[发明专利]肿瘤免疫治疗中微卫星不稳定状态分析体系在审
申请号: | 201710102499.0 | 申请日: | 2017-02-16 |
公开(公告)号: | CN106834479A | 公开(公告)日: | 2017-06-13 |
发明(设计)人: | 李强;张亚飞;朱爱思 | 申请(专利权)人: | 凯杰(苏州)转化医学研究有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 215123 江苏省苏州市工业*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肿瘤 免疫 治疗 卫星 不稳定 状态 分析 体系 | ||
1.作为用于肿瘤免疫治疗(PD-1/PD-L1)的辅助诊断标志物检测的微卫星不稳定状态分析体系,该体系所用的扩增引物组合能够同时扩增单核苷酸重复位点(NR-21、NR-24、BAT-25、BAT-26、MONO27)和五核苷酸重复位点(Penta C和Penta D),所述的每一个位点均由一对引物扩增,这7个扩增引物对分别为:
NR-21引物:
上游引物:GGAGTCGCTGGCACAGTTCTAT,
下游引物:CTTTCTGGTCACTCGCGTTTAC;
NR-24引物:
上游引物:CCCCATTGCTGAATTTTACCTC,
下游引物:GAGATTGTGCCATTGCATTCC;
BAT-25引物:
上游引物:CTCGCCTCCAAGAATGTAAGTG,
下游引物:GACATTCTGCATTTTAACTATGGCTC;
BAT-26引物:
上游引物:GAAATTGGATATTGCAGCAGTCAG,
下游引物:GCTCCTTTATAAGCTTCTTCAGTATATGTC;
MONO-27引物:
上游引物:GCAGGGAAATGGTGGGAACC,
下游引物:AGGGTGGATCAAATTTCACTTGG;
Penta C引物:
上游引物:GAGCTGGAGGTTGCATTCAG,
下游引物:TGAGCTACAATGGTTATCACCTG;
Penta D引物:
上游引物:GGAAGGTCGAAGCTGAAGTGAG,
下游引物:TTGCCTAACCTATGGTCATAACG。
2.根据权利要求1所述的扩增引物组合,所述扩增引物的扩增位点分别由三种不同的荧光染料标记,三组组合分别为:第一组:NR-21、BAT-25、MONO-27;第二组:NR-24、Penta C;第三组:BAT-26、Penta D。
3.根据权利要求1和2所述的扩增引物组合,三组组合分别标记JOE、TAM、FAM。
4.根据权利要求3所述的扩增引物标记,所述的第一组NR-21、BAT-25、MONO-27每个位点都标记JOE;所述的第二组NR-24、Penta C每个位点都标记TAM;所述的第三组BAT-26、Penta D每个位点都标记FAM。
5.根据权利要求4所述的扩增引物组合物,所述的每个位点的引物对中,上游引物的5′-OH末端标记荧光,下游引物不标记。
6.根据权利要求5所述的扩增体系,所述扩增体系的总体积为10μl,其中缓冲液1μl,MgCl20.4μl,dNTPs 0.8μl,10×引物混合物1.0μl,热启动Taq酶0.2μl,SSB 0.08μl,模板2μl,去离子水4.52μl。
7.根据权利要求6所述的扩增体系,10×引物混合物中的引物浓度分别为2μM的NR-21、2μM的NR-24、2μM的BAT-25、2μM的BAT-26、2μM的MONO-27、2μM的Penta C和2μM的Penta D。
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