或核酸分子相互作用，甚至形成RNA-RNA-蛋白或RNA-DNA-蛋白多重复合体。长链非编码RNA来源广、数量大且二级结构灵活多变，因此作用机理也具有多样性，目前已知长链非编码RNA的作用方式总结起来至少有以下四种：信号分子、诱饵、向导和脚手架。

在过去几十年，人们在攻克癌症的道路上取得了巨大进步，但其依然是造成人类死亡的重要原因。长期以来肿瘤发生发展研究主要关注编码基因的作用，并取得一些进展。如对E-钙黏素(E-cadherin)的研究，E-钙黏素是依赖于Ca²⁺的跨膜蛋白，在上皮细胞中高表达，介导上皮细胞之间的紧密连接，该基因的下调能减小上皮细胞之间的粘附力，利于肿瘤细胞的恶性发展，这一点与恶性肿瘤样本中该基因的表达量低相吻合。类似E-钙黏素这样与肿瘤恶性程度相关的编码基因有很多，并且作用机理也已经被研究清楚，临床上针对这些基因所开发的靶向药物表现却不如人意。其中一部分原因可能在于这些基因并不是肿瘤恶性发展的关键，至少不是全部，了解它们的上游调控网络或许会有助于我们更好地理解肿瘤发生发展并进而开发出合适的药物。长链非编码RNA的主要功能是调控基因表达，因此关注长链非编码RNA在肿瘤发生发展过程的作用也显得刻不容缓。

近年来长链非编码RNA在肿瘤发生发展过程中的作用已有一些报道。长链非编码基因MALAT1(Metastasis-Associated Lung Adenocarcinoma Transcript1,MALAT1)，便是其中之一，MALAT1最初因在肺癌中高表达而受关注，随后其他研究组发现其在多种恶性肿瘤中均有异常表达，且高表达该lncRNA的患者预后差，生存期短。另一个大家熟知的长链非编码基因HOTAIR(HOX transcript antisense RNA,HOTAIR)，其表达水平在恶性乳腺癌样本中显著上调。在小鼠模型中，过表达该lncRNA的人源乳腺癌细胞系具有更强的肺转移能力。综合以上，以lncRNA为研究对象去研究肿瘤发生发展的过程，能够为癌症的诊断、治疗和预后提供新的思路。

发明内容

在一种实施方式中，本发明提供一种用于检测受试者中癌症存在的试剂盒，所述试剂盒中包括检测受试者的非编码RNA表达水平的试剂，其中所述非编码RNA是HGNC编号LINC00973的非编码RNA。

在一种实施方式中，所述检测受试者的非编码RNA表达水平的试剂是用于检测所述非编码RNA的转录本的试剂，所述非编码RNA的转录本由SEQ ID NO:2与SEQ ID NO:Y3连接形成的。

在一种实施方式中，非编码RNA在检测之前或期间转化成cDNA。

在一种实施方式中，所述检测受试者的非编码RNA表达水平的试剂是利用选自测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术和免疫测定的方法进行的试剂。然而，本发明不限于所采用的技术。在一些实施方案中，核酸扩增技术为聚合酶链式反应、逆转录聚合酶链式反应、转录介导的扩增、连接酶链式反应、链置换扩增或基于核酸序列的扩增。